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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0021476 (Gene tree)
Gene ID: 110312413
Gene Symbol: Dxo
Alias: Dom3z
Full Name: decapping exoribonuclease
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2222 bases
Position: chr17:31571780-31574001
Accession: 110312413
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0044303	RAI1	PF08652.11	9.2e-24	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0044296	RAI1	PF08652.11	9.3e-23	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0044294	RAI1	PF08652.11	1.3e-22	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0044295	RAI1	PF08652.11	1.3e-22	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0044299	RAI1	PF08652.11	1.5e-12	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0044304	RAI1	PF08652.11	7.7e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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MGP_CAROLIEiJ_T0044297	-	956	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0044296	-	1117	-	MGP_CAROLIEiJ_P0044296	304 (aa)	-	-
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MGP_CAROLIEiJ_T0044294	-	1447	XM_021185984	MGP_CAROLIEiJ_P0044294	397 (aa)	XP_021041643	UPI000A316202

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	90.678	ENSG00000204348	DXO	100	90.152	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	99	54.701	ENSAPOG00000017890	DXO	89	52.332	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	89.831	ENSAMEG00000002151	DXO	100	86.398	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	99	54.701	ENSAOCG00000001719	DXO	84	54.144	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	99	54.701	ENSAPEG00000012237	DXO	84	54.696	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	99	52.137	ENSATEG00000024423	DXO	84	52.446	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	99	63.934	ENSACAG00000012071	DXO	96	61.266	Anolis_carolinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	92.373	ENSANAG00000020757	DXO	92	90.404	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	54.237	ENSACLG00000027873	DXO	91	51.918	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	55.085	ENSAMXG00000032987	DXO	87	55.890	Astyanax_mexicanus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	91.525	ENSBTAG00000005588	DXO	100	86.432	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	97	32.759	WBGene00001050	dom-3	63	32.714	Caenorhabditis_elegans
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	91.525	ENSCJAG00000002246	DXO	100	90.657	Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	89.831	ENSCAFG00000000694	DXO	99	86.141	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	89.831	ENSCAFG00020000953	DXO	100	87.154	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	89.145	ENSCHIG00000024555	DXO	99	88.372	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	89.831	ENSTSYG00000037337	DXO	100	87.626	Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	93.220	ENSCAPG00000008333	-	100	93.220	Cavia_aperea
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	93.220	ENSCPOG00000015108	DXO	100	91.270	Cavia_porcellus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	92.373	ENSCCAG00000036575	DXO	100	91.414	Cebus_capucinus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	89.831	ENSCATG00000001700	DXO	100	89.646	Cercocebus_atys
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	89.831	ENSCLAG00000006682	DXO	100	90.476	Chinchilla_lanigera
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	89.831	ENSCSAG00000009007	DXO	100	89.646	Chlorocebus_sabaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	60.169	ENSCPBG00000001233	DXO	92	64.365	Chrysemys_picta_bellii
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	92	42.202	ENSCING00000000512	-	99	39.617	Ciona_intestinalis
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	81	53.333	ENSCSAVG00000009527	-	99	38.398	Ciona_savignyi
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	89.474	ENSCANG00000039839	DXO	100	89.394	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	95.238	ENSCGRG00001001718	Dxo	100	95.238	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	99	56.410	ENSCSEG00000014295	DXO	87	52.830	Cynoglossus_semilaevis
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	55.000	ENSCVAG00000019072	DXO	87	55.858	Cyprinodon_variegatus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	88.983	ENSDNOG00000038155	DXO	100	87.657	Dasypus_novemcinctus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	90.678	ENSDORG00000011708	Dxo	98	88.235	Dipodomys_ordii
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	84.211	ENSETEG00000009525	DXO	100	85.025	Echinops_telfairi
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	50.847	ENSEBUG00000003794	DXO	83	52.747	Eptatretus_burgeri
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	92.373	ENSEASG00005015528	DXO	100	91.270	Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	92.373	ENSECAG00000019694	DXO	100	91.270	Equus_caballus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	83.051	ENSEEUG00000005411	DXO	100	83.920	Erinaceus_europaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	52.542	ENSELUG00000005464	DXO	82	53.994	Esox_lucius
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	91.525	ENSFCAG00000004520	DXO	100	87.657	Felis_catus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	92.373	ENSFDAG00000004264	DXO	98	93.966	Fukomys_damarensis
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	99	52.991	ENSFHEG00000014408	DXO	86	55.464	Fundulus_heteroclitus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	51.667	ENSGMOG00000008886	DXO	89	52.877	Gadus_morhua
