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PPI

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Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0018012 (Gene tree)
Gene ID: 110306508
Gene Symbol: Zc3h14
Alias: 1010001P15Rik|1700016A15Rik|2700069A02Rik
Full Name: zinc finger CCCH-type containing 14
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 39336 bases
Position: chr12:93352759-93392094
Accession: 110306508
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0033070	zf-CCCH_2	PF14608.6	2.6e-18	1	4
MGP_CAROLIEiJ_P0033070	zf-CCCH_2	PF14608.6	2.6e-18	2	4
MGP_CAROLIEiJ_P0033070	zf-CCCH_2	PF14608.6	2.6e-18	3	4
MGP_CAROLIEiJ_P0033070	zf-CCCH_2	PF14608.6	2.6e-18	4	4
MGP_CAROLIEiJ_P0033066	zf-CCCH_2	PF14608.6	6.9e-17	1	4
MGP_CAROLIEiJ_P0033066	zf-CCCH_2	PF14608.6	6.9e-17	2	4
MGP_CAROLIEiJ_P0033066	zf-CCCH_2	PF14608.6	6.9e-17	3	4
MGP_CAROLIEiJ_P0033066	zf-CCCH_2	PF14608.6	6.9e-17	4	4
MGP_CAROLIEiJ_P0033068	zf-CCCH_2	PF14608.6	8.9e-17	1	4
MGP_CAROLIEiJ_P0033068	zf-CCCH_2	PF14608.6	8.9e-17	2	4
MGP_CAROLIEiJ_P0033068	zf-CCCH_2	PF14608.6	8.9e-17	3	4
MGP_CAROLIEiJ_P0033068	zf-CCCH_2	PF14608.6	8.9e-17	4	4
MGP_CAROLIEiJ_P0033067	zf-CCCH_2	PF14608.6	2.7e-16	1	4
MGP_CAROLIEiJ_P0033067	zf-CCCH_2	PF14608.6	2.7e-16	2	4
MGP_CAROLIEiJ_P0033067	zf-CCCH_2	PF14608.6	2.7e-16	3	4
MGP_CAROLIEiJ_P0033067	zf-CCCH_2	PF14608.6	2.7e-16	4	4

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_CAROLIEiJ_T0033066	-	3074	-	MGP_CAROLIEiJ_P0033066	578 (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0033067	-	3542	XM_021178630	MGP_CAROLIEiJ_P0033067	734 (aa)	XP_021034289	-
MGP_CAROLIEiJ_T0033070	-	2343	XM_021178632	MGP_CAROLIEiJ_P0033070	308 (aa)	XP_021034291	-
MGP_CAROLIEiJ_T0033068	-	3149	XM_021178631	MGP_CAROLIEiJ_P0033068	603 (aa)	XP_021034290	-
MGP_CAROLIEiJ_T0033069	-	2208	-	MGP_CAROLIEiJ_P0033069	735 (aa)	-	UPI000A31A355

