EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0015268 (Gene tree)
Gene ID: 110303460
Gene Symbol: Smpd2
Alias: nSMase
Full Name: sphingomyelin phosphodiesterase 2
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4889 bases
Position: chr10:36947748-36952636
Accession: 110303460
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0022723	Exo_endo_phos	PF03372.23	2.3e-12	1	1

Transcripts

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MGP_CAROLIEiJ_T0022724	-	2371	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0022729	-	832	-	-	- (aa)	-	-
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MGP_CAROLIEiJ_T0022719	-	4091	-	-	- (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	100	77.381	ENSG00000135587	SMPD2	99	77.381	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	99	78.125	ENSAMEG00000016431	SMPD2	98	78.125	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	92	46.985	ENSACIG00000010069	smpd2b	94	44.750	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	92	45.885	ENSAOCG00000014544	smpd2b	90	45.113	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	92	45.885	ENSAPEG00000023764	smpd2b	90	45.387	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	92	44.527	ENSATEG00000025113	smpd2b	91	43.108	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	72	55.776	ENSACAG00000009270	SMPD2	94	48.294	Anolis_carolinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	99	77.404	ENSANAG00000028732	SMPD2	99	77.404	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	92	46.020	ENSACLG00000022892	smpd2b	90	44.862	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	91	43.829	ENSAMXG00000013614	smpd2b	91	43.164	Astyanax_mexicanus
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MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	99	76.683	ENSCJAG00000005756	SMPD2	99	76.683	Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	99	76.683	ENSCAFG00000003816	SMPD2	98	76.683	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	100	75.952	ENSCHIG00000022563	SMPD2	99	75.952	Capra_hircus
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MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	99	77.885	ENSCCAG00000036357	SMPD2	99	77.885	Cebus_capucinus
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MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	76	57.500	ENSCPBG00000017837	SMPD2	78	57.500	Chrysemys_picta_bellii
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MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	98	84.709	ENSCGRG00000008928	Smpd2	98	84.709	Cricetulus_griseus_crigri
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MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	93	43.719	ENSDARG00000052701	smpd2b	92	43.970	Danio_rerio
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MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	99	78.759	ENSDORG00000006485	Smpd2	99	78.571	Dipodomys_ordii
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	66	36.299	FBgn0035421	CG12034	64	36.332	Drosophila_melanogaster
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	95	45.368	ENSEBUG00000002962	smpd2b	97	46.062	Eptatretus_burgeri
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	100	77.619	ENSEASG00005006484	SMPD2	99	77.619	Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	100	76.905	ENSECAG00000016972	SMPD2	99	76.905	Equus_caballus
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MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	91	47.236	ENSGAFG00000016345	smpd2b	90	47.236	Gambusia_affinis
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MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	80	54.762	ENSMGAG00000006821	SMPD2	99	49.756	Meleagris_gallopavo
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MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	98	44.907	ENSMALG00000000267	smpd2b	95	46.650	Monopterus_albus
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	100	95.943	ENSMUSG00000019822	Smpd2	100	95.943	Mus_musculus
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	100	94.988	MGP_PahariEiJ_G0030686	Smpd2	100	94.988	Mus_pahari
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MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	99	76.923	ENSMPUG00000010005	SMPD2	98	76.923	Mustela_putorius_furo
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	100	76.429	ENSMLUG00000003793	SMPD2	99	76.429	Myotis_lucifugus
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	58	92.623	ENSNGAG00000013670	Smpd2	93	92.623	Nannospalax_galili
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	89	44.643	ENSNBRG00000008403	smpd2b	89	43.445	Neolamprologus_brichardi
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	100	76.905	ENSNLEG00000012570	SMPD2	99	76.905	Nomascus_leucogenys
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	92	54.545	ENSMEUG00000004602	SMPD2	91	54.545	Notamacropus_eugenii
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	97	74.568	ENSOPRG00000012612	SMPD2	96	74.568	Ochotona_princeps
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	92	46.020	ENSONIG00000014702	smpd2b	90	44.862	Oreochromis_niloticus
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	99	76.683	ENSOCUG00000008607	SMPD2	98	76.683	Oryctolagus_cuniculus
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	97	45.519	ENSORLG00000006334	smpd2b	95	44.418	Oryzias_latipes
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	97	45.283	ENSORLG00020015231	smpd2b	95	44.181	Oryzias_latipes_hni
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	97	45.283	ENSORLG00015010424	smpd2b	95	44.181	Oryzias_latipes_hsok
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	91	46.617	ENSOMEG00000016121	smpd2b	89	45.202	Oryzias_melastigma
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	99	75.962	ENSOGAG00000015505	SMPD2	98	75.000	Otolemur_garnettii
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	100	70.047	ENSOARG00000010409	SMPD2	99	70.047	Ovis_aries
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	100	77.381	ENSPPAG00000031363	SMPD2	99	77.381	Pan_paniscus
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	100	76.905	ENSPPRG00000000099	SMPD2	99	76.905	Panthera_pardus
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	100	76.905	ENSPTIG00000008954	SMPD2	99	76.905	Panthera_tigris_altaica
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	100	77.381	ENSPTRG00000018484	SMPD2	99	77.381	Pan_troglodytes
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	100	77.381	ENSPANG00000024480	SMPD2	99	77.381	Papio_anubis
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	76	48.910	ENSPKIG00000011322	smpd2a	70	49.057	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	88	43.351	ENSPMGG00000000230	smpd2b	91	44.591	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	98	83.130	ENSPEMG00000018109	Smpd2	99	83.130	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	77	50.926	ENSPMAG00000002460	smpd2b	92	51.084	Petromyzon_marinus
MGP_CAROLIEiJ_G0015268	Smpd2	95	58.025	ENSPCIG00000005984	SMPD2	94	58.025	Phascolarctos_cinereus
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