EuRBPDB

Description

RBDs

RBPome

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Gene Ontology

Description

Ensembl ID: FBgn0262739 (Gene tree)
Gene ID: 36544
Gene Symbol: AGO1
Alias: -
Full Name: Argonaute-1
Gene Type: protein_coding
Species: Drosophila_melanogaster
Status: confidence
Strand: Minus strand
Length: 14703 bases
Position: chr2R:13943387-13958089
Accession: FBgn0262739
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
FBpp0086740	PAZ	PF02170.22	1.2e-25	1	1
FBpp0086738	PAZ	PF02170.22	1.3e-25	1	1
FBpp0086739	PAZ	PF02170.22	1.3e-25	1	1
FBpp0294043	PAZ	PF02170.22	1.3e-25	1	1
FBpp0086740	Piwi	PF02171.17	1.1e-114	1	1
FBpp0086738	Piwi	PF02171.17	1.2e-114	1	1
FBpp0086739	Piwi	PF02171.17	1.2e-114	1	1
FBpp0294043	Piwi	PF02171.17	1.2e-114	1	1

RNA binding proteome (RBPome)

PID	Title	Method	Time	Author	Doi
27197210	The mRNA-bound proteome of the early fly embryo	IC & embryos	2016 Apr 28	Wessels HH	DOI: 10.1101/gr.200386.115

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
FBtr0087613	-	3481	-	FBpp0086739	984 (aa)	-	Q32KD4
FBtr0305592	-	7888	-	FBpp0294043	984 (aa)	-	Q27IR0
FBtr0087614	-	5738	-	FBpp0086740	950 (aa)	-	Q7KY08
FBtr0087612	-	7528	-	FBpp0086738	984 (aa)	-	Q32KD4

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
FBgn0262739	AGO1	84	32.360	FBgn0087035	AGO2	95	32.873

