EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: MGP_BALBcJ_G0034916 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Rab11a
Alias: Rab11|Rab11A
Full Name: RAB11A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_musculus_balbcj
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 21676 bases
Position: chr9:61965911-61987586
Accession: 1858202
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_BALBcJ_P0092831	MMR_HSR1	PF01926.23	2.3e-07	1	1
MGP_BALBcJ_P0092832	MMR_HSR1	PF01926.23	2.5e-07	1	1
MGP_BALBcJ_P0092830	MMR_HSR1	PF01926.23	5.2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_BALBcJ_T0092831	-	462	-	MGP_BALBcJ_P0092831	153 (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0092830	-	651	-	MGP_BALBcJ_P0092830	216 (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0092826	-	726	-	MGP_BALBcJ_P0092826	86 (aa)	-	P62492
MGP_BALBcJ_T0092827	-	603	-	-	- (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0092833	-	695	-	-	- (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0092832	-	595	-	MGP_BALBcJ_P0092832	155 (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0092828	-	500	-	MGP_BALBcJ_P0092828	86 (aa)	-	-
MGP_BALBcJ_T0092829	-	397	-	-	- (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download MGP_BALBcJ_G0034916's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_BALBcJ_G0034916's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	76	31.667	MGP_BALBcJ_G0019152	Arl4d	58	31.667
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	89	43.885	MGP_BALBcJ_G0019314	Rab37	77	45.181
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	81	34.127	MGP_BALBcJ_G0031461	Kras	87	37.725
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	97	52.201	MGP_BALBcJ_G0024659	Rab1b	84	55.357
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	86	34.586	MGP_BALBcJ_G0029333	Rheb	89	32.927
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	90	40.426	MGP_BALBcJ_G0035663	Rab33a	74	39.665
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	89	42.143	MGP_BALBcJ_G0036076	Rab9b	86	41.040
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	88	49.630	MGP_BALBcJ_G0019109	Rab5c	90	41.262
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	91	46.763	MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	93	40.887
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	84	38.281	MGP_BALBcJ_G0032559	Rab6a	84	35.955
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	93	48.252	MGP_BALBcJ_G0024094	Rab18	78	47.531
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	81	34.921	MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	95	37.931
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	100	96.078	MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	94	93.171
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	92	34.752	MGP_BALBcJ_G0015840	Rab23	80	32.984
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	68	30.065	MGP_BALBcJ_G0016460	Arl8a	77	30.065
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	90	49.635	MGP_BALBcJ_G0029950	Rab35	99	42.512
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	100	50.000	MGP_BALBcJ_G0018005	Rab1a	85	52.299
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	94	35.780	MGP_BALBcJ_G0017287	Rab36	79	35.780
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	78	31.746	MGP_BALBcJ_G0019643	Arl4a	60	31.746
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	81	31.746	MGP_BALBcJ_G0035143	Mras	85	32.768
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	91	44.604	MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	97	37.981
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	91	56.835	MGP_BALBcJ_G0028009	Rab2a	81	54.971
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	74	30.303	MGP_BALBcJ_G0019505	Dnajc27	60	30.303
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	93	42.254	MGP_BALBcJ_G0023938	Rab31	86	41.071
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	90	43.796	MGP_BALBcJ_G0023947	Rab12	70	37.799
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	81	34.921	MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	85	37.654
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	90	43.066	MGP_BALBcJ_G0026935	Rab22a	81	42.038
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	93	41.379	MGP_BALBcJ_G0027170	Rab33b	85	37.799
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	88	35.821	MGP_BALBcJ_G0035166	Rab6b	77	35.404
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	91	56.115	MGP_BALBcJ_G0021255	Rab2b	95	51.366
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	95	70.748	MGP_BALBcJ_G0027373	Rab25	99	62.150
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	88	48.889	MGP_BALBcJ_G0017816	Rab5b	75	47.205
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	88	49.265	MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	82	46.857
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	94	36.607	MGP_BALBcJ_G0036230	Rab9	97	36.607
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	95	54.110	MGP_BALBcJ_G0025624	Rab14	97	54.422
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	88	31.293	MGP_BALBcJ_G0030362	Rasl11a	60	31.293
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	87	38.686	MGP_BALBcJ_G0030984	Rab7	91	45.833
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	79	39.669	MGP_BALBcJ_G0031568	Rasl2-9	70	36.364
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	88	48.148	MGP_BALBcJ_G0023849	Rab5a	91	41.951
MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	75	40.000	MGP_BALBcJ_G0022206	Rabl2	67	37.908