EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0018020 (Gene tree)
Gene ID: 110306852
Gene Symbol: Nrde2
Alias: 6720454P05Rik|BC002230
Full Name: NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 35074 bases
Position: chr12:94742599-94777672
Accession: 110306852
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0033100	NRDE-2	PF08424.10	4.1e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_CAROLIEiJ_T0033100	-	3714	XM_021178981	MGP_CAROLIEiJ_P0033100	1169 (aa)	XP_021034640	UPI000A31B2EA

Gene Model

Click here to download MGP_CAROLIEiJ_G0018020's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_CAROLIEiJ_G0018020's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	80.673	ENSG00000119720	NRDE2	100	87.255	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	87	48.134	ENSAPOG00000009202	nrde2	99	45.850	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	76.375	ENSAMEG00000001807	NRDE2	99	77.003	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	91	49.081	ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.499	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	87	49.065	ENSAOCG00000015576	nrde2	98	46.502	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	87	49.106	ENSAPEG00000001711	nrde2	99	46.689	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	45.292	ENSATEG00000010247	nrde2	99	45.283	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	98	60.616	ENSAPLG00000015870	NRDE2	99	60.501	Anas_platyrhynchos
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	56.054	ENSACAG00000014571	NRDE2	99	56.436	Anolis_carolinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	77.358	ENSANAG00000025313	NRDE2	99	77.358	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	45.008	ENSACLG00000025154	nrde2	99	44.765	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	81	64.103	ENSAMXG00000034642	nrde2	91	44.250	Astyanax_mexicanus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	75.259	ENSBTAG00000005427	NRDE2	99	75.259	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	79.966	ENSCJAG00000017711	NRDE2	99	79.966	Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	74.128	ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	74.659	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	76.692	ENSCAFG00020016346	NRDE2	99	77.491	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	74.138	ENSCHIG00000005876	NRDE2	99	74.224	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	76.186	ENSTSYG00000000161	NRDE2	99	76.100	Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	97	80.827	ENSCAPG00000012039	NRDE2	99	80.827	Cavia_aperea
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	80.587	ENSCPOG00000002428	NRDE2	99	80.587	Cavia_porcellus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	78.934	ENSCCAG00000024917	NRDE2	99	78.934	Cebus_capucinus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	80.603	ENSCLAG00000015185	NRDE2	99	80.690	Chinchilla_lanigera
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	80.932	ENSCSAG00000011451	NRDE2	99	80.932	Chlorocebus_sabaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	75	76.023	ENSCHOG00000006165	NRDE2	74	76.065	Choloepus_hoffmanni
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	63.333	ENSCPBG00000008537	NRDE2	97	63.784	Chrysemys_picta_bellii
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	80.328	ENSCANG00000029067	NRDE2	99	80.328	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	89.108	ENSCGRG00001015658	Nrde2	99	89.022	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	89.974	ENSCGRG00000005062	Nrde2	99	89.974	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	89	47.838	ENSCSEG00000000089	nrde2	98	48.906	Cynoglossus_semilaevis
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	45.589	ENSCVAG00000023105	nrde2	99	45.212	Cyprinodon_variegatus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	48.083	ENSDARG00000074726	nrde2	99	48.639	Danio_rerio
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	77.663	ENSDNOG00000024057	NRDE2	99	77.692	Dasypus_novemcinctus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	79	81.622	ENSDORG00000003197	Nrde2	99	81.779	Dipodomys_ordii
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	74	68.328	ENSETEG00000000198	NRDE2	74	68.328	Echinops_telfairi
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	40.033	ENSEBUG00000014552	nrde2	99	39.482	Eptatretus_burgeri
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	80.500	ENSEASG00005020675	NRDE2	99	80.500	Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	80.637	ENSECAG00000003862	NRDE2	100	80.036	Equus_caballus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	67	84.962	ENSEEUG00000004026	-	68	85.124	Erinaceus_europaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	48.344	ENSELUG00000005973	nrde2	99	48.457	Esox_lucius
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	77.370	ENSFCAG00000011312	NRDE2	99	78.171	Felis_catus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	60.034	ENSFALG00000012260	NRDE2	99	60.799	Ficedula_albicollis
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	80.776	ENSFDAG00000021350	NRDE2	99	80.776	Fukomys_damarensis
