EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXMAG00000022698 (Gene tree)
Gene ID: 102217893
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_maculatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11473 bases
Position: chr19:12831765-12843237
Accession: 102217893
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXMAP00000020721	SYF2	PF08231.12	7.2e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXMAT00000032202	-	5421	XM_005815481	ENSXMAP00000020721	238 (aa)	XP_005815538	M3ZZP6

Gene Model

Click here to download ENSXMAG00000022698's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
xma03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXMAG00000022698's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXMAG00000022698	syf2	91	80.556	ENSG00000117614	SYF2	88	80.930	Homo_sapiens
ENSXMAG00000022698	syf2	100	88.655	ENSAPOG00000001174	syf2	100	88.655	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXMAG00000022698	syf2	94	78.924	ENSAMEG00000010115	-	88	80.930	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXMAG00000022698	syf2	82	80.513	ENSAMEG00000010134	-	100	80.513	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXMAG00000022698	syf2	99	87.660	ENSACIG00000023688	syf2	94	87.660	Amphilophus_citrinellus
ENSXMAG00000022698	syf2	93	87.783	ENSAOCG00000010912	syf2	69	87.783	Amphiprion_ocellaris
ENSXMAG00000022698	syf2	100	88.655	ENSAOCG00000022046	syf2	100	88.235	Amphiprion_ocellaris
ENSXMAG00000022698	syf2	100	88.655	ENSAPEG00000018858	syf2	92	88.655	Amphiprion_percula
ENSXMAG00000022698	syf2	100	89.076	ENSATEG00000007745	syf2	100	89.076	Anabas_testudineus
ENSXMAG00000022698	syf2	84	82.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	82.000	Anas_platyrhynchos
ENSXMAG00000022698	syf2	70	68.862	ENSACAG00000026777	-	100	68.862	Anolis_carolinensis
ENSXMAG00000022698	syf2	86	82.353	ENSACAG00000013653	-	100	82.353	Anolis_carolinensis
ENSXMAG00000022698	syf2	91	81.019	ENSANAG00000032473	SYF2	88	81.395	Aotus_nancymaae
ENSXMAG00000022698	syf2	100	89.076	ENSACLG00000019916	syf2	100	89.076	Astatotilapia_calliptera
ENSXMAG00000022698	syf2	100	81.092	ENSAMXG00000004051	syf2	100	81.092	Astyanax_mexicanus
ENSXMAG00000022698	syf2	96	76.724	ENSBTAG00000001651	SYF2	91	80.930	Bos_taurus
ENSXMAG00000022698	syf2	87	52.381	WBGene00019402	syf-2	90	51.659	Caenorhabditis_elegans
ENSXMAG00000022698	syf2	91	81.019	ENSCJAG00000046570	SYF2	88	81.395	Callithrix_jacchus
ENSXMAG00000022698	syf2	88	76.555	ENSCAFG00000030331	-	92	76.555	Canis_familiaris
ENSXMAG00000022698	syf2	91	80.556	ENSCAFG00000012895	-	87	80.930	Canis_familiaris
ENSXMAG00000022698	syf2	76	71.429	ENSCAFG00020021094	-	95	71.429	Canis_lupus_dingo
ENSXMAG00000022698	syf2	91	80.556	ENSCAFG00020021091	-	87	80.930	Canis_lupus_dingo
ENSXMAG00000022698	syf2	99	74.583	ENSCHIG00000020874	SYF2	89	80.930	Capra_hircus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	73.251	ENSTSYG00000005114	SYF2	88	80.000	Carlito_syrichta
ENSXMAG00000022698	syf2	83	80.303	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	80.303	Cavia_aperea
