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PPI

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Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0018915 (Gene tree)
Gene ID: 110307560
Gene Symbol: Pelo
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1837 bases
Position: chr13:108328754-108330590
Accession: 110307560
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0035530	eRF1_2	PF03464.15	9.5e-37	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0035530	eRF1_3	PF03465.15	1.5e-25	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0035530	eRF1_1	PF03463.15	3e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_CAROLIEiJ_T0035530	-	1600	XM_021179796	MGP_CAROLIEiJ_P0035530	385 (aa)	XP_021035455	UPI000A314960

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	96.883	ENSG00000152684	PELO	100	96.883	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	79.740	ENSAPOG00000023072	pelo	100	79.740	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	64	80.162	ENSAPOG00000023700	-	90	80.162	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	64	80.162	ENSAPOG00000000616	pelo	90	80.162	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	97.143	ENSAMEG00000007734	PELO	100	97.143	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	97	76.944	ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	80.000	ENSAOCG00000023717	pelo	100	80.000	Amphiprion_ocellaris
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MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	77	84.899	ENSAPLG00000013265	PELO	100	84.899	Anas_platyrhynchos
MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	98	90.160	ENSACAG00000004352	PELO	100	89.870	Anolis_carolinensis
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MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	80.519	ENSACLG00000010305	pelo	100	80.519	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	97	80.697	ENSAMXG00000020299	pelo	100	80.052	Astyanax_mexicanus
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MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	97.403	ENSCAFG00020023234	PELO	100	97.403	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	97.403	ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.403	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	97.662	ENSTSYG00000005203	PELO	100	97.662	Carlito_syrichta
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MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	98	93.617	ENSCPBG00000007544	PELO	100	93.247	Chrysemys_picta_bellii
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MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	96.883	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	96.883	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	98.182	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	98.182	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	80.000	ENSCSEG00000008807	pelo	100	80.000	Cynoglossus_semilaevis
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MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	81.818	ENSDARG00000055477	pelo	100	81.818	Danio_rerio
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MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	97.143	ENSEASG00005013348	PELO	100	97.143	Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	80.260	ENSELUG00000023229	pelo	100	80.260	Esox_lucius
MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	97.403	ENSFCAG00000032341	PELO	100	97.403	Felis_catus
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MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	98	80.371	ENSGMOG00000005849	pelo	100	80.260	Gadus_morhua
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MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	98	96.042	ENSOPRG00000018793	PELO	100	96.042	Ochotona_princeps
MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	97.922	ENSODEG00000017579	PELO	100	97.922	Octodon_degus
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MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	81.299	ENSORLG00015014447	pelo	100	81.299	Oryzias_latipes_hsok
MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	82.078	ENSOMEG00000021567	pelo	100	82.078	Oryzias_melastigma
MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	97.403	ENSOGAG00000027940	PELO	100	97.403	Otolemur_garnettii
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MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	96.623	ENSPCIG00000004880	PELO	100	96.623	Phascolarctos_cinereus
MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	82.857	ENSPFOG00000007277	pelo	100	82.857	Poecilia_formosa
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MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	97.403	ENSRROG00000035507	PELO	100	97.403	Rhinopithecus_roxellana
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