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	99	54.701	ENSGAFG00000020264	DXO	88	54.278	Gambusia_affinis
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	99	52.991	ENSGACG00000011578	DXO	91	54.270	Gasterosteus_aculeatus
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MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	88.889	ENSHGLG00100013105	DXO	100	88.889	Heterocephalus_glaber_male
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MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	54.237	ENSHCOG00000018279	DXO	88	54.223	Hippocampus_comes
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	99	52.137	ENSHCOG00000013410	-	88	45.906	Hippocampus_comes
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	54.237	ENSIPUG00000002976	dxo	87	55.278	Ictalurus_punctatus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	91.525	ENSSTOG00000027075	DXO	100	89.683	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	89.683	ENSJJAG00000016118	Dxo	100	86.902	Jaculus_jaculus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	98	53.448	ENSKMAG00000018985	DXO	88	54.032	Kryptolebias_marmoratus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	99	53.846	ENSLBEG00000025439	DXO	86	53.134	Labrus_bergylta
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MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	52.941	ENSLOCG00000008086	DXO	91	54.847	Lepisosteus_oculatus
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MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	89.831	ENSMFAG00000042173	DXO	100	89.646	Macaca_fascicularis
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	90.132	ENSMMUG00000000741	DXO	100	89.899	Macaca_mulatta
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	89.831	ENSMNEG00000032201	DXO	100	89.394	Macaca_nemestrina
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	89.831	ENSMLEG00000035257	DXO	100	89.646	Mandrillus_leucophaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	54.237	ENSMZEG00005003714	DXO	91	51.918	Maylandia_zebra
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	92.373	ENSMAUG00000022102	Dxo	100	89.950	Mesocricetus_auratus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	89.831	ENSMICG00000016605	DXO	99	89.394	Microcebus_murinus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	95.238	ENSMOCG00000005928	Dxo	100	95.238	Microtus_ochrogaster
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	99	85.470	ENSMODG00000015027	DXO	83	80.226	Monodelphis_domestica
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	100.000	ENSMUSG00000040482	Dxo	100	99.206	Mus_musculus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	98.355	MGP_PahariEiJ_G0020471	Dxo	100	98.355	Mus_pahari
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0022381	Dxo	100	100.000	Mus_spretus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	90.678	ENSMPUG00000010562	DXO	100	84.635	Mustela_putorius_furo
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	91.525	ENSMLUG00000027577	DXO	98	88.451	Myotis_lucifugus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	89.831	ENSNGAG00000021244	Dxo	100	88.161	Nannospalax_galili
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	54.237	ENSNBRG00000001675	DXO	91	52.174	Neolamprologus_brichardi
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	91.525	ENSNLEG00000006470	DXO	100	90.404	Nomascus_leucogenys
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	88.136	ENSMEUG00000006110	DXO	99	80.952	Notamacropus_eugenii
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	88.136	ENSODEG00000017552	DXO	100	91.270	Octodon_degus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	53.390	ENSONIG00000017143	DXO	99	51.365	Oreochromis_niloticus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	89.474	ENSOCUG00000007029	DXO	100	89.169	Oryctolagus_cuniculus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	98	51.724	ENSORLG00000008743	DXO	86	54.076	Oryzias_latipes
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	98	51.724	ENSORLG00020018952	DXO	86	53.678	Oryzias_latipes_hni
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	98	50.862	ENSORLG00015008419	DXO	86	53.533	Oryzias_latipes_hsok
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	98	51.724	ENSOMEG00000011105	DXO	86	54.521	Oryzias_melastigma
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	92.373	ENSOGAG00000009590	DXO	99	89.646	Otolemur_garnettii
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	89.474	ENSOARG00000002332	DXO	84	89.625	Ovis_aries
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	90.678	ENSPPAG00000041236	DXO	100	90.152	Pan_paniscus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	91.525	ENSPPRG00000005199	DXO	100	87.406	Panthera_pardus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	91.525	ENSPTIG00000021529	DXO	100	87.154	Panthera_tigris_altaica
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	90.678	ENSPTRG00000045498	-	100	90.152	Pan_troglodytes
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	90.678	ENSPTRG00000052503	-	100	90.404	Pan_troglodytes
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	89.831	ENSPANG00000017587	DXO	100	89.646	Papio_anubis
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	95	53.819	ENSPMGG00000022188	DXO	85	50.820	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	94.068	ENSPEMG00000009229	Dxo	99	94.444	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	55.932	ENSPMAG00000008156	DXO	99	56.338	Petromyzon_marinus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	100	86.441	ENSPCIG00000018793	DXO	100	80.451	Phascolarctos_cinereus
MGP_CAROLIEiJ_G0021476	Dxo	99	52.991	ENSPFOG00000004778	DXO	88	54.011	Poecilia_formosa
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