ENSXMAG00000022698	syf2	92	80.275	ENSCPOG00000005326	SYF2	88	80.930	Cavia_porcellus
ENSXMAG00000022698	syf2	91	81.019	ENSCCAG00000022459	SYF2	88	81.395	Cebus_capucinus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	74.074	ENSCATG00000026917	SYF2	88	80.465	Cercocebus_atys
ENSXMAG00000022698	syf2	93	79.730	ENSCLAG00000008474	SYF2	88	81.860	Chinchilla_lanigera
ENSXMAG00000022698	syf2	92	79.358	ENSCSAG00000000948	SYF2	88	80.465	Chlorocebus_sabaeus
ENSXMAG00000022698	syf2	74	57.303	ENSCHOG00000005273	-	88	60.625	Choloepus_hoffmanni
ENSXMAG00000022698	syf2	94	81.778	ENSCPBG00000025073	SYF2	87	84.186	Chrysemys_picta_bellii
ENSXMAG00000022698	syf2	93	52.915	ENSCING00000003017	-	89	54.206	Ciona_intestinalis
ENSXMAG00000022698	syf2	89	50.000	ENSCSAVG00000006627	-	98	50.000	Ciona_savignyi
ENSXMAG00000022698	syf2	100	65.844	ENSCANG00000037322	SYF2	87	71.163	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	75.207	ENSCGRG00001020733	Syf2	89	81.395	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXMAG00000022698	syf2	82	81.122	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	80.905	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXMAG00000022698	syf2	92	86.697	ENSCSEG00000000117	syf2	99	83.544	Cynoglossus_semilaevis
ENSXMAG00000022698	syf2	100	92.887	ENSCVAG00000019543	syf2	100	92.887	Cyprinodon_variegatus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	81.513	ENSDARG00000004706	syf2	100	81.513	Danio_rerio
ENSXMAG00000022698	syf2	96	76.293	ENSDNOG00000047605	SYF2	88	80.465	Dasypus_novemcinctus
ENSXMAG00000022698	syf2	96	78.355	ENSDORG00000001274	Syf2	88	81.395	Dipodomys_ordii
ENSXMAG00000022698	syf2	92	54.751	FBgn0033556	CG12343	95	55.140	Drosophila_melanogaster
ENSXMAG00000022698	syf2	87	66.184	ENSETEG00000015729	SYF2	88	67.662	Echinops_telfairi
ENSXMAG00000022698	syf2	83	58.376	ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.376	Eptatretus_burgeri
ENSXMAG00000022698	syf2	100	74.694	ENSEASG00005004224	-	88	81.860	Equus_asinus_asinus
ENSXMAG00000022698	syf2	99	67.083	ENSEASG00005004232	-	89	72.093	Equus_asinus_asinus
ENSXMAG00000022698	syf2	96	77.155	ENSECAG00000010440	-	90	81.860	Equus_caballus
ENSXMAG00000022698	syf2	96	77.155	ENSECAG00000012023	-	88	81.395	Equus_caballus
ENSXMAG00000022698	syf2	74	63.333	ENSEEUG00000015084	SYF2	84	69.481	Erinaceus_europaeus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	82.353	ENSELUG00000003465	syf2	99	81.513	Esox_lucius
ENSXMAG00000022698	syf2	95	78.509	ENSFCAG00000043095	-	87	81.860	Felis_catus
ENSXMAG00000022698	syf2	92	80.734	ENSFCAG00000010324	-	74	81.860	Felis_catus
ENSXMAG00000022698	syf2	86	79.902	ENSFALG00000000460	SYF2	87	80.000	Ficedula_albicollis
ENSXMAG00000022698	syf2	92	79.817	ENSFDAG00000008310	SYF2	88	80.930	Fukomys_damarensis
ENSXMAG00000022698	syf2	95	79.204	ENSFHEG00000007238	syf2	99	77.119	Fundulus_heteroclitus
ENSXMAG00000022698	syf2	90	87.442	ENSGMOG00000019138	syf2	96	87.442	Gadus_morhua
ENSXMAG00000022698	syf2	93	80.631	ENSGALG00000013639	SYF2	85	82.791	Gallus_gallus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	95.798	ENSGAFG00000019435	syf2	100	95.798	Gambusia_affinis
