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PPI

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Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0023133 (Gene tree)
Gene ID: 110287927
Gene Symbol: Rpp38
Alias: C330006A15Rik
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p38
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3673 bases
Position: chr2:234896-238568
Accession: 110287927
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0049332	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	9.7e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_CAROLIEiJ_T0049332	-	1047	XM_021154428	MGP_CAROLIEiJ_P0049332	280 (aa)	XP_021010074	UPI000A31B124

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
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MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	72.887	ENSAMEG00000018832	RPP38	100	73.333	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	88	45.736	ENSACIG00000011592	rpp38	92	44.569	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	94	43.902	ENSAOCG00000017293	rpp38	97	43.643	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	94	45.788	ENSAPEG00000002315	rpp38	96	45.487	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	96	47.636	ENSATEG00000000731	rpp38	98	46.909	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	91	48.062	ENSAPLG00000002054	RPP38	96	48.519	Anas_platyrhynchos
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	94	43.382	ENSACLG00000016958	rpp38	97	43.165	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	94	43.015	ENSACLG00000016962	rpp38	97	42.806	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	89	42.169	ENSAMXG00000025023	rpp38	94	43.233	Astyanax_mexicanus
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MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	72.183	ENSCAFG00020008008	RPP38	100	72.632	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	68.070	ENSCHIG00000012484	RPP38	100	68.070	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	72.982	ENSCPOG00000003981	RPP38	100	72.982	Cavia_porcellus
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	76.842	ENSCLAG00000010194	RPP38	100	76.842	Chinchilla_lanigera
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	94	77.068	ENSCSAG00000019055	RPP38	100	76.761	Chlorocebus_sabaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	77.193	ENSCHOG00000004335	RPP38	100	76.842	Choloepus_hoffmanni
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	84.342	ENSCGRG00001001395	Rpp38	100	85.409	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	84.342	ENSCGRG00000017441	Rpp38	100	85.409	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	94	42.806	ENSCSEG00000001721	rpp38	99	43.056	Cynoglossus_semilaevis
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MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	73.944	ENSDNOG00000040314	RPP38	100	73.944	Dasypus_novemcinctus
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MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	71.731	ENSETEG00000002839	RPP38	100	71.731	Echinops_telfairi
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MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	99	68.683	ENSEEUG00000014677	RPP38	99	68.683	Erinaceus_europaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	88	43.382	ENSELUG00000010160	rpp38	94	43.972	Esox_lucius
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MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	91	50.195	ENSFALG00000014804	RPP38	93	50.929	Ficedula_albicollis
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	75.088	ENSFDAG00000018669	RPP38	100	75.088	Fukomys_damarensis
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	95	41.993	ENSFHEG00000013741	rpp38	97	42.657	Fundulus_heteroclitus
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	91	50.192	ENSGALG00000008794	RPP38	91	49.815	Gallus_gallus
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	57	50.625	ENSGACG00000009258	rpp38	97	49.375	Gasterosteus_aculeatus
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	94	43.382	ENSHBUG00000010937	rpp38	97	43.525	Haplochromis_burtoni
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	72.982	ENSHGLG00000012144	RPP38	100	72.982	Heterocephalus_glaber_female
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MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	94	43.382	ENSMZEG00005003189	rpp38	97	43.525	Maylandia_zebra
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	91	47.510	ENSMGAG00000008217	RPP38	91	48.339	Meleagris_gallopavo
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MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	86.525	ENSMOCG00000007020	Rpp38	100	85.816	Microtus_ochrogaster
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MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	94	71.429	ENSOCUG00000022768	-	100	71.831	Oryctolagus_cuniculus
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	90	43.295	ENSORLG00000009219	rpp38	96	43.590	Oryzias_latipes
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MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	93	42.379	ENSORLG00015017702	rpp38	94	43.262	Oryzias_latipes_hsok
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MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	76.140	ENSPPAG00000041577	RPP38	91	76.140	Pan_paniscus
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	71.479	ENSPPRG00000015329	RPP38	100	71.479	Panthera_pardus
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MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	76.140	ENSPTRG00000002318	RPP38	91	76.140	Pan_troglodytes
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MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	96	53.285	ENSPSIG00000001527	RPP38	97	53.285	Pelodiscus_sinensis
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MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	66.197	ENSPCIG00000009096	RPP38	94	66.197	Phascolarctos_cinereus
MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	62	47.253	ENSPFOG00000016823	rpp38	82	47.253	Poecilia_formosa
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MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	94	43.223	ENSSPAG00000020387	rpp38	99	41.844	Stegastes_partitus
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MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	73.592	ENSUAMG00000002618	RPP38	100	74.035	Ursus_americanus
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