EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0020626 (Gene tree)
Gene ID: 110311568
Gene Symbol: P3h2
Alias: Leprel1
Full Name: prolyl 3-hydroxylase 2
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 144351 bases
Position: chr16:23152536-23296886
Accession: 110311568
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0041121	2OG-FeII_Oxy	PF03171.20	6.4e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_CAROLIEiJ_T0041122	-	593	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0041123	-	382	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0041121	-	3289	-	MGP_CAROLIEiJ_P0041121	703 (aa)	XP_021040615	UPI000A3199B0

Gene Model

Click here to download MGP_CAROLIEiJ_G0020626's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_CAROLIEiJ_G0020626's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	91	50.149	MGP_CAROLIEiJ_G0026394	P3h1	93	50.575

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	97	90.102	ENSG00000090530	P3H2	100	92.220	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	75	63.498	ENSAPOG00000021463	p3h2	100	63.498	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	80	86.453	ENSAMEG00000000726	P3H2	100	86.453	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	60.299	ENSACIG00000012482	p3h2	96	60.299	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	62	65.525	ENSAOCG00000006595	p3h2	96	65.525	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	60.720	ENSAPEG00000006169	p3h2	96	60.720	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	59.641	ENSATEG00000009514	p3h2	96	59.641	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	96	90.133	ENSANAG00000021430	P3H2	100	88.575	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	59.940	ENSACLG00000020074	p3h2	96	59.940	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	60.270	ENSAMXG00000017679	p3h2	96	60.270	Astyanax_mexicanus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	96	92.467	ENSBTAG00000021025	P3H2	100	90.665	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	97	90.365	ENSCJAG00000014239	P3H2	100	88.873	Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	97	90.351	ENSCAFG00000013985	P3H2	100	88.873	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	97	90.351	ENSCAFG00020020127	P3H2	100	88.873	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	96	91.704	ENSCHIG00000011298	P3H2	100	89.675	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	75	92.600	ENSTSYG00000008652	P3H2	100	92.600	Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	78	77.091	ENSCAPG00000012826	P3H2	100	77.091	Cavia_aperea
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	78	88.364	ENSCPOG00000004329	P3H2	95	88.364	Cavia_porcellus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	97	89.927	ENSCCAG00000034046	P3H2	100	88.451	Cebus_capucinus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	97	90.657	ENSCATG00000004107	P3H2	100	89.675	Cercocebus_atys
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	85	89.000	ENSCLAG00000012801	P3H2	100	89.000	Chinchilla_lanigera
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	97	90.365	ENSCSAG00000009034	P3H2	100	89.392	Chlorocebus_sabaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	79	96.992	ENSCHOG00000013468	P3H2	82	96.992	Choloepus_hoffmanni
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	94	72.054	ENSCPBG00000012789	P3H2	97	77.514	Chrysemys_picta_bellii
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	86	91.461	ENSCANG00000017978	P3H2	99	91.461	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	100	93.040	ENSCGRG00001021764	P3h2	100	93.040	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	86	93.432	ENSCGRG00000009640	P3h2	99	93.432	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	60.420	ENSCSEG00000013736	p3h2	95	60.420	Cynoglossus_semilaevis
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	59.220	ENSCVAG00000020470	p3h2	96	59.220	Cyprinodon_variegatus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	59.762	ENSDARG00000103026	p3h2	100	63.208	Danio_rerio
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	100	88.794	ENSDNOG00000035205	P3H2	100	89.220	Dasypus_novemcinctus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	100	88.293	ENSDORG00000001518	P3h2	100	88.858	Dipodomys_ordii
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	97	91.374	ENSEASG00005000187	P3H2	100	90.368	Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	93.134	ENSECAG00000008971	P3H2	100	90.652	Equus_caballus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	97	91.520	ENSFCAG00000000791	P3H2	100	90.254	Felis_catus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	81	69.349	ENSFALG00000007377	P3H2	100	69.349	Ficedula_albicollis
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	60.870	ENSFHEG00000007209	p3h2	95	60.870	Fundulus_heteroclitus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	75	62.712	ENSGMOG00000009134	p3h2	100	62.712	Gadus_morhua
