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PPI

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Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0022902 (Gene tree)
Gene ID: 110285648
Gene Symbol: Rpp30
Alias: Rnasep2|TSG15
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p30
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 21443 bases
Position: chr19:32643261-32664703
Accession: 110285648
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0048627	RNase_P_p30	PF01876.16	4.8e-62	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_CAROLIEiJ_T0048627	-	1152	XM_021151968	MGP_CAROLIEiJ_P0048627	268 (aa)	XP_021007627	UPI000A316F45

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	90.262	ENSG00000148688	RPP30	99	90.262	Homo_sapiens
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MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	91.760	ENSAMEG00000016776	RPP30	99	91.760	Ailuropoda_melanoleuca
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MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	100	54.444	ENSAPEG00000008697	rpp30	90	54.444	Amphiprion_percula
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MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	90	72.917	ENSAPLG00000009959	RPP30	99	72.917	Anas_platyrhynchos
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MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	89.888	ENSCAFG00000031801	RPP30	99	89.888	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	89.888	ENSCAFG00020000258	RPP30	99	89.888	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	88.390	ENSCHIG00000012901	RPP30	99	88.390	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	91.698	ENSTSYG00000013903	RPP30	99	91.386	Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	89	71.548	ENSCAPG00000001326	RPP30	99	71.548	Cavia_aperea
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	91.386	ENSCPOG00000033174	RPP30	99	91.386	Cavia_porcellus
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MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	89.888	ENSCSAG00000006694	RPP30	99	89.888	Chlorocebus_sabaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	87	51.562	ENSCHOG00000007023	-	100	51.562	Choloepus_hoffmanni
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	75.188	ENSCPBG00000026518	RPP30	99	75.188	Chrysemys_picta_bellii
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	87	42.562	ENSCING00000019714	-	89	41.736	Ciona_intestinalis
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	87	40.323	ENSCSAVG00000011282	-	80	40.323	Ciona_savignyi
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	89.888	ENSCANG00000041084	RPP30	99	89.888	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	87	96.552	ENSCGRG00001017068	-	97	96.552	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	79.401	ENSCGRG00001000834	-	99	79.401	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	79.775	ENSCGRG00000006196	-	99	79.775	Cricetulus_griseus_crigri
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MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	51.648	ENSCSEG00000001779	rpp30	93	51.648	Cynoglossus_semilaevis
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MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	58.801	ENSDARG00000027428	rpp30	99	58.801	Danio_rerio
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	90.637	ENSDNOG00000010186	RPP30	92	90.637	Dasypus_novemcinctus
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MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	87	35.270	FBgn0283652	Rpp30	78	35.270	Drosophila_melanogaster
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	87.266	ENSETEG00000018823	RPP30	99	87.266	Echinops_telfairi
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	56	39.216	ENSEBUG00000003989	-	83	39.216	Eptatretus_burgeri
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MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	100	90.672	ENSECAG00000021917	RPP30	100	90.672	Equus_caballus
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MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	72.285	ENSFALG00000007711	RPP30	99	72.285	Ficedula_albicollis
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MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	93	55.020	ENSFHEG00000014739	rpp30	97	53.498	Fundulus_heteroclitus
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MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	72.932	ENSGAGG00000000980	RPP30	69	72.932	Gopherus_agassizii
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MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	54.982	ENSLBEG00000019989	rpp30	99	54.982	Labrus_bergylta
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MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	97.753	MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	97.753	Mus_pahari
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	98.876	MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	99	98.876	Mus_spretus
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	91.698	ENSMPUG00000017258	RPP30	93	91.698	Mustela_putorius_furo
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	100	90.672	ENSMLUG00000017169	RPP30	100	90.672	Myotis_lucifugus
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MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	92.509	ENSNGAG00000012018	-	99	92.509	Nannospalax_galili
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	92	47.581	ENSNBRG00000024170	-	92	47.581	Neolamprologus_brichardi
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	90.637	ENSNLEG00000012383	RPP30	99	90.637	Nomascus_leucogenys
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MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	98	92.015	ENSODEG00000004530	-	100	92.015	Octodon_degus
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	67.790	ENSODEG00000004560	-	99	67.790	Octodon_degus
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	77	54.106	ENSONIG00000019140	rpp30	100	54.106	Oreochromis_niloticus
MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	100	79.478	ENSOANG00000003415	RPP30	100	79.478	Ornithorhynchus_anatinus
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MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	90.189	ENSPTRG00000002742	RPP30	99	87.266	Pan_troglodytes
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