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSG00000123908	AGO2	99	73.533	Homo_sapiens
FBgn0262739	AGO1	90	74.356	ENSAPOG00000017586	ago2	98	72.976	Acanthochromis_polyacanthus
FBgn0262739	AGO1	90	74.269	ENSAMEG00000005019	AGO2	100	73.112	Ailuropoda_melanoleuca
FBgn0262739	AGO1	75	77.356	ENSACIG00000001179	ago2	96	77.356	Amphilophus_citrinellus
FBgn0262739	AGO1	90	74.824	ENSAOCG00000015307	ago2	98	73.432	Amphiprion_ocellaris
FBgn0262739	AGO1	90	74.824	ENSAPEG00000018425	ago2	98	73.432	Amphiprion_percula
FBgn0262739	AGO1	92	73.204	ENSATEG00000000529	ago2	98	73.204	Anabas_testudineus
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSAPLG00000010465	AGO2	98	74.443	Anas_platyrhynchos
FBgn0262739	AGO1	93	72.624	ENSACAG00000000167	AGO2	99	72.511	Anolis_carolinensis
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSANAG00000027399	AGO2	99	73.563	Aotus_nancymaae
FBgn0262739	AGO1	74	78.063	ENSACLG00000024684	ago2	98	78.063	Astatotilapia_calliptera
FBgn0262739	AGO1	93	72.881	ENSAMXG00000014587	ago2	99	73.678	Astyanax_mexicanus
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSBTAG00000001579	AGO2	99	73.563	Bos_taurus
FBgn0262739	AGO1	94	67.624	WBGene00000106	alg-2	98	68.386	Caenorhabditis_elegans
FBgn0262739	AGO1	90	69.875	WBGene00000105	alg-1	87	69.875	Caenorhabditis_elegans
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSCJAG00000004132	AGO2	99	73.563	Callithrix_jacchus
FBgn0262739	AGO1	87	75.333	ENSCAFG00000001196	AGO2	99	75.333	Canis_familiaris
FBgn0262739	AGO1	94	71.875	ENSCAFG00020014198	AGO2	99	73.341	Canis_lupus_dingo
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSCHIG00000010156	AGO2	99	73.563	Capra_hircus
FBgn0262739	AGO1	90	74.560	ENSTSYG00000007281	AGO2	97	74.560	Carlito_syrichta
FBgn0262739	AGO1	90	62.194	ENSCAPG00000013707	AGO2	97	62.194	Cavia_aperea
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSCPOG00000010428	AGO2	98	74.443	Cavia_porcellus
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSCCAG00000035031	AGO2	99	73.540	Cebus_capucinus
FBgn0262739	AGO1	90	72.450	ENSCATG00000038820	AGO2	99	72.450	Cercocebus_atys
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSCLAG00000001381	AGO2	98	74.443	Chinchilla_lanigera
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSCSAG00000009574	AGO2	95	73.059	Chlorocebus_sabaeus
FBgn0262739	AGO1	74	66.437	ENSCHOG00000008938	-	84	66.437	Choloepus_hoffmanni
FBgn0262739	AGO1	90	74.239	ENSCPBG00000019183	AGO2	99	72.511	Chrysemys_picta_bellii
FBgn0262739	AGO1	91	69.580	ENSCING00000007310	-	99	69.580	Ciona_intestinalis
FBgn0262739	AGO1	90	71.478	ENSCSAVG00000005282	-	99	77.976	Ciona_savignyi
FBgn0262739	AGO1	90	71.948	ENSCANG00000030899	AGO2	98	71.948	Colobus_angolensis_palliatus
FBgn0262739	AGO1	91	73.563	ENSCGRG00001013557	Ago2	99	73.563	Cricetulus_griseus_chok1gshd
FBgn0262739	AGO1	91	73.618	ENSCGRG00000002120	Ago2	100	73.618	Cricetulus_griseus_crigri
FBgn0262739	AGO1	90	74.356	ENSCSEG00000012273	ago2	96	75.336	Cynoglossus_semilaevis
FBgn0262739	AGO1	90	74.473	ENSCVAG00000008763	ago2	100	74.380	Cyprinodon_variegatus
FBgn0262739	AGO1	92	72.964	ENSDARG00000061268	ago2	97	74.018	Danio_rerio
FBgn0262739	AGO1	85	73.945	ENSDNOG00000033433	AGO2	100	73.945	Dasypus_novemcinctus
FBgn0262739	AGO1	91	73.533	ENSDORG00000011242	Ago2	99	73.533	Dipodomys_ordii
FBgn0262739	AGO1	76	55.988	ENSEBUG00000014681	ago2	99	55.988	Eptatretus_burgeri
