EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0016136 (Gene tree)
Gene ID: 110304602
Gene Symbol: Xpo1
Alias: Crm1
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 41174 bases
Position: chr11:19076566-19117739
Accession: 110304602
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0025872	CRM1_C	PF08767.11	2.2e-134	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0025873	CRM1_C	PF08767.11	2.2e-134	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0025874	CRM1_C	PF08767.11	2.2e-134	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0025876	CRM1_C	PF08767.11	2.2e-134	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0025878	CRM1_C	PF08767.11	3.3e-19	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0025872	Xpo1	PF08389.12	9.7e-41	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0025873	Xpo1	PF08389.12	9.7e-41	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0025874	Xpo1	PF08389.12	9.7e-41	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0025876	Xpo1	PF08389.12	9.7e-41	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0025872	IBN_N	PF03810.19	4.3e-12	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0025873	IBN_N	PF03810.19	4.3e-12	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0025874	IBN_N	PF03810.19	4.3e-12	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0025876	IBN_N	PF03810.19	4.3e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_CAROLIEiJ_T0025876	-	6116	-	MGP_CAROLIEiJ_P0025876	1071 (aa)	XP_021031666	UPI000A314ECC
MGP_CAROLIEiJ_T0025877	-	464	-	MGP_CAROLIEiJ_P0025877	59 (aa)	-	UPI000059DC2D
MGP_CAROLIEiJ_T0025874	-	3471	-	MGP_CAROLIEiJ_P0025874	1071 (aa)	XP_021031666	UPI000A314ECC
MGP_CAROLIEiJ_T0025875	-	2914	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0025872	-	5151	-	MGP_CAROLIEiJ_P0025872	1071 (aa)	XP_021031666	UPI000A314ECC
MGP_CAROLIEiJ_T0025873	-	4908	-	MGP_CAROLIEiJ_P0025873	1071 (aa)	XP_021031666	UPI000A314ECC
MGP_CAROLIEiJ_T0025878	-	698	-	MGP_CAROLIEiJ_P0025878	232 (aa)	-	UPI0000EE0628

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.039	ENSG00000082898	XPO1	100	100.000	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	95.612	ENSAPOG00000004984	-	100	95.612	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	88	89.574	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	89.574	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.974	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	98.974	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	81.227	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	91.915	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	88	95.851	ENSACIG00000010818	-	100	95.851	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	91.317	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	91.317	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	95.612	ENSAOCG00000010121	-	100	95.612	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	91	91.761	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	91.761	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	95.612	ENSAPEG00000007038	-	100	95.612	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	95.612	ENSATEG00000008816	-	100	95.612	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	90.943	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	90.943	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.786	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	98.786	Anas_platyrhynchos
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.599	ENSACAG00000002501	XPO1	100	98.599	Anolis_carolinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.039	ENSANAG00000020802	XPO1	100	98.039	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	81.227	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	92.234	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	95.425	ENSACLG00000015192	-	100	95.425	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	95.892	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	95.892	Astyanax_mexicanus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	82.310	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.114	Astyanax_mexicanus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	99.066	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	99.066	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	55.957	WBGene00002078	xpo-1	99	51.479	Caenorhabditis_elegans
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.039	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.039	Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	99.066	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	99.066	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	93	98.896	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	98.896	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	99.066	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	99.066	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	99.066	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	99.066	Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	94	78.824	ENSCAPG00000006454	-	100	95.035	Cavia_aperea
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	97.759	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	97.759	Cavia_porcellus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	79.314	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.499	Cebus_capucinus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	96.100	ENSCATG00000032674	XPO1	100	97.766	Cercocebus_atys
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.973	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.973	Chinchilla_lanigera
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.039	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.039	Chlorocebus_sabaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	83.755	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	98.962	Choloepus_hoffmanni
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.693	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.693	Chrysemys_picta_bellii
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	80.726	ENSCING00000024562	-	100	80.726	Ciona_intestinalis
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	99	79.832	ENSCSAVG00000005965	-	99	79.832	Ciona_savignyi
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	94.118	ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.404	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	99.440	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	99.440	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	99.440	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	99.440	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	83.032	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.681	Cynoglossus_semilaevis
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MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	95.518	ENSCVAG00000016788	-	100	95.518	Cyprinodon_variegatus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	96.359	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	96.359	Danio_rerio
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	92.717	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	94.272	Danio_rerio
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.973	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	98.973	Dasypus_novemcinctus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	92	95.521	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.521	Dipodomys_ordii
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	99	71.040	FBgn0020497	emb	99	71.040	Drosophila_melanogaster
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	94	97.419	ENSETEG00000018045	XPO1	94	97.419	Echinops_telfairi
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	78.700	ENSEBUG00000012580	-	100	87.242	Eptatretus_burgeri
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	99.066	ENSEASG00005007223	XPO1	100	99.066	Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	99.066	ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.219	Equus_caballus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	92	100.000	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	Erinaceus_europaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	88	94.468	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	94.468	Esox_lucius
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	85.171	ENSELUG00000014306	-	99	92.398	Esox_lucius
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	99.066	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	99.066	Felis_catus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.506	ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.506	Ficedula_albicollis
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	97.386	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	97.386	Fukomys_damarensis
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MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	90.850	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	90.850	Fundulus_heteroclitus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	92.344	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	92.344	Gadus_morhua
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	89.636	ENSGMOG00000019063	-	100	89.636	Gadus_morhua
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.786	ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.786	Gallus_gallus
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MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	95.518	ENSHBUG00000020037	-	100	95.518	Haplochromis_burtoni
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MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.880	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	98.880	Heterocephalus_glaber_male
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MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.880	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.880	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.973	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	98.973	Jaculus_jaculus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	95.051	ENSKMAG00000016218	-	100	95.051	Kryptolebias_marmoratus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	90.756	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	90.756	Kryptolebias_marmoratus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	81.227	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	89.407	Labrus_bergylta
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	95.518	ENSLBEG00000005740	-	100	95.518	Labrus_bergylta
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	77.193	ENSLACG00000018213	XPO1	100	77.193	Latimeria_chalumnae
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	96.452	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	96.452	Lepisosteus_oculatus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.693	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	98.693	Loxodonta_africana
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.039	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	98.039	Macaca_fascicularis
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.039	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	98.039	Macaca_mulatta
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.039	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	98.039	Macaca_nemestrina
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	96.372	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	96.372	Mandrillus_leucophaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	95.518	ENSMAMG00000010568	-	100	95.518	Mastacembelus_armatus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	91.317	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	91.317	Mastacembelus_armatus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	91.503	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	91.503	Maylandia_zebra
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	95.425	ENSMZEG00005018158	-	98	95.572	Maylandia_zebra
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	83.755	ENSMGAG00000001496	-	99	98.483	Meleagris_gallopavo
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	99.440	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	99.440	Mesocricetus_auratus
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MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	99.720	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	99.720	Microtus_ochrogaster
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MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	99.066	ENSUAMG00000026512	XPO1	100	99.066	Ursus_americanus
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MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	99.066	ENSVVUG00000012009	XPO1	100	99.066	Vulpes_vulpes
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	97.199	ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.199	Xenopus_tropicalis
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	80.866	ENSXCOG00000011889	XPO1	100	91.809	Xiphophorus_couchianus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	78	95.396	ENSXCOG00000006625	-	97	95.396	Xiphophorus_couchianus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	91.036	ENSXMAG00000005790	xpo1a	100	91.036	Xiphophorus_maculatus
MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	95.331	ENSXMAG00000007353	-	100	95.331	Xiphophorus_maculatus