ENSXMAG00000022698	syf2	93	89.189	ENSGACG00000007305	syf2	90	90.698	Gasterosteus_aculeatus
ENSXMAG00000022698	syf2	94	81.778	ENSGAGG00000010670	SYF2	87	84.186	Gopherus_agassizii
ENSXMAG00000022698	syf2	91	80.556	ENSGGOG00000012796	SYF2	88	80.930	Gorilla_gorilla
ENSXMAG00000022698	syf2	100	89.076	ENSHBUG00000020477	syf2	100	89.076	Haplochromis_burtoni
ENSXMAG00000022698	syf2	93	79.279	ENSHGLG00000014393	SYF2	88	81.395	Heterocephalus_glaber_female
ENSXMAG00000022698	syf2	93	69.820	ENSHGLG00000004304	-	89	72.093	Heterocephalus_glaber_female
ENSXMAG00000022698	syf2	93	79.279	ENSHGLG00100014722	SYF2	88	81.395	Heterocephalus_glaber_male
ENSXMAG00000022698	syf2	100	87.395	ENSHCOG00000012904	syf2	78	87.395	Hippocampus_comes
ENSXMAG00000022698	syf2	100	83.264	ENSIPUG00000019859	syf2	100	81.092	Ictalurus_punctatus
ENSXMAG00000022698	syf2	61	73.973	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	73.973	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXMAG00000022698	syf2	84	80.905	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	80.905	Jaculus_jaculus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	90.756	ENSKMAG00000013856	syf2	100	88.235	Kryptolebias_marmoratus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	89.496	ENSLBEG00000014425	syf2	100	89.496	Labrus_bergylta
ENSXMAG00000022698	syf2	97	78.355	ENSLACG00000012064	SYF2	97	78.355	Latimeria_chalumnae
ENSXMAG00000022698	syf2	100	83.613	ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.613	Lepisosteus_oculatus
ENSXMAG00000022698	syf2	77	52.717	ENSLAFG00000030814	-	100	52.717	Loxodonta_africana
ENSXMAG00000022698	syf2	100	73.878	ENSLAFG00000023150	-	88	80.930	Loxodonta_africana
ENSXMAG00000022698	syf2	100	74.074	ENSMFAG00000041831	SYF2	88	80.465	Macaca_fascicularis
ENSXMAG00000022698	syf2	91	80.093	ENSMMUG00000002968	SYF2	88	80.465	Macaca_mulatta
ENSXMAG00000022698	syf2	100	74.074	ENSMNEG00000030180	SYF2	88	80.465	Macaca_nemestrina
ENSXMAG00000022698	syf2	100	74.074	ENSMLEG00000030248	SYF2	88	80.465	Mandrillus_leucophaeus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	89.916	ENSMAMG00000010403	syf2	98	89.916	Mastacembelus_armatus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	89.076	ENSMZEG00005006429	syf2	100	89.076	Maylandia_zebra
ENSXMAG00000022698	syf2	84	81.910	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.910	Meleagris_gallopavo
ENSXMAG00000022698	syf2	100	76.033	ENSMAUG00000018974	Syf2	89	82.791	Mesocricetus_auratus
ENSXMAG00000022698	syf2	84	80.905	ENSMICG00000016191	SYF2	100	80.905	Microcebus_murinus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	75.620	ENSMOCG00000022938	Syf2	89	82.326	Microtus_ochrogaster
ENSXMAG00000022698	syf2	97	87.879	ENSMMOG00000002396	syf2	90	90.698	Mola_mola
ENSXMAG00000022698	syf2	93	76.339	ENSMODG00000013951	-	95	78.341	Monodelphis_domestica
ENSXMAG00000022698	syf2	100	87.552	ENSMALG00000010706	syf2	100	87.967	Monopterus_albus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	76.033	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	89	82.791	Mus_caroli