FBgn0262739	AGO1	86	76.707	ENSEBUG00000011986	-	99	76.707	Eptatretus_burgeri
FBgn0262739	AGO1	74	76.923	ENSEBUG00000008202	-	99	76.923	Eptatretus_burgeri
FBgn0262739	AGO1	75	79.718	ENSEBUG00000014654	ago2	100	79.718	Eptatretus_burgeri
FBgn0262739	AGO1	74	76.923	ENSEBUG00000006807	-	100	76.847	Eptatretus_burgeri
FBgn0262739	AGO1	87	75.333	ENSEASG00005021922	AGO2	99	75.333	Equus_asinus_asinus
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSECAG00000006078	AGO2	97	74.443	Equus_caballus
FBgn0262739	AGO1	59	86.667	ENSEEUG00000008564	-	64	86.667	Erinaceus_europaeus
FBgn0262739	AGO1	90	75.059	ENSELUG00000019378	ago2	96	75.059	Esox_lucius
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSFCAG00000002782	AGO2	98	74.443	Felis_catus
FBgn0262739	AGO1	90	74.356	ENSFALG00000002838	AGO2	97	74.356	Ficedula_albicollis
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSFDAG00000004759	AGO2	98	74.443	Fukomys_damarensis
FBgn0262739	AGO1	86	75.547	ENSFHEG00000016080	ago2	96	75.547	Fundulus_heteroclitus
FBgn0262739	AGO1	90	74.707	ENSGMOG00000013651	ago2	99	73.708	Gadus_morhua
FBgn0262739	AGO1	90	74.356	ENSGALG00000040957	AGO2	99	73.007	Gallus_gallus
FBgn0262739	AGO1	91	73.848	ENSGAFG00000018026	ago2	98	73.848	Gambusia_affinis
FBgn0262739	AGO1	90	74.590	ENSGACG00000006796	ago2	98	74.590	Gasterosteus_aculeatus
FBgn0262739	AGO1	90	74.239	ENSGAGG00000003914	AGO2	99	76.005	Gopherus_agassizii
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSGGOG00000011412	AGO2	98	74.443	Gorilla_gorilla
FBgn0262739	AGO1	90	74.941	ENSHBUG00000018515	ago2	98	78.063	Haplochromis_burtoni
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSHGLG00000005548	AGO2	98	74.443	Heterocephalus_glaber_female
FBgn0262739	AGO1	90	66.940	ENSHGLG00100000694	-	97	66.940	Heterocephalus_glaber_male
FBgn0262739	AGO1	90	74.209	ENSHGLG00100015994	-	98	74.209	Heterocephalus_glaber_male
FBgn0262739	AGO1	90	74.707	ENSHCOG00000006200	ago2	98	74.707	Hippocampus_comes
FBgn0262739	AGO1	91	74.048	ENSIPUG00000001018	ago2	99	74.048	Ictalurus_punctatus
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSSTOG00000008113	AGO2	98	74.443	Ictidomys_tridecemlineatus
FBgn0262739	AGO1	90	74.326	ENSJJAG00000018712	Ago2	100	73.016	Jaculus_jaculus
FBgn0262739	AGO1	90	74.590	ENSKMAG00000019999	ago2	98	74.590	Kryptolebias_marmoratus
FBgn0262739	AGO1	90	74.590	ENSLBEG00000005112	ago2	99	72.872	Labrus_bergylta
FBgn0262739	AGO1	91	68.223	ENSLACG00000001277	-	99	68.223	Latimeria_chalumnae
FBgn0262739	AGO1	94	72.360	ENSLOCG00000007766	ago2	98	73.958	Lepisosteus_oculatus
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSLAFG00000012905	AGO2	98	74.443	Loxodonta_africana
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSMFAG00000015384	AGO2	98	74.588	Macaca_fascicularis
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSMMUG00000008045	AGO2	99	72.562	Macaca_mulatta
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSMNEG00000019904	AGO2	98	74.588	Macaca_nemestrina
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSMLEG00000038874	AGO2	99	73.533	Mandrillus_leucophaeus
FBgn0262739	AGO1	90	74.707	ENSMAMG00000008662	ago2	99	73.536	Mastacembelus_armatus
FBgn0262739	AGO1	90	74.941	ENSMZEG00005008998	ago2	98	78.063	Maylandia_zebra
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSMGAG00000012942	AGO2	98	74.443	Meleagris_gallopavo
FBgn0262739	AGO1	81	79.954	ENSMAUG00000007785	Ago2	94	79.954	Mesocricetus_auratus
