EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0015891 (Gene tree)
Gene ID: 110302856
Gene Symbol: Mars
Alias: MetRS|methionine tRNA ligase|methionyl-tRNA synthetase
Full Name: methionyl-tRNA synthetase
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15741 bases
Position: chr10:119650224-119665964
Accession: 110302856
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0025004	tRNA-synt_1g	PF09334.11	4.5e-147	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0025005	tRNA-synt_1g	PF09334.11	4.6e-147	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_CAROLIEiJ_T0025009	-	574	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0025008	-	467	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0025007	-	619	-	MGP_CAROLIEiJ_P0025007	183 (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0025006	-	3063	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0025005	-	2960	XM_021173621	MGP_CAROLIEiJ_P0025005	910 (aa)	XP_021029280	UPI000A316FEA
MGP_CAROLIEiJ_T0025004	-	2937	XM_021173622	MGP_CAROLIEiJ_P0025004	902 (aa)	XP_021029281	UPI000A31ABB6

Gene Model

Click here to download MGP_CAROLIEiJ_G0015891's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_CAROLIEiJ_G0015891's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.357	ENSG00000166986	MARS	98	91.398	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	62.595	ENSAPOG00000020238	mars	100	63.124	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.690	ENSAMEG00000004962	MARS	100	89.690	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	63.865	ENSACIG00000016271	mars	100	66.442	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	62.675	ENSAOCG00000011411	mars	100	63.232	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	62.554	ENSAPEG00000008610	mars	100	63.124	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.270	ENSATEG00000025019	mars	100	62.121	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	93	70.726	ENSAPLG00000014821	MARS	100	70.760	Anas_platyrhynchos
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	66.960	ENSACAG00000006698	MARS	99	66.777	Anolis_carolinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.305	ENSANAG00000027589	MARS	100	89.305	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	63.124	ENSACLG00000018937	mars	100	63.015	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	63.617	ENSAMXG00000017335	mars	100	61.800	Astyanax_mexicanus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	88.914	ENSBTAG00000018405	MARS	100	88.914	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	73	54.167	WBGene00003415	mars-1	89	57.781	Caenorhabditis_elegans
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	88.803	ENSCJAG00000007249	MARS	100	88.803	Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.357	ENSCAFG00000000229	MARS	100	89.579	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.357	ENSCAFG00020023661	MARS	100	89.579	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	88.581	ENSCHIG00000027023	MARS	100	88.581	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	88.470	ENSTSYG00000005193	MARS	100	88.470	Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	83	80.978	ENSCAPG00000014448	MARS	99	80.978	Cavia_aperea
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	87.805	ENSCPOG00000012866	MARS	100	87.805	Cavia_porcellus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.451	ENSCCAG00000032206	MARS	100	89.451	Cebus_capucinus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.231	ENSCATG00000038907	MARS	100	89.231	Cercocebus_atys
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	97	88.838	ENSCLAG00000012164	MARS	99	88.813	Chinchilla_lanigera
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	88.326	ENSCSAG00000004852	MARS	100	88.326	Chlorocebus_sabaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	66.850	ENSCPBG00000017136	MARS	100	66.850	Chrysemys_picta_bellii
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	72	60.896	ENSCING00000018550	-	96	62.442	Ciona_intestinalis
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	63	63.222	ENSCSAVG00000006145	-	98	63.047	Ciona_savignyi
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.613	ENSCANG00000034583	MARS	100	89.613	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	92.308	ENSCGRG00001019238	Mars	100	92.308	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	92.308	ENSCGRG00000017321	Mars	100	92.308	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	63.457	ENSCSEG00000010816	mars	99	63.646	Cynoglossus_semilaevis
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.555	ENSCVAG00000009314	mars	99	62.555	Cyprinodon_variegatus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	63.428	ENSDARG00000034396	mars	97	63.210	Danio_rerio
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	87.802	ENSDNOG00000017502	MARS	100	87.802	Dasypus_novemcinctus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	88.914	ENSDORG00000007127	Mars	100	88.914	Dipodomys_ordii
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	98	48.998	FBgn0034401	MetRS	82	50.346	Drosophila_melanogaster
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	59	86.940	ENSETEG00000007106	MARS	100	86.940	Echinops_telfairi
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	70	54.127	ENSEBUG00000010439	mars	88	59.636	Eptatretus_burgeri
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.341	ENSEASG00005007208	MARS	100	89.341	Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.341	ENSECAG00000015175	MARS	100	89.341	Equus_caballus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	89	88.350	ENSEEUG00000015503	MARS	89	88.350	Erinaceus_europaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	62.758	ENSELUG00000010453	mars	100	62.758	Esox_lucius