ENSXMAG00000022698	syf2	100	76.033	ENSMUSG00000028821	Syf2	89	82.791	Mus_musculus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	76.033	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	89	82.791	Mus_pahari
ENSXMAG00000022698	syf2	100	76.033	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	89	82.791	Mus_spretus
ENSXMAG00000022698	syf2	92	79.091	ENSMPUG00000015801	-	87	80.930	Mustela_putorius_furo
ENSXMAG00000022698	syf2	91	80.556	ENSMPUG00000015802	-	87	80.930	Mustela_putorius_furo
ENSXMAG00000022698	syf2	93	78.378	ENSMLUG00000001885	SYF2	88	80.465	Myotis_lucifugus
ENSXMAG00000022698	syf2	97	76.695	ENSNGAG00000007912	Syf2	87	80.930	Nannospalax_galili
ENSXMAG00000022698	syf2	100	78.512	ENSNBRG00000010720	syf2	99	78.512	Neolamprologus_brichardi
ENSXMAG00000022698	syf2	91	80.556	ENSNLEG00000035185	SYF2	88	80.930	Nomascus_leucogenys
ENSXMAG00000022698	syf2	100	73.663	ENSOPRG00000012870	SYF2	88	80.000	Ochotona_princeps
ENSXMAG00000022698	syf2	100	65.984	ENSODEG00000014338	-	89	70.698	Octodon_degus
ENSXMAG00000022698	syf2	93	77.928	ENSODEG00000017664	-	90	80.000	Octodon_degus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	88.235	ENSONIG00000008213	syf2	100	88.235	Oreochromis_niloticus
ENSXMAG00000022698	syf2	85	80.693	ENSOANG00000009552	SYF2	100	80.693	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXMAG00000022698	syf2	91	81.019	ENSOCUG00000013050	SYF2	88	81.395	Oryctolagus_cuniculus
ENSXMAG00000022698	syf2	97	89.130	ENSORLG00000028820	syf2	92	92.558	Oryzias_latipes
ENSXMAG00000022698	syf2	100	87.395	ENSORLG00020018333	syf2	100	87.395	Oryzias_latipes_hni
ENSXMAG00000022698	syf2	100	87.815	ENSORLG00015014665	syf2	100	87.815	Oryzias_latipes_hsok
ENSXMAG00000022698	syf2	100	87.395	ENSOMEG00000013911	syf2	100	87.395	Oryzias_melastigma
ENSXMAG00000022698	syf2	93	79.730	ENSOGAG00000009962	SYF2	88	81.860	Otolemur_garnettii
ENSXMAG00000022698	syf2	96	75.641	ENSOARG00000006348	-	88	80.184	Ovis_aries
ENSXMAG00000022698	syf2	82	54.872	ENSOARG00000006269	-	100	54.872	Ovis_aries
ENSXMAG00000022698	syf2	91	80.556	ENSPPAG00000036579	SYF2	88	80.930	Pan_paniscus
ENSXMAG00000022698	syf2	92	80.734	ENSPPRG00000001638	-	87	81.860	Panthera_pardus
ENSXMAG00000022698	syf2	95	78.509	ENSPPRG00000001651	-	87	81.860	Panthera_pardus
ENSXMAG00000022698	syf2	95	78.509	ENSPTIG00000007036	-	87	81.860	Panthera_tigris_altaica
ENSXMAG00000022698	syf2	91	81.481	ENSPTIG00000005711	-	78	81.860	Panthera_tigris_altaica
ENSXMAG00000022698	syf2	91	80.556	ENSPTRG00000000352	SYF2	88	80.930	Pan_troglodytes
ENSXMAG00000022698	syf2	100	74.074	ENSPANG00000008139	SYF2	88	80.465	Papio_anubis
ENSXMAG00000022698	syf2	100	79.832	ENSPKIG00000008130	syf2	91	85.116	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXMAG00000022698	syf2	99	77.178	ENSPSIG00000011816	SYF2	84	82.791	Pelodiscus_sinensis
ENSXMAG00000022698	syf2	93	88.235	ENSPMGG00000008755	syf2	84	89.302	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	75.207	ENSPEMG00000008283	Syf2	89	81.860	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXMAG00000022698	syf2	93	80.180	ENSPCIG00000014235	SYF2	86	82.326	Phascolarctos_cinereus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	93.724	ENSPFOG00000004116	syf2	99	93.724	Poecilia_formosa
