EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: MGP_BALBcJ_G0023498 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Rab11b
Alias: A730055L17Rik|RAB11B|Rab11BGN
Full Name: RAB11B%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_musculus_balbcj
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 19283 bases
Position: chr17:32663933-32683215
Accession: 99425
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_BALBcJ_P0046862	MMR_HSR1	PF01926.23	5.2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_BALBcJ_T0046863	-	503	-	-	- (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0046862	-	5227	XM_011246326	MGP_BALBcJ_P0046862	218 (aa)	XP_006523950	P46638

Gene Model

Click here to download MGP_BALBcJ_G0023498's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_BALBcJ_G0023498's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	70	36.538	MGP_BALBcJ_G0018708	Rab34	60	36.538
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	72	40.491	MGP_BALBcJ_G0030984	Rab7	91	45.833
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	80	52.299	MGP_BALBcJ_G0025624	Rab14	97	54.110
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	76	48.193	MGP_BALBcJ_G0029950	Rab35	94	44.041
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	72	42.675	MGP_BALBcJ_G0026935	Rab22a	81	42.675
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	72	32.278	MGP_BALBcJ_G0035143	Mras	81	34.706
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	88	51.309	MGP_BALBcJ_G0021255	Rab2b	95	51.309
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	88	33.508	MGP_BALBcJ_G0015840	Rab23	80	33.508
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	72	36.943	MGP_BALBcJ_G0022206	Rabl2	69	36.943
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	78	55.556	MGP_BALBcJ_G0028009	Rab2a	81	55.556
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	74	47.205	MGP_BALBcJ_G0017816	Rab5b	75	47.205
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	92	49.254	MGP_BALBcJ_G0024659	Rab1b	98	49.254
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	72	38.217	MGP_BALBcJ_G0032559	Rab6a	75	38.217
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	78	39.773	MGP_BALBcJ_G0027170	Rab33b	76	39.773
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	77	40.476	MGP_BALBcJ_G0023938	Rab31	86	40.476
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	78	34.503	MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	94	35.519
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	77	41.040	MGP_BALBcJ_G0036076	Rab9b	86	41.040
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	72	36.306	MGP_BALBcJ_G0035166	Rab6b	75	36.306
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	78	32.941	MGP_BALBcJ_G0031461	Kras	93	34.066
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	75	34.146	MGP_BALBcJ_G0029333	Rheb	89	34.146
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	75	44.578	MGP_BALBcJ_G0019314	Rab37	77	44.578
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	94	46.602	MGP_BALBcJ_G0018005	Rab1a	98	46.602
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	71	37.013	MGP_BALBcJ_G0031568	Rasl2-9	70	37.013
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	65	30.986	MGP_BALBcJ_G0016460	Arl8a	72	30.986
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	94	93.171	MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	100	96.078
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	79	47.126	MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	82	47.126
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	70	36.129	MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	95	37.241
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	81	36.869	MGP_BALBcJ_G0036230	Rab9	88	36.869
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	74	47.531	MGP_BALBcJ_G0024094	Rab18	78	47.531
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	75	47.853	MGP_BALBcJ_G0019109	Rab5c	75	47.853
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	81	40.331	MGP_BALBcJ_G0035663	Rab33a	75	40.331
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	80	45.977	MGP_BALBcJ_G0023849	Rab5a	81	45.977
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	88	64.706	MGP_BALBcJ_G0027373	Rab25	96	64.706
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	80	44.000	MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	82	44.000
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	54	42.857	MGP_BALBcJ_G0017287	Rab36	75	33.333
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	55	31.746	MGP_BALBcJ_G0019643	Arl4a	60	31.746
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	79	42.197	MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	84	42.197
MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	76	41.916	MGP_BALBcJ_G0023947	Rab12	57	41.916