EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: MGP_BALBcJ_G0033197 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Hras
Alias: H-ras|Ha-ras|Harvey-ras|Hras-1|Hras1|Kras2|c-H-ras|c-Ha-ras|c-rasHa|ras
Full Name: Harvey rat sarcoma virus oncogene
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_musculus_balbcj
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4901 bases
Position: chr7:141920427-141925327
Accession: 96224
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_BALBcJ_P0087538	MMR_HSR1	PF01926.23	4.7e-05	1	1
MGP_BALBcJ_P0087541	MMR_HSR1	PF01926.23	4.7e-05	1	1
MGP_BALBcJ_P0087539	MMR_HSR1	PF01926.23	5.3e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_BALBcJ_T0087538	-	2828	XM_006536159	MGP_BALBcJ_P0087538	189 (aa)	XP_006536222	Q61411
MGP_BALBcJ_T0087539	-	2272	-	MGP_BALBcJ_P0087539	188 (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0087543	-	447	-	-	- (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0087542	-	845	-	-	- (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0087541	-	1199	-	MGP_BALBcJ_P0087541	189 (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0087540	-	1704	-	-	- (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0087544	-	1122	-	MGP_BALBcJ_P0087544	119 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download MGP_BALBcJ_G0033197's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_BALBcJ_G0033197's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	92	36.932	MGP_BALBcJ_G0019314	Rab37	74	35.976
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	84	31.138	MGP_BALBcJ_G0029608	Rasl11b	68	31.138
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	84	34.756	MGP_BALBcJ_G0036076	Rab9b	76	33.333
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	98	30.332	MGP_BALBcJ_G0015840	Rab23	61	31.507
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	87	35.882	MGP_BALBcJ_G0027170	Rab33b	74	35.882
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	94	33.702	MGP_BALBcJ_G0019109	Rab5c	81	33.702
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	98	30.151	MGP_BALBcJ_G0035166	Rab6b	95	30.151
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	85	37.654	MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	81	34.921
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	86	30.909	MGP_BALBcJ_G0026935	Rab22a	77	32.000
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	98	30.151	MGP_BALBcJ_G0032559	Rab6a	95	30.151
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	94	35.519	MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	78	34.503
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	85	32.121	MGP_BALBcJ_G0020972	Nkiras1	80	31.169
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	85	33.129	MGP_BALBcJ_G0023938	Rab31	77	32.450
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	96	30.808	MGP_BALBcJ_G0030984	Rab7	66	32.117
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	83	30.625	MGP_BALBcJ_G0017287	Rab36	55	30.201
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	84	36.478	MGP_BALBcJ_G0029333	Rheb	80	36.486
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	99	86.170	MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	100	91.333
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	85	33.333	MGP_BALBcJ_G0027373	Rab25	70	32.000
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	86	38.554	MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	78	38.554
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	94	31.667	MGP_BALBcJ_G0023849	Rab5a	82	31.667
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	81	36.774	MGP_BALBcJ_G0029950	Rab35	76	36.774
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	95	31.414	MGP_BALBcJ_G0024094	Rab18	96	31.313
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	87	56.886	MGP_BALBcJ_G0035143	Mras	95	50.761
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	99	86.772	MGP_BALBcJ_G0031461	Kras	99	86.772
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	86	32.121	MGP_BALBcJ_G0025624	Rab14	71	31.373
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	94	34.426	MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	89	34.426
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	97	31.683	MGP_BALBcJ_G0035663	Rab33a	85	31.683
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	85	35.802	MGP_BALBcJ_G0028009	Rab2a	70	35.333
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	93	35.028	MGP_BALBcJ_G0018005	Rab1a	84	35.028
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	85	35.185	MGP_BALBcJ_G0021255	Rab2b	73	35.211
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	89	32.386	MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	75	31.707
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	96	32.787	MGP_BALBcJ_G0017816	Rab5b	82	32.787
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	87	33.908	MGP_BALBcJ_G0030362	Rasl11a	72	33.908
MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	93	34.463	MGP_BALBcJ_G0024659	Rab1b	86	34.463