EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0017315 (Gene tree)
Gene ID: 110305767
Gene Symbol: Ftsj3
Alias: C79843|D11Ertd400e|Epcs3
Full Name: FtsJ RNA methyltransferase homolog 3
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6855 bases
Position: chr11:102153837-102160691
Accession: 110305767
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0030538	FtsJ	PF01728.19	1.3e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_CAROLIEiJ_T0030540	-	577	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0030541	-	543	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0030542	-	703	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0030543	-	672	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0030539	-	569	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0030538	-	3151	XM_021177867	MGP_CAROLIEiJ_P0030538	837 (aa)	XP_021033526	UPI000A31674F

Gene Model

Click here to download MGP_CAROLIEiJ_G0017315's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_CAROLIEiJ_G0017315's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	87.050	ENSG00000108592	FTSJ3	100	100.000	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	72	70.000	ENSAPOG00000005543	ftsj3	85	69.176	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	88.585	ENSAMEG00000003148	FTSJ3	98	89.010	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	63	59.598	ENSACIG00000012880	ftsj3	67	59.890	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	59.907	ENSAOCG00000023196	ftsj3	96	60.714	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	59.790	ENSAPEG00000004250	ftsj3	97	60.642	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	92	60.128	ENSATEG00000010069	ftsj3	96	60.078	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	92	62.225	ENSAPLG00000010362	-	98	62.435	Anas_platyrhynchos
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	88	63.720	ENSACAG00000017930	FTSJ3	98	64.611	Anolis_carolinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	88.029	ENSANAG00000033774	FTSJ3	98	88.755	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	84	70.225	ENSACLG00000019137	ftsj3	97	70.225	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	66	65.009	ENSAMXG00000021571	ftsj3	94	61.758	Astyanax_mexicanus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	89.709	ENSBTAG00000021060	FTSJ3	98	89.588	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	41.076	WBGene00019168	H06I04.3	100	40.880	Caenorhabditis_elegans
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	87.545	ENSCJAG00000019631	FTSJ3	98	88.029	Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	87.277	ENSCAFG00000012770	FTSJ3	98	87.440	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	88.095	ENSCAFG00020026630	FTSJ3	98	88.271	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	89.576	ENSCHIG00000025676	FTSJ3	98	89.212	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	95	82.353	ENSTSYG00000001393	FTSJ3	97	82.038	Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	71	81.452	ENSCAPG00000016654	FTSJ3	98	81.048	Cavia_aperea
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	86.852	ENSCPOG00000011384	FTSJ3	98	86.988	Cavia_porcellus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	86.925	ENSCCAG00000023533	-	97	91.682	Cebus_capucinus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	86.555	ENSCATG00000018510	FTSJ3	98	86.795	Cercocebus_atys
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	88.620	ENSCLAG00000003222	FTSJ3	98	88.620	Chinchilla_lanigera
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	86.833	ENSCSAG00000003921	FTSJ3	98	86.867	Chlorocebus_sabaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	68.929	ENSCPBG00000010032	FTSJ3	90	84.293	Chrysemys_picta_bellii
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	58	57.980	ENSCSAVG00000003607	-	97	41.437	Ciona_savignyi
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	87.485	ENSCANG00000042921	FTSJ3	98	87.605	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	92.121	ENSCGRG00001018068	FTSJ3	98	91.879	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	92.121	ENSCGRG00000010648	FTSJ3	98	91.879	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	59.444	ENSCSEG00000013468	ftsj3	96	60.237	Cynoglossus_semilaevis
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	62.945	ENSCVAG00000007484	ftsj3	97	62.455	Cyprinodon_variegatus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	61.137	ENSDARG00000104938	ftsj3	97	62.127	Danio_rerio
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	85.395	ENSDNOG00000002392	FTSJ3	98	84.689	Dasypus_novemcinctus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	90.700	ENSDORG00000004200	Ftsj3	98	90.942	Dipodomys_ordii
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	40.233	FBgn0030720	CG8939	98	39.792	Drosophila_melanogaster
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	83.491	ENSETEG00000019228	FTSJ3	98	83.933	Echinops_telfairi
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	51.786	ENSEBUG00000007828	ftsj3	97	51.267	Eptatretus_burgeri
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	88.836	ENSEASG00005013565	FTSJ3	98	89.144	Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	89.264	ENSECAG00000011995	FTSJ3	98	89.385	Equus_caballus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	59.375	ENSELUG00000013501	ftsj3	95	59.456	Esox_lucius
