EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0024944 (Gene tree)
Gene ID: 110291178
Gene Symbol: Adad1
Alias: -
Full Name: adenosine deaminase domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 54389 bases
Position: chr3:31896778-31951166
Accession: 110291178
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0057412	dsrm	PF00035.26	1e-10	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0057411	dsrm	PF00035.26	1.3e-10	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0057411	A_deamin	PF02137.18	3.6e-90	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0057412	A_deamin	PF02137.18	4.7e-80	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0057415	A_deamin	PF02137.18	1.3e-47	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_CAROLIEiJ_T0057415	-	668	-	MGP_CAROLIEiJ_P0057415	200 (aa)	-	UPI0000EE04F2
MGP_CAROLIEiJ_T0057414	-	475	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0057411	-	3102	-	MGP_CAROLIEiJ_P0057411	619 (aa)	XP_021013824	UPI0000022CA2
MGP_CAROLIEiJ_T0057413	-	714	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0057412	-	1839	-	MGP_CAROLIEiJ_P0057412	548 (aa)	-	UPI000198D170

Gene Model

Click here to download MGP_CAROLIEiJ_G0024944's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_CAROLIEiJ_G0024944's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	87	37.288	MGP_CAROLIEiJ_G0031624	Adad2	83	34.331

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	89.234	ENSG00000164113	ADAD1	100	89.445	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	57.692	ENSAPOG00000004214	adad1	94	50.197	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	89.445	ENSAMEG00000005920	ADAD1	100	91.552	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	54.396	ENSACIG00000019144	adad1	98	47.140	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	56.593	ENSAOCG00000012507	adad1	90	50.781	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	56.593	ENSAPEG00000000903	adad1	95	50.996	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	59.016	ENSATEG00000006279	adad1	99	48.438	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	92	69.945	ENSAPLG00000006694	ADAD1	99	59.966	Anas_platyrhynchos
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	81.868	ENSACAG00000011970	ADAD1	99	72.758	Anolis_carolinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	79.273	ENSANAG00000019704	-	97	83.173	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	85.868	ENSANAG00000034045	-	99	87.326	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	57.143	ENSACLG00000013906	adad1	96	49.802	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	58	44.681	ENSACLG00000013974	adad1	99	46.505	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	62.088	ENSAMXG00000016301	adad1	99	50.340	Astyanax_mexicanus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	87.299	ENSCJAG00000002796	ADAD1	99	88.870	Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	90.877	ENSCAFG00000004013	ADAD1	99	93.135	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	90.877	ENSCAFG00020018271	ADAD1	96	88.853	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	89.267	ENSCHIG00000026052	ADAD1	99	87.702	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	84.670	ENSTSYG00000008859	ADAD1	99	87.024	Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	80.680	ENSCPOG00000014455	ADAD1	100	80.032	Cavia_porcellus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	88.372	ENSCCAG00000020664	ADAD1	99	89.757	Cebus_capucinus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	88.730	ENSCATG00000023127	ADAD1	100	90.698	Cercocebus_atys
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	85.510	ENSCLAG00000004688	ADAD1	100	85.161	Chinchilla_lanigera
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	88.193	ENSCSAG00000003673	ADAD1	99	89.757	Chlorocebus_sabaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	87.857	ENSCHOG00000000966	ADAD1	99	89.775	Choloepus_hoffmanni
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	81.868	ENSCPBG00000024656	ADAD1	100	71.160	Chrysemys_picta_bellii
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	90.146	ENSCANG00000036024	ADAD1	99	90.037	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	97.900	ENSCGRG00001010493	Adad1	100	97.900	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	95.886	ENSCGRG00000008807	Adad1	100	95.888	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	57.692	ENSCSEG00000004516	adad1	89	48.413	Cynoglossus_semilaevis
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	92	54.645	ENSCVAG00000022422	adad1	93	48.824	Cyprinodon_variegatus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	59.890	ENSDARG00000089181	adad1	97	50.826	Danio_rerio
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	89.803	ENSDNOG00000014986	ADAD1	99	88.387	Dasypus_novemcinctus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	88.909	ENSDORG00000015684	Adad1	100	87.923	Dipodomys_ordii
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	86.631	ENSETEG00000005199	ADAD1	99	88.581	Echinops_telfairi
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	43.716	ENSEBUG00000008684	-	88	41.007	Eptatretus_burgeri
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	88.909	ENSEASG00005018202	ADAD1	99	89.465	Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	99	89.068	ENSECAG00000016639	ADAD1	98	91.304	Equus_caballus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	63	88.649	ENSEEUG00000010513	-	66	88.649	Erinaceus_europaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	60.870	ENSELUG00000022167	adad1	99	50.172	Esox_lucius