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	89.946	ENSG00000100722	ZC3H14	100	100.000	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	95	66.667	ENSAPOG00000001640	zc3h14	99	46.452	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	86.928	ENSAMEG00000001478	ZC3H14	99	87.312	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	94	43.409	ENSACIG00000003703	zc3h14	93	60.510	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	94	64.085	ENSAOCG00000024218	zc3h14	100	46.862	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	93	65.217	ENSAPEG00000001867	zc3h14	99	46.980	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	94	49.524	ENSATEG00000006018	zc3h14	100	43.239	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	98	75.316	ENSAPLG00000008694	ZC3H14	99	70.110	Anas_platyrhynchos
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	68.471	ENSACAG00000013021	ZC3H14	98	67.118	Anolis_carolinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	78	74.165	ENSANAG00000030417	-	95	76.974	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	87.500	ENSANAG00000032583	-	100	90.196	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	60.000	ENSACLG00000012665	zc3h14	100	44.311	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	93	61.111	ENSAMXG00000013714	zc3h14	99	44.133	Astyanax_mexicanus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	90.066	ENSBTAG00000030453	ZC3H14	100	85.714	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	88.967	ENSCJAG00000017345	ZC3H14	100	89.610	Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	89.538	ENSCAFG00000017415	ZC3H14	100	89.538	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	97	88.873	ENSCAFG00020016522	ZC3H14	100	88.312	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	87.075	ENSCHIG00000022904	ZC3H14	100	88.056	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	69	85.256	ENSCHIG00000009115	-	91	73.057	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	98	84.892	ENSTSYG00000010797	ZC3H14	99	84.689	Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	91	86.093	ENSCAPG00000010444	ZC3H14	99	83.459	Cavia_aperea
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	87.755	ENSCPOG00000013632	ZC3H14	100	87.755	Cavia_porcellus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	93	88.552	ENSCCAG00000036483	-	100	89.501	Cebus_capucinus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	89.810	ENSCATG00000026685	ZC3H14	100	90.217	Cercocebus_atys
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	88.163	ENSCLAG00000010139	ZC3H14	100	88.163	Chinchilla_lanigera
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	89.810	ENSCSAG00000011569	ZC3H14	100	90.217	Chlorocebus_sabaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	98	80.801	ENSCHOG00000000279	-	100	80.801	Choloepus_hoffmanni
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	75.325	ENSCPBG00000008376	ZC3H14	100	71.525	Chrysemys_picta_bellii
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	89.932	ENSCANG00000036833	ZC3H14	100	90.196	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	95.788	ENSCGRG00001015677	Zc3h14	100	96.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	96	95.628	ENSCGRG00000017688	Zc3h14	100	95.745	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	45.291	ENSCSEG00000013652	zc3h14	100	41.365	Cynoglossus_semilaevis
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	59.763	ENSCVAG00000000590	zc3h14	99	45.950	Cyprinodon_variegatus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	64.000	ENSDARG00000041402	zc3h14	81	64.000	Danio_rerio
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	88.816	ENSDNOG00000010289	ZC3H14	100	86.567	Dasypus_novemcinctus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	83.713	ENSDORG00000009066	Zc3h14	99	89.032	Dipodomys_ordii
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	98	84.177	ENSETEG00000002609	ZC3H14	100	84.022	Echinops_telfairi
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	66	75.641	ENSEBUG00000006140	zc3h14	84	75.641	Eptatretus_burgeri
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	89.946	ENSEASG00005020371	ZC3H14	100	89.946	Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	89.810	ENSECAG00000013214	ZC3H14	100	89.810	Equus_caballus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	96	87.413	ENSEEUG00000003200	-	100	76.731	Erinaceus_europaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	43.838	ENSELUG00000005015	zc3h14	97	50.000	Esox_lucius
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	73	80.332	ENSFCAG00000039611	-	100	83.824	Felis_catus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	88.859	ENSFCAG00000012898	-	100	89.677	Felis_catus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	75.641	ENSFALG00000012422	ZC3H14	100	67.480	Ficedula_albicollis
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	89.116	ENSFDAG00000009953	ZC3H14	100	89.116	Fukomys_damarensis
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	46.825	ENSFHEG00000020403	zc3h14	97	44.860	Fundulus_heteroclitus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	69	61.392	ENSGMOG00000011154	zc3h14	67	63.514	Gadus_morhua
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	77.922	ENSGALG00000010622	ZC3H14	100	69.824	Gallus_gallus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	95	65.493	ENSGAFG00000002915	zc3h14	98	45.007	Gambusia_affinis
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	56.886	ENSGACG00000010599	zc3h14	100	44.282	Gasterosteus_aculeatus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	75.817	ENSGAGG00000005013	ZC3H14	100	71.159	Gopherus_agassizii
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	90.068	ENSGGOG00000010278	ZC3H14	100	90.476	Gorilla_gorilla
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	98	59.748	ENSHBUG00000012522	zc3h14	100	44.311	Haplochromis_burtoni
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	89.116	ENSHGLG00000017715	ZC3H14	100	89.116	Heterocephalus_glaber_female
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	98	88.935	ENSHGLG00100014539	ZC3H14	100	88.935	Heterocephalus_glaber_male
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	98	55.769	ENSHCOG00000007792	zc3h14	100	41.767	Hippocampus_comes
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	94	56.954	ENSIPUG00000015945	zc3h14	100	44.430	Ictalurus_punctatus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	98	90.066	ENSSTOG00000013176	ZC3H14	100	90.196	Ictidomys_tridecemlineatus
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MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	98	62.179	ENSKMAG00000013693	zc3h14	100	46.524	Kryptolebias_marmoratus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	96	64.430	ENSLBEG00000001551	zc3h14	100	46.982	Labrus_bergylta
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	69.595	ENSLACG00000008327	ZC3H14	100	55.061	Latimeria_chalumnae
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	66.443	ENSLOCG00000010387	zc3h14	83	67.606	Lepisosteus_oculatus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	88.158	ENSLAFG00000002998	ZC3H14	100	85.115	Loxodonta_africana
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	89.946	ENSMFAG00000032254	ZC3H14	100	90.353	Macaca_fascicularis
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	89.946	ENSMMUG00000004603	ZC3H14	100	90.353	Macaca_mulatta
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	89.946	ENSMNEG00000013027	ZC3H14	100	90.353	Macaca_nemestrina
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	89.641	ENSMLEG00000031286	ZC3H14	100	90.196	Mandrillus_leucophaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	96	61.146	ENSMAMG00000017380	zc3h14	100	45.681	Mastacembelus_armatus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	98	59.748	ENSMZEG00005016319	zc3h14	100	44.311	Maylandia_zebra
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MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	95.652	ENSMAUG00000022152	Zc3h14	100	96.000	Mesocricetus_auratus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	90.196	ENSMICG00000016669	ZC3H14	100	89.610	Microcebus_murinus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	96.196	ENSMOCG00000014022	Zc3h14	100	96.444	Microtus_ochrogaster
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	82	61.905	ENSMMOG00000015654	zc3h14	87	61.905	Mola_mola
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	79.605	ENSMODG00000003282	ZC3H14	100	79.133	Monodelphis_domestica
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	94	44.367	ENSMALG00000003067	zc3h14	98	62.069	Monopterus_albus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	98.776	ENSMUSG00000021012	Zc3h14	100	98.776	Mus_musculus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0029770	Zc3h14	100	98.776	Mus_pahari
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	98.901	MGP_SPRETEiJ_G0018857	-	84	98.901	Mus_spretus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	97	88.424	ENSMPUG00000008228	ZC3H14	100	88.424	Mustela_putorius_furo
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	100	88.331	ENSMLUG00000016321	ZC3H14	100	88.331	Myotis_lucifugus
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	94.702	ENSNGAG00000017541	Zc3h14	100	94.771	Nannospalax_galili
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	82	60.625	ENSNBRG00000019192	zc3h14	100	61.250	Neolamprologus_brichardi
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	88.158	ENSNLEG00000016907	ZC3H14	100	88.889	Nomascus_leucogenys
MGP_CAROLIEiJ_G0018012	Zc3h14	99	73.446	ENSMEUG00000010740	ZC3H14	100	72.260	Notamacropus_eugenii
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