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	74.513	ENSGALG00000040866	P3H2	96	74.513	Gallus_gallus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	61.019	ENSGAFG00000013603	p3h2	96	61.019	Gambusia_affinis
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	75	62.335	ENSGACG00000010066	p3h2	100	62.335	Gasterosteus_aculeatus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	88	69.510	ENSGAGG00000025337	-	91	69.510	Gopherus_agassizii
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	100	88.169	ENSGGOG00000009749	P3H2	100	89.155	Gorilla_gorilla
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	75	55.218	ENSHBUG00000022967	p3h2	100	55.218	Haplochromis_burtoni
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	96	87.556	ENSHGLG00000019175	P3H2	100	85.955	Heterocephalus_glaber_female
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	54.694	ENSHCOG00000019274	p3h2	97	54.694	Hippocampus_comes
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	58.171	ENSIPUG00000016970	p3h2	96	58.171	Ictalurus_punctatus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	97	90.936	ENSSTOG00000006501	P3H2	100	89.943	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	78	90.727	ENSJJAG00000013941	P3h2	95	90.563	Jaculus_jaculus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	94	61.203	ENSKMAG00000022098	p3h2	97	61.319	Kryptolebias_marmoratus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	60.268	ENSLBEG00000003942	p3h2	97	60.268	Labrus_bergylta
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	65.719	ENSLACG00000014642	P3H2	96	65.719	Latimeria_chalumnae
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	62.969	ENSLOCG00000005129	p3h2	96	62.969	Lepisosteus_oculatus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	100	89.631	ENSLAFG00000007727	P3H2	100	90.631	Loxodonta_africana
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	97	90.351	ENSMFAG00000036104	P3H2	100	89.392	Macaca_fascicularis
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	97	90.205	ENSMMUG00000000623	P3H2	100	89.250	Macaca_mulatta
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	97	90.351	ENSMNEG00000027261	P3H2	100	89.392	Macaca_nemestrina
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	75	61.977	ENSMAMG00000006370	p3h2	100	61.977	Mastacembelus_armatus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	59.940	ENSMZEG00005003110	p3h2	96	59.940	Maylandia_zebra
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	78	75.912	ENSMGAG00000007491	P3H2	100	75.912	Meleagris_gallopavo
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	100	92.472	ENSMAUG00000004803	P3h2	100	92.472	Mesocricetus_auratus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	100	90.341	ENSMICG00000049208	P3H2	100	90.625	Microcebus_murinus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	100	93.617	ENSMOCG00000008061	P3h2	100	93.617	Microtus_ochrogaster
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	59.731	ENSMMOG00000019576	p3h2	96	59.731	Mola_mola
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	63.918	ENSMODG00000015073	P3H2	95	63.918	Monodelphis_domestica
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	59.820	ENSMALG00000017825	p3h2	96	59.820	Monopterus_albus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	100	99.004	ENSMUSG00000038168	P3h2	100	99.004	Mus_musculus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	100	97.582	MGP_PahariEiJ_G0016331	P3h2	100	97.582	Mus_pahari
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	100	98.720	MGP_SPRETEiJ_G0021522	P3h2	100	98.720	Mus_spretus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	76	95.833	ENSMPUG00000003446	P3H2	89	95.833	Mustela_putorius_furo
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	78	90.364	ENSMLUG00000015613	P3H2	100	90.364	Myotis_lucifugus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	85	85.358	ENSNGAG00000000626	P3h2	98	85.358	Nannospalax_galili
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	58.146	ENSNBRG00000016641	p3h2	97	58.146	Neolamprologus_brichardi
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	75	91.841	ENSNLEG00000006734	-	100	91.841	Nomascus_leucogenys
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	97	90.205	ENSOPRG00000014074	P3H2	100	88.732	Ochotona_princeps
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	99	57.305	ENSONIG00000001714	p3h2	96	59.193	Oreochromis_niloticus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	71	83.968	ENSOANG00000013797	P3H2	99	83.968	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	96	92.047	ENSOCUG00000011014	P3H2	100	90.550	Oryctolagus_cuniculus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	94	59.309	ENSORLG00000005641	p3h2	96	59.370	Oryzias_latipes