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	45.933	ENSFHEG00000021385	nrde2	99	45.643	Fundulus_heteroclitus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	63	55.833	ENSGMOG00000015815	nrde2	89	55.556	Gadus_morhua
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	59.797	ENSGALG00000010677	NRDE2	99	59.932	Gallus_gallus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	91	47.672	ENSGAFG00000019546	nrde2	97	49.833	Gambusia_affinis
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	48.470	ENSGACG00000012619	nrde2	99	47.786	Gasterosteus_aculeatus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	62.650	ENSGAGG00000003252	NRDE2	99	63.185	Gopherus_agassizii
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	80.500	ENSGGOG00000008835	NRDE2	99	80.500	Gorilla_gorilla
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	45.143	ENSHBUG00000016736	nrde2	99	44.728	Haplochromis_burtoni
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	81.363	ENSHGLG00000006731	NRDE2	99	81.363	Heterocephalus_glaber_female
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	97	81.459	ENSHGLG00100017736	NRDE2	98	81.459	Heterocephalus_glaber_male
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	87	43.914	ENSHCOG00000009559	nrde2	94	43.624	Hippocampus_comes
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	45.477	ENSIPUG00000016129	nrde2	99	45.008	Ictalurus_punctatus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	81.795	ENSSTOG00000001678	NRDE2	99	81.795	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	81.912	ENSJJAG00000000907	Nrde2	99	81.967	Jaculus_jaculus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	45.528	ENSKMAG00000008647	nrde2	99	46.217	Kryptolebias_marmoratus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	89	48.887	ENSLBEG00000021428	nrde2	98	45.429	Labrus_bergylta
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	71	60.386	ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.172	Latimeria_chalumnae
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	52.248	ENSLOCG00000009037	nrde2	99	51.698	Lepisosteus_oculatus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	97	75.853	ENSLAFG00000004966	NRDE2	99	75.877	Loxodonta_africana
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	79	83.189	ENSMMUG00000010442	NRDE2	100	86.765	Macaca_mulatta
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	45.300	ENSMAMG00000013452	nrde2	99	45.581	Mastacembelus_armatus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	45.008	ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.683	Maylandia_zebra
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	84	62.828	ENSMGAG00000013052	NRDE2	99	62.921	Meleagris_gallopavo
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	89.888	ENSMAUG00000018578	Nrde2	99	89.888	Mesocricetus_auratus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	80.759	ENSMICG00000016741	NRDE2	99	80.759	Microcebus_murinus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	86.368	ENSMOCG00000014472	Nrde2	99	86.626	Microtus_ochrogaster
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	73	48.454	ENSMMOG00000004703	nrde2	93	48.339	Mola_mola
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	94	67.228	ENSMODG00000002711	NRDE2	100	67.228	Monodelphis_domestica
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	88	48.381	ENSMALG00000021869	nrde2	91	48.289	Monopterus_albus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	97.867	ENSMUSG00000021179	Nrde2	100	97.867	Mus_musculus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	96.024	MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	96.024	Mus_pahari
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	98.204	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	99	98.204	Mus_spretus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	74.419	ENSMPUG00000008135	NRDE2	99	74.763	Mustela_putorius_furo
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	79.052	ENSMLUG00000007484	NRDE2	99	79.138	Myotis_lucifugus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	84.629	ENSNGAG00000002993	Nrde2	99	84.629	Nannospalax_galili
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	91	47.602	ENSNBRG00000010184	nrde2	97	48.400	Neolamprologus_brichardi
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	97	80.637	ENSNLEG00000017032	NRDE2	100	80.619	Nomascus_leucogenys
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	77	62.653	ENSMEUG00000011097	NRDE2	77	62.486	Notamacropus_eugenii
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	60	83.838	ENSOPRG00000001375	-	60	83.838	Ochotona_princeps
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	97	80.228	ENSODEG00000012422	NRDE2	99	80.228	Octodon_degus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	45.854	ENSONIG00000019512	nrde2	99	45.607	Oreochromis_niloticus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	77.089	ENSOCUG00000010083	NRDE2	99	77.089	Oryctolagus_cuniculus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	87	48.444	ENSORLG00000017730	nrde2	98	45.577	Oryzias_latipes
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	87	47.952	ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.726	Oryzias_latipes_hni
