EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: MGP_BALBcJ_G0035831 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Rab39b
Alias: 6330580M05Rik|Rab39B
Full Name: RAB39B%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_musculus_balbcj
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6186 bases
Position: chrX:70645036-70651221
Accession: 1915040
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_BALBcJ_P0096732	MMR_HSR1	PF01926.23	3.8e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_BALBcJ_T0096732	-	3401	-	MGP_BALBcJ_P0096732	213 (aa)	-	Q8BHC1

Gene Model

Click here to download MGP_BALBcJ_G0035831's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_BALBcJ_G0035831's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	75	31.875	MGP_BALBcJ_G0022206	Rabl2	69	31.875
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	75	48.171	MGP_BALBcJ_G0035663	Rab33a	69	48.171
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	78	42.262	MGP_BALBcJ_G0023947	Rab12	57	42.262
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	78	38.554	MGP_BALBcJ_G0033197	Hras	86	38.554
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	82	36.410	MGP_BALBcJ_G0036230	Rab9	89	36.410
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	84	43.820	MGP_BALBcJ_G0018005	Rab1a	86	43.820
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	82	46.857	MGP_BALBcJ_G0034916	Rab11a	88	49.265
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	77	36.585	MGP_BALBcJ_G0019109	Rab5c	75	36.585
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	80	35.882	MGP_BALBcJ_G0017816	Rab5b	78	35.882
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	75	39.623	MGP_BALBcJ_G0032559	Rab6a	75	39.623
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	80	36.782	MGP_BALBcJ_G0035143	Mras	81	36.782
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	76	44.785	MGP_BALBcJ_G0019314	Rab37	75	44.785
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	98	43.868	MGP_BALBcJ_G0028009	Rab2a	94	45.545
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	81	39.884	MGP_BALBcJ_G0024094	Rab18	83	39.884
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	77	34.940	MGP_BALBcJ_G0017287	Rab36	62	34.940
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	77	46.707	MGP_BALBcJ_G0027170	Rab33b	72	46.707
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	78	36.747	MGP_BALBcJ_G0026935	Rab22a	85	36.747
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	77	38.922	MGP_BALBcJ_G0036076	Rab9b	82	38.922
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	73	36.306	MGP_BALBcJ_G0018708	Rab34	60	36.306
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	84	43.017	MGP_BALBcJ_G0029950	Rab35	82	44.444
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	76	48.447	MGP_BALBcJ_G0032499	Rab30	78	48.447
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	69	30.612	MGP_BALBcJ_G0029333	Rheb	79	30.612
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	99	39.810	MGP_BALBcJ_G0024659	Rab1b	99	39.810
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	75	43.125	MGP_BALBcJ_G0019803	Rab15	75	43.125
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	78	38.690	MGP_BALBcJ_G0023938	Rab31	85	38.690
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	92	45.408	MGP_BALBcJ_G0021255	Rab2b	90	45.408
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	78	37.952	MGP_BALBcJ_G0031461	Kras	87	37.349
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	98	34.615	MGP_BALBcJ_G0035166	Rab6b	95	34.615
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	76	34.545	MGP_BALBcJ_G0030984	Rab7	90	40.278
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	80	31.844	MGP_BALBcJ_G0030362	Rasl11a	73	31.844
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	87	42.473	MGP_BALBcJ_G0025624	Rab14	93	46.479
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	82	47.126	MGP_BALBcJ_G0023498	Rab11b	79	47.126
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	80	30.286	MGP_BALBcJ_G0019505	Dnajc27	64	30.286
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	77	36.585	MGP_BALBcJ_G0023849	Rab5a	75	36.585
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	80	43.275	MGP_BALBcJ_G0027373	Rab25	79	43.275
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	86	35.519	MGP_BALBcJ_G0027661	Nras	98	37.333
MGP_BALBcJ_G0035831	Rab39b	73	36.538	MGP_BALBcJ_G0015840	Rab23	65	36.538