ENSXMAG00000022698	syf2	98	94.850	ENSPLAG00000006691	syf2	99	95.259	Poecilia_latipinna
ENSXMAG00000022698	syf2	100	92.437	ENSPMEG00000011684	syf2	100	92.437	Poecilia_mexicana
ENSXMAG00000022698	syf2	100	95.798	ENSPREG00000003009	syf2	100	95.798	Poecilia_reticulata
ENSXMAG00000022698	syf2	92	79.817	ENSPPYG00000001713	SYF2	88	80.930	Pongo_abelii
ENSXMAG00000022698	syf2	93	54.054	ENSPCOG00000027011	SYF2	83	54.884	Propithecus_coquereli
ENSXMAG00000022698	syf2	93	71.171	ENSPVAG00000005841	SYF2	88	72.093	Pteropus_vampyrus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	88.655	ENSPNYG00000004979	syf2	100	88.655	Pundamilia_nyererei
ENSXMAG00000022698	syf2	100	82.353	ENSPNAG00000015570	syf2	100	82.353	Pygocentrus_nattereri
ENSXMAG00000022698	syf2	100	76.033	ENSRNOG00000060597	Syf2	89	82.791	Rattus_norvegicus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	72.016	ENSRBIG00000042970	SYF2	88	78.140	Rhinopithecus_bieti
ENSXMAG00000022698	syf2	100	74.074	ENSRROG00000001347	SYF2	88	80.465	Rhinopithecus_roxellana
ENSXMAG00000022698	syf2	91	80.556	ENSSBOG00000020184	SYF2	88	80.930	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXMAG00000022698	syf2	93	78.829	ENSSHAG00000015630	-	86	80.930	Sarcophilus_harrisii
ENSXMAG00000022698	syf2	86	80.583	ENSSHAG00000007152	-	100	80.583	Sarcophilus_harrisii
ENSXMAG00000022698	syf2	99	81.013	ENSSFOG00015023647	syf2	91	86.047	Scleropages_formosus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	86.134	ENSSMAG00000009867	syf2	100	86.134	Scophthalmus_maximus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	87.815	ENSSDUG00000013072	syf2	100	87.815	Seriola_dumerili
ENSXMAG00000022698	syf2	100	87.815	ENSSLDG00000012677	syf2	100	87.815	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXMAG00000022698	syf2	99	58.091	ENSSARG00000012889	SYF2	88	62.326	Sorex_araneus
ENSXMAG00000022698	syf2	93	82.883	ENSSPUG00000005251	SYF2	85	85.116	Sphenodon_punctatus
ENSXMAG00000022698	syf2	100	89.496	ENSSPAG00000009626	syf2	100	89.496	Stegastes_partitus
ENSXMAG00000022698	syf2	93	79.186	ENSSSCG00000037481	SYF2	88	80.930	Sus_scrofa
ENSXMAG00000022698	syf2	63	52.318	ENSTGUG00000001126	SYF2	77	55.414	Taeniopygia_guttata
ENSXMAG00000022698	syf2	100	82.917	ENSTRUG00000001499	syf2	91	82.917	Takifugu_rubripes
ENSXMAG00000022698	syf2	93	86.486	ENSTNIG00000016912	syf2	96	87.907	Tetraodon_nigroviridis
ENSXMAG00000022698	syf2	100	55.967	ENSTBEG00000017370	SYF2	86	60.465	Tupaia_belangeri
ENSXMAG00000022698	syf2	91	80.556	ENSTTRG00000003550	SYF2	88	80.930	Tursiops_truncatus
ENSXMAG00000022698	syf2	94	79.372	ENSUAMG00000002897	SYF2	87	80.930	Ursus_americanus
ENSXMAG00000022698	syf2	91	80.556	ENSUMAG00000013108	SYF2	87	80.930	Ursus_maritimus
ENSXMAG00000022698	syf2	93	78.378	ENSVPAG00000005705	SYF2	88	80.465	Vicugna_pacos
ENSXMAG00000022698	syf2	86	80.000	ENSVVUG00000027181	-	87	80.000	Vulpes_vulpes
ENSXMAG00000022698	syf2	91	80.556	ENSVVUG00000027175	-	87	80.930	Vulpes_vulpes
ENSXMAG00000022698	syf2	97	74.678	ENSXETG00000022797	syf2	86	78.605	Xenopus_tropicalis