EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: MGP_BALBcJ_G0027661 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Nras
Alias: AV095280|N-ras
Full Name: neuroblastoma ras oncogene
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_musculus_balbcj
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9900 bases
Position: chr3:100759638-100769537
Accession: 97376
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_BALBcJ_P0062801	MMR_HSR1	PF01926.23	0.00011	1	1
MGP_BALBcJ_P0062800	MMR_HSR1	PF01926.23	0.00015	1	1
MGP_BALBcJ_P0062796	MMR_HSR1	PF01926.23	0.00017	1	1
MGP_BALBcJ_P0062798	MMR_HSR1	PF01926.23	0.00017	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_BALBcJ_T0062799	-	276	-	MGP_BALBcJ_P0062799	74 (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0062798	-	828	-	MGP_BALBcJ_P0062798	189 (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0062797	-	660	-	MGP_BALBcJ_P0062797	46 (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0062796	-	4416	XM_006501118	MGP_BALBcJ_P0062796	189 (aa)	XP_006501181	A0A0G2JE25
MGP_BALBcJ_T0062804	-	818	-	-	- (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0062803	-	1749	-	MGP_BALBcJ_P0062803	46 (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0062802	-	1920	-	MGP_BALBcJ_P0062802	189 (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0062801	-	629	-	MGP_BALBcJ_P0062801	150 (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0062800	-	802	-	MGP_BALBcJ_P0062800	183 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download MGP_BALBcJ_G0027661's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_BALBcJ_G0027661's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	98	31.544	MGP_BALBcJ_G0026935	Rab22a	85	31.928
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	97	31.293	MGP_BALBcJ_G0025624	Rab14	78	30.769
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	99	34.667	MGP_BALBcJ_G0023849	Rab5a	76	32.727
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	97	35.374	MGP_BALBcJ_G0028009	Rab2a	70	35.333
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	99	33.333	MGP_BALBcJ_G0017816	Rab5b	84	30.220
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	95	33.108	MGP_BALBcJ_G0030984	Rab7	73	33.113
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	94	31.757	MGP_BALBcJ_G0029608	Rasl11b	68	31.138
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	100	91.333	MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	99	86.170
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	96	39.041	MGP_BALBcJ_G0018005	Rab1a	80	38.415
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	96	36.054	MGP_BALBcJ_G0027170	Rab33b	73	32.738
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	95	33.784	MGP_BALBcJ_G0036076	Rab9b	76	32.026
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	98	37.333	MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	86	35.519
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	98	33.557	MGP_BALBcJ_G0032559	Rab6a	75	32.911
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	94	34.899	MGP_BALBcJ_G0030362	Rasl11a	69	33.929
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	100	94.667	MGP_BALBcJ_G0031461	Kras	100	87.895
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	96	37.671	MGP_BALBcJ_G0024659	Rab1b	81	37.805
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	99	33.333	MGP_BALBcJ_G0019109	Rab5c	83	30.000
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	97	32.000	MGP_BALBcJ_G0019104	Nkiras2	88	30.370
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	99	34.667	MGP_BALBcJ_G0023938	Rab31	89	32.778
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	96	32.653	MGP_BALBcJ_G0035663	Rab33a	85	30.198
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	97	35.526	MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	75	32.927
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	96	34.932	MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	84	34.503
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	99	33.333	MGP_BALBcJ_G0035166	Rab6b	75	32.911
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	97	36.054	MGP_BALBcJ_G0021255	Rab2b	73	35.211
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	95	33.793	MGP_BALBcJ_G0027373	Rab25	70	33.333
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	97	33.333	MGP_BALBcJ_G0020972	Nkiras1	82	31.013
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	99	31.544	MGP_BALBcJ_G0024094	Rab18	81	33.133
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	96	37.671	MGP_BALBcJ_G0029950	Rab35	76	37.419
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	97	30.405	MGP_BALBcJ_G0023947	Rab12	52	30.464
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	98	58.108	MGP_BALBcJ_G0035143	Mras	95	51.010
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	97	35.811	MGP_BALBcJ_G0019314	Rab37	72	34.810
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	97	37.415	MGP_BALBcJ_G0029333	Rheb	80	36.486
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	95	37.931	MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	81	34.921
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	95	37.241	MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	70	36.129
MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	95	35.862	MGP_BALBcJ_G0015840	Rab23	61	32.192