EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: MGP_BALBcJ_G0032499 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Rab30
Alias: 5033421K01Rik|AI323892|Rsb30
Full Name: RAB30%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_musculus_balbcj
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 86913 bases
Position: chr7:92596988-92683900
Accession: 1923235
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_BALBcJ_P0085020	MMR_HSR1	PF01926.23	2.4e-05	1	1
MGP_BALBcJ_P0085021	MMR_HSR1	PF01926.23	2.4e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_BALBcJ_T0085022	-	1304	-	MGP_BALBcJ_P0085022	175 (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0085020	-	2038	XM_006508293	MGP_BALBcJ_P0085020	203 (aa)	XP_006508356	Q923S9
MGP_BALBcJ_T0085021	-	1406	-	MGP_BALBcJ_P0085021	203 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download MGP_BALBcJ_G0032499's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_BALBcJ_G0032499's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	83	47.929	MGP_BALBcJ_G0024094	Rab18	82	47.929
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	90	42.391	MGP_BALBcJ_G0028009	Rab2a	87	42.391
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	78	48.447	MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	76	48.447
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	84	45.614	MGP_BALBcJ_G0021255	Rab2b	81	48.718
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	76	42.857	MGP_BALBcJ_G0023938	Rab31	79	42.857
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	88	38.043	MGP_BALBcJ_G0030984	Rab7	91	45.833
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	81	32.317	MGP_BALBcJ_G0031568	Rasl2-9	75	32.317
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	86	50.286	MGP_BALBcJ_G0029950	Rab35	86	50.286
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	88	47.778	MGP_BALBcJ_G0023947	Rab12	62	47.778
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	78	38.272	MGP_BALBcJ_G0017287	Rab36	61	38.272
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	79	41.615	MGP_BALBcJ_G0035166	Rab6b	77	41.615
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	87	33.146	MGP_BALBcJ_G0031461	Kras	93	33.146
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	80	42.331	MGP_BALBcJ_G0026935	Rab22a	84	42.331
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	77	35.625	MGP_BALBcJ_G0018708	Rab34	62	35.625
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	95	34.579	MGP_BALBcJ_G0036230	Rab9	97	34.579
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	80	48.466	MGP_BALBcJ_G0019314	Rab37	75	48.466
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	97	41.546	MGP_BALBcJ_G0027373	Rab25	96	41.546
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	83	42.857	MGP_BALBcJ_G0017816	Rab5b	78	42.857
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	83	42.012	MGP_BALBcJ_G0019109	Rab5c	78	42.012
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	86	42.529	MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	82	42.529
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	87	37.500	MGP_BALBcJ_G0015840	Rab23	74	37.500
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	81	51.176	MGP_BALBcJ_G0035663	Rab33a	72	51.176
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	97	37.981	MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	91	44.604
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	79	42.857	MGP_BALBcJ_G0032559	Rab6a	77	42.857
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	82	50.602	MGP_BALBcJ_G0018005	Rab1a	81	50.602
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	82	50.000	MGP_BALBcJ_G0024659	Rab1b	83	50.000
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	82	31.737	MGP_BALBcJ_G0029333	Rheb	88	31.737
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	89	40.556	MGP_BALBcJ_G0025624	Rab14	91	43.478
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	84	34.503	MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	96	34.932
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	84	42.197	MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	79	42.197
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	89	34.426	MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	94	34.426
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	86	43.678	MGP_BALBcJ_G0023849	Rab5a	81	43.678
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	81	33.735	MGP_BALBcJ_G0035143	Mras	79	33.735
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	79	34.756	MGP_BALBcJ_G0022206	Rabl2	70	34.756
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	81	47.059	MGP_BALBcJ_G0027170	Rab33b	74	47.059
MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	79	39.157	MGP_BALBcJ_G0036076	Rab9b	82	39.157