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSMICG00000004427	AGO2	99	73.280	Microcebus_murinus
FBgn0262739	AGO1	91	73.502	ENSMOCG00000000300	Ago2	100	73.502	Microtus_ochrogaster
FBgn0262739	AGO1	89	71.864	ENSMMOG00000020165	ago2	99	71.864	Mola_mola
FBgn0262739	AGO1	90	74.239	ENSMODG00000000748	AGO2	97	74.239	Monodelphis_domestica
FBgn0262739	AGO1	90	74.473	ENSMALG00000020610	ago2	99	73.310	Monopterus_albus
FBgn0262739	AGO1	91	73.594	MGP_CAROLIEiJ_G0019861	Ago2	99	73.594	Mus_caroli
FBgn0262739	AGO1	91	73.594	ENSMUSG00000036698	Ago2	99	73.594	Mus_musculus
FBgn0262739	AGO1	91	73.364	MGP_PahariEiJ_G0019867	Ago2	99	73.364	Mus_pahari
FBgn0262739	AGO1	90	73.751	MGP_SPRETEiJ_G0020759	Ago2	99	73.751	Mus_spretus
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSMPUG00000001930	AGO2	98	74.443	Mustela_putorius_furo
FBgn0262739	AGO1	61	67.354	ENSMLUG00000004552	-	100	67.354	Myotis_lucifugus
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSNGAG00000014556	Ago2	98	74.443	Nannospalax_galili
FBgn0262739	AGO1	90	74.941	ENSNBRG00000006100	ago2	98	73.793	Neolamprologus_brichardi
FBgn0262739	AGO1	90	70.340	ENSNLEG00000001461	AGO2	98	69.064	Nomascus_leucogenys
FBgn0262739	AGO1	70	84.324	ENSMEUG00000001395	AGO2	78	84.324	Notamacropus_eugenii
FBgn0262739	AGO1	84	74.483	ENSOPRG00000008795	-	93	74.483	Ochotona_princeps
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSODEG00000014145	AGO2	98	74.443	Octodon_degus
FBgn0262739	AGO1	90	74.941	ENSONIG00000010747	ago2	98	73.793	Oreochromis_niloticus
FBgn0262739	AGO1	90	74.326	ENSOANG00000007125	AGO2	97	74.326	Ornithorhynchus_anatinus
FBgn0262739	AGO1	90	72.802	ENSOCUG00000006066	AGO2	100	71.807	Oryctolagus_cuniculus
FBgn0262739	AGO1	90	74.473	ENSORLG00000004615	ago2	98	74.473	Oryzias_latipes
FBgn0262739	AGO1	90	74.473	ENSORLG00020003449	ago2	98	74.473	Oryzias_latipes_hni
FBgn0262739	AGO1	90	74.473	ENSORLG00015015319	ago2	98	74.473	Oryzias_latipes_hsok
FBgn0262739	AGO1	90	74.590	ENSOMEG00000017751	ago2	96	77.075	Oryzias_melastigma
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSOGAG00000007933	AGO2	100	73.418	Otolemur_garnettii
FBgn0262739	AGO1	90	73.068	ENSOARG00000003763	AGO2	100	72.216	Ovis_aries
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSPPAG00000037787	AGO2	98	74.443	Pan_paniscus
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSPPRG00000002594	AGO2	98	74.443	Panthera_pardus
FBgn0262739	AGO1	90	73.271	ENSPTIG00000007438	AGO2	97	73.271	Panthera_tigris_altaica
FBgn0262739	AGO1	90	74.443	ENSPTRG00000020622	AGO2	99	73.394	Pan_troglodytes
FBgn0262739	AGO1	90	72.098	ENSPANG00000005604	AGO2	98	72.098	Papio_anubis
FBgn0262739	AGO1	90	74.356	ENSPKIG00000001824	ago2	96	77.493	Paramormyrops_kingsleyae
FBgn0262739	AGO1	90	73.185	ENSPSIG00000004064	AGO2	97	73.185	Pelodiscus_sinensis
FBgn0262739	AGO1	91	73.533	ENSPEMG00000008137	Ago2	100	73.533	Peromyscus_maniculatus_bairdii
FBgn0262739	AGO1	90	74.239	ENSPCIG00000026513	AGO2	97	74.239	Phascolarctos_cinereus
FBgn0262739	AGO1	93	72.758	ENSPFOG00000005321	ago2	98	73.502	Poecilia_formosa
FBgn0262739	AGO1	93	72.758	ENSPLAG00000007911	ago2	98	73.502	Poecilia_latipinna
FBgn0262739	AGO1	93	72.758	ENSPMEG00000007977	ago2	98	73.502	Poecilia_mexicana
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FBgn0262739	AGO1	90	69.641	ENSPCAG00000002880	AGO2	99	69.641	Procavia_capensis
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