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	87.247	ENSFCAG00000013983	FTSJ3	98	87.651	Felis_catus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	69.167	ENSFALG00000013635	FTSJ3	99	69.762	Ficedula_albicollis
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	87.864	ENSFDAG00000010274	FTSJ3	98	88.471	Fukomys_damarensis
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	62.604	ENSFHEG00000007639	ftsj3	97	61.995	Fundulus_heteroclitus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	51	71.396	ENSGMOG00000017184	ftsj3	100	70.252	Gadus_morhua
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	69.820	ENSGALG00000032993	FTSJ3	99	70.659	Gallus_gallus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	51	72.834	ENSGACG00000009841	ftsj3	100	72.365	Gasterosteus_aculeatus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	71.259	ENSGAGG00000006236	FTSJ3	99	72.048	Gopherus_agassizii
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	87.590	ENSGGOG00000006794	FTSJ3	98	88.313	Gorilla_gorilla
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	62.545	ENSHBUG00000022331	ftsj3	96	61.825	Haplochromis_burtoni
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	88.956	ENSHGLG00000012282	FTSJ3	98	88.835	Heterocephalus_glaber_female
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	88.983	ENSHGLG00100003578	FTSJ3	98	88.835	Heterocephalus_glaber_male
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	62.264	ENSHCOG00000018770	ftsj3	96	61.667	Hippocampus_comes
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	61.137	ENSIPUG00000024942	ftsj3	94	61.575	Ictalurus_punctatus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	88.179	ENSSTOG00000021265	FTSJ3	98	88.875	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	88.727	ENSJJAG00000012822	Ftsj3	98	88.848	Jaculus_jaculus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	62.633	ENSKMAG00000021997	ftsj3	96	61.990	Kryptolebias_marmoratus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	61.657	ENSLBEG00000027142	ftsj3	96	60.906	Labrus_bergylta
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	82	50.000	ENSLACG00000005523	FTSJ3	99	49.718	Latimeria_chalumnae
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	62.159	ENSLOCG00000008979	ftsj3	98	62.635	Lepisosteus_oculatus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	86.477	ENSLAFG00000003252	FTSJ3	98	86.627	Loxodonta_africana
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	86.643	ENSMFAG00000003764	FTSJ3	98	86.883	Macaca_fascicularis
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	82.992	ENSMMUG00000016768	FTSJ3	98	82.014	Macaca_mulatta
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	86.418	ENSMNEG00000029254	FTSJ3	98	86.779	Macaca_nemestrina
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	86.915	ENSMLEG00000029091	FTSJ3	98	87.861	Mandrillus_leucophaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	62.500	ENSMZEG00005001992	ftsj3	96	62.785	Maylandia_zebra
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	67	72.968	ENSMGAG00000000953	FTSJ3	99	65.278	Meleagris_gallopavo
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	91.768	ENSMAUG00000015688	Ftsj3	98	91.404	Mesocricetus_auratus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	89.346	ENSMICG00000045996	FTSJ3	98	89.709	Microcebus_murinus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	92.473	ENSMOCG00000017809	Ftsj3	98	92.112	Microtus_ochrogaster
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	66	62.721	ENSMMOG00000019522	ftsj3	89	59.053	Mola_mola
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	78.504	ENSMODG00000009901	FTSJ3	98	78.382	Monodelphis_domestica
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	98.449	ENSMUSG00000020706	Ftsj3	100	98.449	Mus_musculus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	98.689	MGP_PahariEiJ_G0018445	Ftsj3	100	98.689	Mus_pahari
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	98.805	MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	100	98.805	Mus_spretus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	87.886	ENSMPUG00000014911	FTSJ3	98	87.062	Mustela_putorius_furo
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	88.571	ENSMLUG00000011667	FTSJ3	98	88.875	Myotis_lucifugus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	91.677	ENSNGAG00000005899	Ftsj3	98	91.768	Nannospalax_galili
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	85	70.588	ENSNBRG00000017453	ftsj3	97	70.787	Neolamprologus_brichardi
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	88.058	ENSNLEG00000004188	FTSJ3	98	88.150	Nomascus_leucogenys
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	70.833	ENSMEUG00000013252	FTSJ3	98	74.123	Notamacropus_eugenii
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	86.451	ENSOPRG00000014985	FTSJ3	98	86.091	Ochotona_princeps
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	88.333	ENSODEG00000008167	FTSJ3	98	88.378	Octodon_degus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	62.738	ENSONIG00000001654	ftsj3	96	62.710	Oreochromis_niloticus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	86.207	ENSOCUG00000004319	FTSJ3	98	84.746	Oryctolagus_cuniculus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	60.542	ENSORLG00000005910	ftsj3	96	61.190	Oryzias_latipes
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	61.620	ENSORLG00020021255	ftsj3	89	72.159	Oryzias_latipes_hni