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	88.730	ENSFCAG00000019180	ADAD1	99	90.972	Felis_catus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	92	67.213	ENSFALG00000008219	ADAD1	86	62.398	Ficedula_albicollis
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	81.932	ENSFDAG00000010164	ADAD1	100	81.129	Fukomys_damarensis
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	54.396	ENSFHEG00000020841	adad1	99	46.575	Fundulus_heteroclitus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	46.154	ENSGMOG00000002821	adad1	82	61.538	Gadus_morhua
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	59	55.952	ENSGALG00000044995	-	89	58.929	Gallus_gallus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	92	56.284	ENSGAFG00000017716	adad1	99	47.170	Gambusia_affinis
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	54.945	ENSGACG00000016712	adad1	100	49.299	Gasterosteus_aculeatus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	86	70.534	ENSGAGG00000013883	ADAD1	93	73.518	Gopherus_agassizii
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	93	87.548	ENSGGOG00000004388	ADAD1	99	89.239	Gorilla_gorilla
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	57.143	ENSHBUG00000020450	adad1	87	46.287	Haplochromis_burtoni
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	81.932	ENSHGLG00000003874	ADAD1	99	81.954	Heterocephalus_glaber_female
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	75.365	ENSHGLG00100000772	ADAD1	100	75.365	Heterocephalus_glaber_male
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	53.846	ENSHCOG00000003944	adad1	96	47.000	Hippocampus_comes
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	56.593	ENSIPUG00000007574	adad1	98	48.427	Ictalurus_punctatus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	89.624	ENSSTOG00000027523	ADAD1	100	90.049	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	92.581	ENSJJAG00000022661	Adad1	100	92.581	Jaculus_jaculus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	56.593	ENSKMAG00000008195	adad1	99	48.007	Kryptolebias_marmoratus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	57.692	ENSLBEG00000001334	adad1	99	45.804	Labrus_bergylta
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	65.026	ENSLACG00000004540	ADAD1	99	66.724	Latimeria_chalumnae
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	59.669	ENSLOCG00000002873	adad1	99	49.138	Lepisosteus_oculatus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	89.624	ENSLAFG00000012345	ADAD1	100	91.065	Loxodonta_africana
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	88.730	ENSMFAG00000003813	ADAD1	99	90.406	Macaca_fascicularis
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	88.730	ENSMMUG00000004572	ADAD1	99	90.406	Macaca_mulatta
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	88.730	ENSMNEG00000032586	ADAD1	99	90.406	Macaca_nemestrina
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	88.730	ENSMLEG00000011428	ADAD1	100	90.698	Mandrillus_leucophaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	58.242	ENSMAMG00000015290	adad1	99	49.405	Mastacembelus_armatus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	57.143	ENSMZEG00005002920	adad1	99	47.314	Maylandia_zebra
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	92	68.852	ENSMGAG00000010585	ADAD1	99	62.602	Meleagris_gallopavo
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	97.577	ENSMAUG00000018314	Adad1	100	97.577	Mesocricetus_auratus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	90.519	ENSMICG00000015912	ADAD1	99	92.708	Microcebus_murinus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	96.769	ENSMOCG00000013223	Adad1	100	96.769	Microtus_ochrogaster
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	56.044	ENSMMOG00000003761	adad1	96	49.702	Mola_mola
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	83.929	ENSMODG00000018918	ADAD1	99	86.135	Monodelphis_domestica
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	54.945	ENSMALG00000015338	adad1	96	46.248	Monopterus_albus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	100.000	ENSMUSG00000027719	Adad1	100	100.000	Mus_musculus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	97.263	MGP_PahariEiJ_G0026384	Adad1	100	97.263	Mus_pahari
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	74	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0025878	-	85	100.000	Mus_spretus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	90.161	ENSMPUG00000017394	ADAD1	100	92.241	Mustela_putorius_furo
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	85.689	ENSMLUG00000011788	ADAD1	99	84.194	Myotis_lucifugus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	92.730	ENSNGAG00000020288	Adad1	100	92.730	Nannospalax_galili
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	56.044	ENSNBRG00000014156	adad1	97	49.704	Neolamprologus_brichardi
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	88.193	ENSNLEG00000009415	ADAD1	99	90.037	Nomascus_leucogenys
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	77.500	ENSMEUG00000009367	-	99	78.683	Notamacropus_eugenii
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	79	90.909	ENSOPRG00000014155	ADAD1	85	90.909	Ochotona_princeps
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	82.469	ENSODEG00000001197	ADAD1	100	81.452	Octodon_degus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	56.044	ENSONIG00000001405	adad1	99	49.704	Oreochromis_niloticus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	75.000	ENSOANG00000015125	ADAD1	99	76.950	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	90.519	ENSOCUG00000012989	ADAD1	99	92.361	Oryctolagus_cuniculus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	53.846	ENSORLG00015021839	adad1	98	44.853	Oryzias_latipes_hsok