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	90.244	ENSFCAG00000002083	MARS	100	90.244	Felis_catus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	86.374	ENSFDAG00000010217	MARS	100	86.374	Fukomys_damarensis
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.690	ENSFHEG00000016374	mars	100	63.341	Fundulus_heteroclitus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.088	ENSGMOG00000007987	mars	100	61.978	Gadus_morhua
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	92	67.913	ENSGALG00000039315	MARS	95	65.993	Gallus_gallus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.760	ENSGAFG00000013461	mars	100	62.486	Gambusia_affinis
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.473	ENSGACG00000006474	mars	100	62.473	Gasterosteus_aculeatus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	96	70.332	ENSGAGG00000011640	MARS	97	70.332	Gopherus_agassizii
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.357	ENSGGOG00000001982	MARS	100	89.357	Gorilla_gorilla
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	91	70.292	ENSHBUG00000009575	mars	95	70.292	Haplochromis_burtoni
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	75.393	ENSHGLG00000019739	-	96	75.506	Heterocephalus_glaber_female
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.341	ENSHGLG00000013493	MARS	100	89.341	Heterocephalus_glaber_female
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	74.270	ENSHGLG00100004906	-	96	74.382	Heterocephalus_glaber_male
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.341	ENSHGLG00100006885	MARS	100	89.341	Heterocephalus_glaber_male
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	61.755	ENSHCOG00000001090	mars	100	61.538	Hippocampus_comes
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	66	71.547	ENSIPUG00000024413	mars	99	71.547	Ictalurus_punctatus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	91	64.692	ENSIPUG00000024410	mars	98	64.286	Ictalurus_punctatus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.147	ENSSTOG00000001128	MARS	100	88.926	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	90.022	ENSJJAG00000018827	Mars	100	90.022	Jaculus_jaculus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	63.095	ENSKMAG00000012408	mars	99	64.183	Kryptolebias_marmoratus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.446	ENSLBEG00000013609	mars	100	63.084	Labrus_bergylta
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	69.189	ENSLACG00000018854	MARS	100	69.011	Latimeria_chalumnae
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	87.154	ENSLAFG00000013525	MARS	100	87.154	Loxodonta_africana
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.690	ENSMFAG00000010123	MARS	100	89.690	Macaca_fascicularis
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.911	ENSMMUG00000011277	MARS	100	89.911	Macaca_mulatta
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	88.287	ENSMNEG00000044464	MARS	100	88.287	Macaca_nemestrina
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	89	89.970	ENSMLEG00000034638	MARS	100	89.970	Mandrillus_leucophaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	96	63.780	ENSMAMG00000010012	mars	97	63.780	Mastacembelus_armatus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.907	ENSMZEG00005007092	mars	100	62.798	Maylandia_zebra
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.024	ENSMAUG00000011482	Mars	100	89.024	Mesocricetus_auratus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.468	ENSMICG00000032056	MARS	100	89.468	Microcebus_murinus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	92.461	ENSMOCG00000010941	Mars	100	92.461	Microtus_ochrogaster
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	62.239	ENSMMOG00000007461	mars	99	62.239	Mola_mola
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.065	ENSMALG00000010005	mars	99	63.538	Monopterus_albus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	98.571	ENSMUSG00000040354	Mars	100	98.571	Mus_musculus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	97.143	MGP_PahariEiJ_G0031194	Mars	100	97.143	Mus_pahari
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	98.681	MGP_SPRETEiJ_G0016717	Mars	100	98.681	Mus_spretus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	88.803	ENSMPUG00000001831	MARS	100	88.803	Mustela_putorius_furo
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	88.470	ENSMLUG00000001037	MARS	100	88.470	Myotis_lucifugus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	91.131	ENSNGAG00000018824	Mars	100	91.131	Nannospalax_galili
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	64.783	ENSNBRG00000004105	mars	100	65.046	Neolamprologus_brichardi
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.690	ENSNLEG00000017297	MARS	100	89.690	Nomascus_leucogenys
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	89	81.266	ENSMEUG00000007195	MARS	100	80.929	Notamacropus_eugenii
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	86.031	ENSOPRG00000006518	MARS	100	86.031	Ochotona_princeps
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	88.914	ENSODEG00000001752	MARS	100	88.914	Octodon_degus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.379	ENSONIG00000005090	mars	100	62.191	Oreochromis_niloticus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	73	75.716	ENSOANG00000013318	MARS	100	75.264	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.579	ENSOCUG00000007373	MARS	100	89.579	Oryctolagus_cuniculus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.024	ENSORLG00000005405	mars	100	62.350	Oryzias_latipes
