EuRBPDB

Description

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_BALBcJ_P0041682	DEAD	PF00270.29	1.7e-49	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_BALBcJ_T0041682	-	4759	-	MGP_BALBcJ_P0041682	652 (aa)	-	Q3U741

Gene Model

Protein-Protein Interaction (PPI)

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	72	82.180	MGP_BALBcJ_G0019255	Ddx5	93	83.598
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	56	33.880	MGP_BALBcJ_G0026882	Ddx27	56	32.558
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	67	43.527	MGP_BALBcJ_G0035037	Ddx43	68	43.527
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	51	32.537	MGP_BALBcJ_G0022645	Eif4a2	90	32.537
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	53	30.556	MGP_BALBcJ_G0025506	Ddx31	54	31.579
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	56	37.903	MGP_BALBcJ_G0033678	Ddx49	91	39.521
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	53	35.277	MGP_BALBcJ_G0019421	Eif4a3	82	35.277
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	53	32.687	MGP_BALBcJ_G0030076	Ddx55	57	32.687
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	52	32.456	MGP_BALBcJ_G0016355	Ddx18	51	32.456
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	57	37.374	MGP_BALBcJ_G0031394	Ddx47	85	36.869
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	62	39.952	MGP_BALBcJ_G0020552	Ddx41	65	39.952
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	62	30.843	MGP_BALBcJ_G0018803	Ddx52	68	30.456
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	56	32.275	MGP_BALBcJ_G0034505	Ddx25	76	31.078
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	61	39.163	MGP_BALBcJ_G0020888	Ddx4	57	39.163
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	55	33.962	MGP_BALBcJ_G0017241	Ddx50	54	33.962
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	64	34.048	MGP_BALBcJ_G0016484	Ddx59	67	34.048
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	62	43.765	MGP_BALBcJ_G0016858	D1Pas1	73	39.535
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	60	39.110	MGP_BALBcJ_G0022270	Ddx23	51	39.110
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	56	33.151	MGP_BALBcJ_G0018486	Eif4a1	88	33.151
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	59	45.113	MGP_BALBcJ_G0035542	Ddx3x	73	40.039
MGP_BALBcJ_G0022044	Ddx17	51	30.556	MGP_BALBcJ_G0034048	Ddx28	66	30.556