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	87	47.858	ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.435	Oryzias_latipes_hsok
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	87	48.646	ENSOMEG00000010890	nrde2	99	45.957	Oryzias_melastigma
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	79.759	ENSOGAG00000006624	NRDE2	99	79.759	Otolemur_garnettii
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	97	72.487	ENSOARG00000003475	NRDE2	100	72.663	Ovis_aries
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	97	80.316	ENSPPAG00000034133	NRDE2	99	83.514	Pan_paniscus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	77.711	ENSPPRG00000006422	NRDE2	99	78.516	Panthera_pardus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	77.455	ENSPTIG00000009989	NRDE2	99	78.257	Panthera_tigris_altaica
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	80.846	ENSPTRG00000023399	NRDE2	99	80.846	Pan_troglodytes
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	46.550	ENSPKIG00000009331	nrde2	99	46.940	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	62.383	ENSPSIG00000005588	NRDE2	99	62.404	Pelodiscus_sinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	91	45.587	ENSPMGG00000024089	nrde2	90	45.673	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	90.690	ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	90.690	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	54	44.113	ENSPMAG00000003270	-	99	43.666	Petromyzon_marinus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	68.611	ENSPCIG00000018567	NRDE2	98	71.555	Phascolarctos_cinereus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	88	46.922	ENSPFOG00000013217	nrde2	99	45.175	Poecilia_formosa
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	88	47.135	ENSPLAG00000022350	nrde2	99	45.380	Poecilia_latipinna
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	88	47.368	ENSPMEG00000000778	nrde2	99	45.672	Poecilia_mexicana
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	87	47.579	ENSPREG00000009066	nrde2	99	45.552	Poecilia_reticulata
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	83	80.972	ENSPPYG00000006245	NRDE2	99	80.972	Pongo_abelii
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	82	89.231	ENSPCAG00000016399	NRDE2	81	90.566	Procavia_capensis
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	94	79.837	ENSPCOG00000024684	NRDE2	100	79.837	Propithecus_coquereli
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	96	76.393	ENSPVAG00000010023	NRDE2	100	76.393	Pteropus_vampyrus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	98	45.242	ENSPNYG00000022833	nrde2	99	44.743	Pundamilia_nyererei
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	91	48.649	ENSPNAG00000015807	nrde2	92	49.804	Pygocentrus_nattereri
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	91	91.792	ENSRNOG00000004004	Nrde2	100	91.792	Rattus_norvegicus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	79.724	ENSSBOG00000024346	NRDE2	99	79.724	Saimiri_boliviensis_boliviensis
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	69.297	ENSSHAG00000016736	NRDE2	96	69.390	Sarcophilus_harrisii
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	48.336	ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.688	Scleropages_formosus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	44.956	ENSSMAG00000011671	nrde2	98	45.061	Scophthalmus_maximus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	45.594	ENSSDUG00000017948	nrde2	99	46.091	Seriola_dumerili
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	87	48.948	ENSSLDG00000023798	nrde2	98	50.220	Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	86	65.050	ENSSPUG00000006348	NRDE2	96	64.980	Sphenodon_punctatus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	87	49.423	ENSSPAG00000000539	nrde2	99	48.525	Stegastes_partitus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	80.000	ENSSSCG00000002434	NRDE2	99	80.000	Sus_scrofa
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	98	61.719	ENSTGUG00000012462	-	99	61.734	Taeniopygia_guttata
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	79	48.097	ENSTRUG00000002798	nrde2	98	47.859	Takifugu_rubripes
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	94	75.000	ENSTBEG00000011834	NRDE2	94	75.000	Tupaia_belangeri
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	78.085	ENSTTRG00000013583	NRDE2	99	78.085	Tursiops_truncatus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	96	74.489	ENSUAMG00000004159	NRDE2	99	74.688	Ursus_americanus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	96	75.467	ENSUMAG00000006393	NRDE2	99	75.847	Ursus_maritimus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	76.096	ENSVVUG00000018202	NRDE2	99	76.661	Vulpes_vulpes
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	52.956	ENSXETG00000015708	nrde2	99	52.446	Xenopus_tropicalis
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	90	46.555	ENSXCOG00000013298	nrde2	94	46.660	Xiphophorus_couchianus
MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	45.684	ENSXMAG00000009320	nrde2	99	45.350	Xiphophorus_maculatus