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	87	55.747	ENSOMEG00000003366	adad1	85	47.764	Oryzias_melastigma
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	91.055	ENSOGAG00000008455	ADAD1	100	89.694	Otolemur_garnettii
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	99	89.068	ENSOARG00000000116	ADAD1	99	87.520	Ovis_aries
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	87.657	ENSPPAG00000028860	ADAD1	99	89.610	Pan_paniscus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	88.909	ENSPPRG00000008821	ADAD1	99	91.146	Panthera_pardus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	89.445	ENSPTIG00000008158	ADAD1	99	91.667	Panthera_tigris_altaica
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	89.416	ENSPTRG00000016417	ADAD1	99	89.610	Pan_troglodytes
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	94	88.952	ENSPANG00000005749	ADAD1	99	90.926	Papio_anubis
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	60.440	ENSPKIG00000015129	adad1	98	48.116	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	82.967	ENSPSIG00000011531	ADAD1	99	73.413	Pelodiscus_sinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	90	50.811	ENSPMGG00000008284	adad1	92	44.792	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	97.092	ENSPEMG00000013728	Adad1	100	97.092	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	80.357	ENSPCIG00000027949	-	99	82.496	Phascolarctos_cinereus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	92	56.284	ENSPFOG00000018333	adad1	99	47.140	Poecilia_formosa
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	92	56.284	ENSPLAG00000014896	adad1	99	47.140	Poecilia_latipinna
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	92	56.831	ENSPMEG00000013703	adad1	99	47.314	Poecilia_mexicana
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	92	55.738	ENSPREG00000006635	adad1	96	49.605	Poecilia_reticulata
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	88.462	ENSPPYG00000015042	ADAD1	99	79.688	Pongo_abelii
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	79	86.364	ENSPCAG00000014466	ADAD1	85	86.988	Procavia_capensis
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	85	87.654	ENSPCOG00000000862	ADAD1	99	89.398	Propithecus_coquereli
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	82.290	ENSPVAG00000016465	ADAD1	99	84.375	Pteropus_vampyrus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	57.143	ENSPNYG00000001453	adad1	98	49.802	Pundamilia_nyererei
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	62.088	ENSPNAG00000027389	adad1	99	51.207	Pygocentrus_nattereri
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	99.000	ENSRNOG00000017246	Adad1	100	98.061	Rattus_norvegicus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	88.193	ENSRBIG00000027881	ADAD1	99	89.852	Rhinopithecus_bieti
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	88.193	ENSRROG00000039189	ADAD1	99	89.852	Rhinopithecus_roxellana
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	88.193	ENSSBOG00000027476	ADAD1	100	90.161	Saimiri_boliviensis_boliviensis
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	83.571	ENSSHAG00000002892	-	100	85.690	Sarcophilus_harrisii
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	57.692	ENSSFOG00015002386	adad1	89	50.600	Scleropages_formosus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	92	54.645	ENSSMAG00000008001	adad1	99	47.222	Scophthalmus_maximus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	56.044	ENSSDUG00000007569	adad1	99	47.150	Seriola_dumerili
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	56.044	ENSSLDG00000021425	adad1	96	49.802	Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	81	78.947	ENSSARG00000000198	ADAD1	100	81.360	Sorex_araneus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	82.418	ENSSPUG00000009160	ADAD1	99	73.092	Sphenodon_punctatus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	87	58.192	ENSSPAG00000011210	adad1	93	47.471	Stegastes_partitus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	88.551	ENSSSCG00000009089	ADAD1	99	87.055	Sus_scrofa
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	92	68.852	ENSTGUG00000001990	ADAD1	99	62.475	Taeniopygia_guttata
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	56.906	ENSTRUG00000008514	adad1	93	47.390	Takifugu_rubripes
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	53.846	ENSTNIG00000013059	adad1	99	47.677	Tetraodon_nigroviridis
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	87	89.655	ENSTBEG00000003496	-	51	89.714	Tupaia_belangeri
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	85.868	ENSTTRG00000010867	ADAD1	99	87.674	Tursiops_truncatus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	89.982	ENSUAMG00000022616	-	99	88.562	Ursus_americanus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	89.803	ENSUMAG00000004507	ADAD1	99	88.399	Ursus_maritimus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	86.762	ENSVPAG00000010532	ADAD1	99	88.889	Vicugna_pacos
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	100	90.877	ENSVVUG00000013576	ADAD1	93	92.491	Vulpes_vulpes
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	91	55.801	ENSXETG00000001593	adad1	100	54.307	Xenopus_tropicalis
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	95	30.688	ENSXETG00000030929	-	82	32.461	Xenopus_tropicalis
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	92	56.284	ENSXCOG00000015038	adad1	96	49.901	Xiphophorus_couchianus
MGP_CAROLIEiJ_G0024944	Adad1	92	56.284	ENSXMAG00000001973	adad1	99	46.655	Xiphophorus_maculatus