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	88	58.871	ENSORLG00020021674	p3h2	95	58.937	Oryzias_latipes_hni
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	94	59.459	ENSORLG00015019012	p3h2	96	59.520	Oryzias_latipes_hsok
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	59.910	ENSOMEG00000013713	p3h2	96	59.910	Oryzias_melastigma
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	78	90.563	ENSOGAG00000003842	P3H2	100	90.563	Otolemur_garnettii
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	96	91.605	ENSOARG00000020475	P3H2	100	89.592	Ovis_aries
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	86	91.928	ENSPPAG00000040013	P3H2	95	91.928	Pan_paniscus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	97	91.082	ENSPPRG00000014656	P3H2	100	89.831	Panthera_pardus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	84	92.749	ENSPTIG00000016608	P3H2	84	92.749	Panthera_tigris_altaica
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	97	90.247	ENSPTRG00000015736	P3H2	100	89.437	Pan_troglodytes
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	97	90.511	ENSPANG00000005379	P3H2	100	89.533	Papio_anubis
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	58.859	ENSPMGG00000012834	p3h2	97	58.859	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	100	93.040	ENSPEMG00000016547	P3h2	100	93.466	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	61.319	ENSPFOG00000014376	p3h2	96	61.319	Poecilia_formosa
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	61.169	ENSPLAG00000012556	p3h2	96	61.169	Poecilia_latipinna
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	61.019	ENSPMEG00000010685	p3h2	95	61.019	Poecilia_mexicana
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	59.070	ENSPREG00000015431	p3h2	96	58.471	Poecilia_reticulata
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	100	89.563	ENSPVAG00000009057	P3H2	100	89.845	Pteropus_vampyrus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	60.239	ENSPNYG00000005890	p3h2	96	60.239	Pundamilia_nyererei
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	60.896	ENSPNAG00000029093	p3h2	97	60.896	Pygocentrus_nattereri
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	100	96.871	ENSRNOG00000055751	P3h2	100	96.871	Rattus_norvegicus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	97	90.219	ENSRBIG00000018185	P3H2	100	89.250	Rhinopithecus_bieti
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	100	89.362	ENSRROG00000031164	P3H2	100	89.362	Rhinopithecus_roxellana
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	87	88.543	ENSSBOG00000035056	P3H2	100	88.543	Saimiri_boliviensis_boliviensis
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	78	64.899	ENSSHAG00000006714	-	100	64.899	Sarcophilus_harrisii
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	61.411	ENSSFOG00015006816	p3h2	96	61.411	Scleropages_formosus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	61.619	ENSSMAG00000003284	p3h2	95	61.619	Scophthalmus_maximus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	60.420	ENSSDUG00000002767	p3h2	96	60.420	Seriola_dumerili
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	60.420	ENSSLDG00000017365	p3h2	96	60.420	Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	79	62.007	ENSSPUG00000010809	P3H2	98	63.262	Sphenodon_punctatus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	60.270	ENSSPAG00000021635	p3h2	96	60.270	Stegastes_partitus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	96	91.445	ENSSSCG00000011813	P3H2	100	89.718	Sus_scrofa
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	78	75.592	ENSTGUG00000009345	P3H2	100	75.592	Taeniopygia_guttata
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	60.511	ENSTRUG00000017655	p3h2	96	60.511	Takifugu_rubripes
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	78	61.749	ENSTNIG00000015540	p3h2	100	61.749	Tetraodon_nigroviridis
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	100	73.239	ENSTBEG00000004997	P3H2	100	74.930	Tupaia_belangeri
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	92	89.368	ENSTTRG00000001893	P3H2	100	89.368	Tursiops_truncatus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	78	86.438	ENSUAMG00000006549	P3H2	98	87.199	Ursus_americanus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	78	92.336	ENSUMAG00000003698	P3H2	97	92.393	Ursus_maritimus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	80	84.425	ENSVPAG00000012351	P3H2	100	84.425	Vicugna_pacos
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	90	88.594	ENSVVUG00000013454	P3H2	99	90.193	Vulpes_vulpes
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	79	68.953	ENSXETG00000012845	p3h2	100	68.953	Xenopus_tropicalis
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	59.520	ENSXCOG00000002798	p3h2	97	58.982	Xiphophorus_couchianus
MGP_CAROLIEiJ_G0020626	P3h2	95	60.270	ENSXMAG00000018362	p3h2	96	60.270	Xiphophorus_maculatus