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Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0019305 (Gene tree)
Gene ID: 110309086
Gene Symbol: Ipo4
Alias: 8430408O15Rik
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13697 bases
Position: chr14:47048326-47062022
Accession: 110309086
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0036855	IBN_N	PF03810.19	1.1e-09	1	1

Transcripts

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MGP_CAROLIEiJ_T0036866	-	452	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0036855	-	3863	XM_021181491	MGP_CAROLIEiJ_P0036855	1082 (aa)	XP_021037150	UPI000A3160E8
MGP_CAROLIEiJ_T0036856	-	3488	-	MGP_CAROLIEiJ_P0036856	98 (aa)	-	-
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MGP_CAROLIEiJ_T0036859	-	451	-	-	- (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	100	85.714	ENSG00000196497	IPO4	100	85.714	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	46.460	ENSAPOG00000019018	ipo4	99	44.167	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	94	84.783	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	76.503	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	44.756	ENSACIG00000004246	ipo4	99	44.210	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	46.078	ENSAOCG00000004773	ipo4	99	44.250	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	45.993	ENSAPEG00000002112	ipo4	99	44.158	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	94	46.419	ENSATEG00000017082	ipo4	99	45.572	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	49.204	ENSACAG00000003973	-	99	51.001	Anolis_carolinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	100	81.633	ENSANAG00000037973	IPO4	100	81.633	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	45.264	ENSACLG00000019742	ipo4	95	44.892	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	45.432	ENSAMXG00000037878	ipo4	99	43.675	Astyanax_mexicanus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	80.684	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	80.222	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	100	82.653	ENSCJAG00000006937	IPO4	100	82.653	Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	94	89.130	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	81.129	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	81.068	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	79.569	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	94	85.870	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	80.037	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	100	84.694	ENSTSYG00000002643	IPO4	100	84.694	Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	80.370	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	79.352	Cavia_porcellus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	100	84.694	ENSCCAG00000037929	IPO4	100	84.694	Cebus_capucinus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	100	86.735	ENSCATG00000040395	IPO4	100	86.735	Cercocebus_atys
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	81.869	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	81.036	Chinchilla_lanigera
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	53.178	ENSCPBG00000025757	IPO4	94	52.551	Chrysemys_picta_bellii
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	95	34.729	ENSCING00000008639	-	99	35.707	Ciona_intestinalis
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	94	35.000	ENSCSAVG00000011482	-	100	34.808	Ciona_savignyi
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	100	85.714	ENSCANG00000029513	IPO4	100	85.714	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	94	92.391	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	86.044	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	94	92.391	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	85.952	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	45.792	ENSCSEG00000009606	ipo4	99	42.857	Cynoglossus_semilaevis
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	97	44.717	ENSCVAG00000002281	ipo4	99	42.424	Cyprinodon_variegatus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	48.327	ENSDARG00000041493	ipo4	99	46.019	Danio_rerio
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MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	81.869	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	81.129	Dipodomys_ordii
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	100	78.525	ENSETEG00000018381	IPO4	100	77.788	Echinops_telfairi
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	85.567	ENSEASG00005011954	IPO4	96	80.754	Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	85.567	ENSECAG00000009909	IPO4	99	81.129	Equus_caballus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	48.025	ENSELUG00000020628	ipo4	99	45.588	Esox_lucius
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	100	83.673	ENSFCAG00000005587	IPO4	100	83.673	Felis_catus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	77.833	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	72.826	Fukomys_damarensis
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	36.765	ENSFHEG00000009351	ipo4	98	37.685	Fundulus_heteroclitus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	47.719	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.304	Gadus_morhua
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	45.432	ENSGAFG00000005601	ipo4	99	43.446	Gambusia_affinis
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	46.468	ENSGACG00000002276	ipo4	99	44.751	Gasterosteus_aculeatus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	59	44.075	ENSGAGG00000003383	-	78	45.918	Gopherus_agassizii
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MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	45.746	ENSHBUG00000023269	ipo4	94	45.187	Haplochromis_burtoni
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MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	80.481	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	79.648	Heterocephalus_glaber_male
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	43.961	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	42.391	Hippocampus_comes
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MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	81.810	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	81.071	Jaculus_jaculus
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MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	46.144	ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.026	Labrus_bergylta
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	46.830	ENSLACG00000001428	IPO4	99	46.558	Latimeria_chalumnae
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	89	40.217	ENSLOCG00000001149	ipo4	76	48.000	Lepisosteus_oculatus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	94	85.870	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	78.723	Loxodonta_africana
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MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	100	86.735	ENSMMUG00000012481	IPO4	100	86.735	Macaca_mulatta
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	100	86.735	ENSMNEG00000043531	IPO4	100	86.735	Macaca_nemestrina
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	100	86.735	ENSMLEG00000042067	IPO4	100	86.735	Mandrillus_leucophaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	46.173	ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.598	Mastacembelus_armatus
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MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	85.952	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	86.044	Mesocricetus_auratus
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MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	45.879	ENSMALG00000001587	ipo4	99	43.290	Monopterus_albus
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MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	100	99.267	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	100	99.267	Mus_spretus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	94	86.957	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	81.036	Mustela_putorius_furo
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	94	89.130	ENSMLUG00000025277	IPO4	86	80.019	Myotis_lucifugus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	82.979	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	82.239	Nannospalax_galili
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	46.552	ENSNBRG00000005870	ipo4	99	44.640	Neolamprologus_brichardi
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	100	86.735	ENSNLEG00000015326	IPO4	100	86.735	Nomascus_leucogenys
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	97	86.316	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	79.963	Ochotona_princeps
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	80.851	ENSODEG00000002609	IPO4	99	79.833	Octodon_degus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	46.248	ENSONIG00000014574	ipo4	99	44.137	Oreochromis_niloticus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	94	88.043	ENSOCUG00000002881	IPO4	100	80.000	Oryctolagus_cuniculus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	46.535	ENSORLG00000006457	ipo4	99	43.675	Oryzias_latipes
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	46.535	ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.311	Oryzias_latipes_hni
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	46.658	ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.496	Oryzias_latipes_hsok
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	97	45.922	ENSOMEG00000016203	ipo4	99	43.422	Oryzias_melastigma
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	81.036	ENSOGAG00000010642	IPO4	100	80.574	Otolemur_garnettii
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	78.947	ENSOARG00000019188	IPO4	99	78.486	Ovis_aries
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	100	85.714	ENSPPAG00000035476	IPO4	100	85.714	Pan_paniscus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	100	84.694	ENSPPRG00000023607	IPO4	100	84.694	Panthera_pardus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	100	83.673	ENSPTIG00000008720	IPO4	100	83.673	Panthera_tigris_altaica
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	100	85.714	ENSPTRG00000006200	IPO4	100	85.714	Pan_troglodytes
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	100	86.735	ENSPANG00000026278	IPO4	100	86.735	Papio_anubis
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	48.511	ENSPKIG00000007830	ipo4	99	46.494	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	46.766	ENSPKIG00000007683	-	99	45.429	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	43.050	ENSPMGG00000020871	ipo4	99	42.410	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	94	91.304	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	85.291	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	72.304	ENSPCIG00000010718	IPO4	98	71.637	Phascolarctos_cinereus
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