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	59.469	ENSORLG00015018416	ftsj3	96	61.065	Oryzias_latipes_hsok
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	61.439	ENSOMEG00000014432	ftsj3	96	61.667	Oryzias_melastigma
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	88.704	ENSOGAG00000032479	FTSJ3	98	88.647	Otolemur_garnettii
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	89.576	ENSOARG00000013637	FTSJ3	98	89.576	Ovis_aries
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	87.395	ENSPPAG00000027297	FTSJ3	98	88.115	Pan_paniscus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	86.770	ENSPPRG00000003042	FTSJ3	98	87.651	Panthera_pardus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	86.137	ENSPTIG00000012576	FTSJ3	98	87.124	Panthera_tigris_altaica
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	87.290	ENSPTRG00000009524	FTSJ3	98	88.010	Pan_troglodytes
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	86.763	ENSPANG00000020978	FTSJ3	98	87.004	Papio_anubis
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	81	70.225	ENSPKIG00000012838	ftsj3	96	62.172	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	59	83.333	ENSPSIG00000004632	FTSJ3	68	88.043	Pelodiscus_sinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	54.524	ENSPMGG00000012959	ftsj3	98	54.819	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	94.417	ENSPEMG00000000248	Ftsj3	98	94.175	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	78.504	ENSPCIG00000009088	FTSJ3	98	79.348	Phascolarctos_cinereus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	61.150	ENSPFOG00000023101	ftsj3	97	60.854	Poecilia_formosa
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	60.981	ENSPLAG00000003846	ftsj3	97	60.735	Poecilia_latipinna
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	61.268	ENSPMEG00000012692	ftsj3	97	60.973	Poecilia_mexicana
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	61.241	ENSPREG00000014874	ftsj3	97	61.584	Poecilia_reticulata
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	86.804	ENSPPYG00000008532	FTSJ3	98	86.683	Pongo_abelii
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	84.468	ENSPCAG00000002560	FTSJ3	98	83.758	Procavia_capensis
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	88.889	ENSPCOG00000023921	FTSJ3	98	89.010	Propithecus_coquereli
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	88.849	ENSPVAG00000000162	FTSJ3	98	89.036	Pteropus_vampyrus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	85	70.157	ENSPNYG00000005108	ftsj3	96	70.787	Pundamilia_nyererei
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	97	59.420	ENSPNAG00000022474	ftsj3	94	60.220	Pygocentrus_nattereri
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	95.823	ENSRNOG00000009857	Ftsj3	100	95.823	Rattus_norvegicus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	86.852	ENSRBIG00000039259	FTSJ3	98	86.852	Rhinopithecus_bieti
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	86.836	ENSRROG00000045002	FTSJ3	98	86.836	Rhinopithecus_roxellana
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	54	42.857	YCL054W	-	64	39.261	Saccharomyces_cerevisiae
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	86.852	ENSSBOG00000031794	FTSJ3	92	88.392	Saimiri_boliviensis_boliviensis
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	77.791	ENSSHAG00000013062	FTSJ3	98	78.554	Sarcophilus_harrisii
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	60.140	ENSSFOG00015018053	ftsj3	97	62.813	Scleropages_formosus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	66	62.903	ENSSMAG00000002863	ftsj3	96	59.762	Scophthalmus_maximus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	61.268	ENSSDUG00000003385	ftsj3	95	61.529	Seriola_dumerili
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	61.629	ENSSLDG00000017970	ftsj3	95	61.410	Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	92	70.232	ENSSPUG00000012959	FTSJ3	99	69.330	Sphenodon_punctatus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	59.532	ENSSPAG00000002390	ftsj3	96	61.831	Stegastes_partitus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	87.787	ENSSSCG00000017288	FTSJ3	98	88.271	Sus_scrofa
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	60.498	ENSTRUG00000017550	ftsj3	88	70.455	Takifugu_rubripes
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	60.329	ENSTNIG00000015549	ftsj3	98	60.744	Tetraodon_nigroviridis
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	82.061	ENSTBEG00000010295	FTSJ3	98	82.303	Tupaia_belangeri
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	98	88.271	ENSTTRG00000006973	FTSJ3	98	88.150	Tursiops_truncatus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	82	99.254	ENSUAMG00000007332	FTSJ3	94	99.254	Ursus_americanus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	88.333	ENSUMAG00000017450	FTSJ3	98	88.634	Ursus_maritimus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	100	88.095	ENSVVUG00000006106	FTSJ3	98	88.271	Vulpes_vulpes
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	97	59.386	ENSXETG00000006939	ftsj3	99	58.363	Xenopus_tropicalis
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	85	70.330	ENSXCOG00000002999	ftsj3	88	69.886	Xiphophorus_couchianus
MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	99	60.900	ENSXMAG00000018139	ftsj3	96	59.786	Xiphophorus_maculatus