EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: MGP_BALBcJ_G0019803 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Rab15
Alias: 2310012G06Rik|AI840042
Full Name: RAB15%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_musculus_balbcj
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 24699 bases
Position: chr12:74466559-74491257
Accession: 1916865
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_BALBcJ_P0035091	MMR_HSR1	PF01926.23	8.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_BALBcJ_T0035091	-	2927	XM_006515367	MGP_BALBcJ_P0035091	212 (aa)	XP_006515430	D3YTZ8
MGP_BALBcJ_T0035092	-	797	-	-	- (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0035093	-	856	-	MGP_BALBcJ_P0035093	183 (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0035094	-	485	-	MGP_BALBcJ_P0035094	138 (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0035095	-	477	-	MGP_BALBcJ_P0035095	114 (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0035096	-	1079	-	-	- (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download MGP_BALBcJ_G0019803's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_BALBcJ_G0019803's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	75	32.927	MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	97	35.526
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	80	45.029	MGP_BALBcJ_G0019314	Rab37	79	45.029
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	83	43.182	MGP_BALBcJ_G0021255	Rab2b	81	45.860
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	92	32.663	MGP_BALBcJ_G0017287	Rab36	74	32.663
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	83	32.620	MGP_BALBcJ_G0030362	Rasl11a	76	32.620
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	75	31.707	MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	89	32.386
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	75	46.203	MGP_BALBcJ_G0028009	Rab2a	75	46.203
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	96	36.585	MGP_BALBcJ_G0035166	Rab6b	94	36.585
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	81	34.682	MGP_BALBcJ_G0015840	Rab23	72	34.682
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	74	31.646	MGP_BALBcJ_G0031461	Kras	89	32.353
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	82	44.000	MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	80	44.000
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	75	35.443	MGP_BALBcJ_G0023938	Rab31	81	35.443
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	81	30.994	MGP_BALBcJ_G0026935	Rab22a	88	30.994
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	89	46.032	MGP_BALBcJ_G0029950	Rab35	94	46.032
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	77	36.686	MGP_BALBcJ_G0036076	Rab9b	84	36.686
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	91	36.458	MGP_BALBcJ_G0032559	Rab6a	90	36.458
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	80	30.233	MGP_BALBcJ_G0029333	Rheb	90	30.233
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	81	33.520	MGP_BALBcJ_G0030984	Rab7	100	44.304
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	82	42.529	MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	86	42.529
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	71	30.380	MGP_BALBcJ_G0035143	Mras	79	31.176
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	95	35.784	MGP_BALBcJ_G0019109	Rab5c	89	35.784
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	77	35.870	MGP_BALBcJ_G0036230	Rab9	84	35.870
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	88	45.213	MGP_BALBcJ_G0023947	Rab12	72	43.396
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	75	43.125	MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	75	43.125
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	71	30.573	MGP_BALBcJ_G0029608	Rasl11b	63	30.573
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	77	35.928	MGP_BALBcJ_G0018708	Rab34	64	35.928
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	68	40.136	MGP_BALBcJ_G0035663	Rab33a	62	40.136
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	93	40.887	MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	91	46.763
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	78	50.909	MGP_BALBcJ_G0024659	Rab1b	82	50.909
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	78	50.909	MGP_BALBcJ_G0018005	Rab1a	80	50.909
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	83	36.932	MGP_BALBcJ_G0017816	Rab5b	82	36.932
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	75	40.881	MGP_BALBcJ_G0023849	Rab5a	74	40.881
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	79	43.452	MGP_BALBcJ_G0025624	Rab14	93	46.099
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	94	39.303	MGP_BALBcJ_G0027373	Rab25	94	39.303
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	79	44.706	MGP_BALBcJ_G0024094	Rab18	82	44.706
MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	97	31.884	MGP_BALBcJ_G0027170	Rab33b	86	31.884