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.242	ENSORLG00020017397	mars	100	62.568	Oryzias_latipes_hni
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.242	ENSORLG00015012976	mars	100	62.568	Oryzias_latipes_hsok
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	61.889	ENSOMEG00000018411	mars	100	62.133	Oryzias_melastigma
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	88.546	ENSOGAG00000005226	MARS	100	87.885	Otolemur_garnettii
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	88.581	ENSOARG00000006477	MARS	100	88.581	Ovis_aries
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	88.022	ENSPPAG00000025147	MARS	100	88.022	Pan_paniscus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	90.244	ENSPPRG00000023243	MARS	100	90.244	Panthera_pardus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	90.133	ENSPTIG00000006721	MARS	100	90.133	Panthera_tigris_altaica
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.357	ENSPTRG00000005135	MARS	100	89.357	Pan_troglodytes
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.560	ENSPANG00000009140	MARS	100	89.560	Papio_anubis
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	63.100	ENSPKIG00000002833	mars	100	63.100	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	70	49.137	ENSPSIG00000013607	MARS	100	45.298	Pelodiscus_sinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	61.723	ENSPMGG00000014847	mars	99	61.396	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	92.857	ENSPEMG00000000046	Mars	100	92.857	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	81.908	ENSPCIG00000023765	MARS	100	81.579	Phascolarctos_cinereus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.623	ENSPFOG00000006998	mars	100	62.732	Poecilia_formosa
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.404	ENSPLAG00000017870	mars	100	62.623	Poecilia_latipinna
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.514	ENSPMEG00000008197	mars	100	62.623	Poecilia_mexicana
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.623	ENSPREG00000008123	mars	100	62.623	Poecilia_reticulata
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.357	ENSPPYG00000004691	MARS	100	89.357	Pongo_abelii
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	89	87.179	ENSPCAG00000016037	MARS	93	87.179	Procavia_capensis
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.690	ENSPCOG00000017598	MARS	100	89.690	Propithecus_coquereli
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	82	83.544	ENSPVAG00000012112	MARS	82	83.544	Pteropus_vampyrus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.907	ENSPNYG00000013809	mars	100	62.798	Pundamilia_nyererei
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	63.774	ENSPNAG00000017290	mars	100	63.844	Pygocentrus_nattereri
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	95.233	ENSRNOG00000025459	Mars	100	95.233	Rattus_norvegicus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	87.416	ENSRBIG00000044782	MARS	99	87.416	Rhinopithecus_bieti
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	88.962	ENSRROG00000042331	MARS	100	88.962	Rhinopithecus_roxellana
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	63	51.323	YGR264C	MES1	75	51.323	Saccharomyces_cerevisiae
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	86.047	ENSSBOG00000022875	MARS	100	86.047	Saimiri_boliviensis_boliviensis
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	82.743	ENSSHAG00000007182	MARS	100	82.633	Sarcophilus_harrisii
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.144	ENSSFOG00015011038	mars	99	62.322	Scleropages_formosus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	62.662	ENSSMAG00000012409	mars	92	72.488	Scophthalmus_maximus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	62.987	ENSSDUG00000019070	mars	100	63.164	Seriola_dumerili
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	92	64.762	ENSSLDG00000005561	mars	96	64.482	Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	92	88.486	ENSSARG00000002477	MARS	92	88.486	Sorex_araneus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	87	75.676	ENSSPUG00000007756	MARS	100	70.041	Sphenodon_punctatus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	63.135	ENSSPAG00000022691	mars	100	63.557	Stegastes_partitus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.468	ENSSSCG00000023318	MARS	95	89.468	Sus_scrofa
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.118	ENSTRUG00000014774	mars	100	62.118	Takifugu_rubripes
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	60.668	ENSTNIG00000007060	mars	100	60.776	Tetraodon_nigroviridis
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	75	83.529	ENSTBEG00000000303	MARS	87	84.146	Tupaia_belangeri
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	79	91.667	ENSTTRG00000013088	MARS	78	91.667	Tursiops_truncatus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	51	88.985	ENSUAMG00000019284	-	94	88.985	Ursus_americanus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.690	ENSUMAG00000019826	MARS	100	89.690	Ursus_maritimus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	64	94.771	ENSVPAG00000008665	MARS	66	94.771	Vicugna_pacos
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	100	89.357	ENSVVUG00000017940	MARS	100	89.357	Vulpes_vulpes
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	68	75.041	ENSXETG00000025174	mars	100	75.122	Xenopus_tropicalis
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.514	ENSXCOG00000013878	mars	100	62.732	Xiphophorus_couchianus
MGP_CAROLIEiJ_G0015891	Mars	99	62.732	ENSXMAG00000017920	mars	100	62.951	Xiphophorus_maculatus