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Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0026358 (Gene tree)
Gene ID: 110292168
Gene Symbol: Eri3
Alias: PINT1|Prnpip1
Full Name: ERI1 exoribonuclease family member 3
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 124332 bases
Position: chr4:107999766-108124097
Accession: 110292168
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0063925	RNase_T	PF00929.24	1.3e-41	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0063928	RNase_T	PF00929.24	3.2e-16	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0063926	RNase_T	PF00929.24	2.1e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_CAROLIEiJ_T0063926	-	786	-	MGP_CAROLIEiJ_P0063926	163 (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0063927	-	1336	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0063925	-	1719	XM_021159298	MGP_CAROLIEiJ_P0063925	337 (aa)	XP_021014957	UPI000A319780
MGP_CAROLIEiJ_T0063930	-	1013	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0063928	-	572	-	MGP_CAROLIEiJ_P0063928	115 (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0063929	-	245	-	-	- (aa)	-	-

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	83	36.842	MGP_CAROLIEiJ_G0030979	Eri1	52	43.889

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	82	31.481	ENSG00000196678	ERI2	75	37.321	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	72	39.759	ENSG00000104626	ERI1	53	41.622	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	100	98.220	ENSG00000117419	ERI3	100	98.507	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	97	33.036	ENSAPOG00000020462	eri1	52	43.333	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	72	39.759	ENSAMEG00000016002	ERI1	51	42.778	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	100	97.923	ENSAMEG00000014032	ERI3	100	97.923	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	74	38.824	ENSACIG00000004140	eri1	55	42.778	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	81	31.776	ENSACIG00000001312	-	88	36.626	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	79	32.710	ENSAOCG00000003497	-	72	38.095	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	97	33.036	ENSAPEG00000022307	eri1	52	43.333	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	81	31.193	ENSATEG00000004702	-	82	39.048	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	97	32.143	ENSATEG00000022473	eri1	52	42.222	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	75	95.349	ENSAPLG00000010575	ERI3	100	80.556	Anas_platyrhynchos
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	96	32.099	ENSAPLG00000012159	ERI1	57	42.778	Anas_platyrhynchos
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	75	95.349	ENSACAG00000014747	ERI3	97	84.586	Anolis_carolinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	83	34.737	ENSACAG00000002863	ERI1	61	43.333	Anolis_carolinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	100	97.923	ENSANAG00000024843	ERI3	100	99.375	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	72	37.349	ENSANAG00000023618	ERI1	51	41.111	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	82	31.481	ENSANAG00000035452	ERI2	67	37.441	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	90	32.692	ENSACLG00000015500	eri1	52	42.222	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	74	37.647	ENSAMXG00000029498	eri1	52	38.889	Astyanax_mexicanus
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	72	39.759	ENSBTAG00000009685	ERI1	51	42.778	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	100	97.626	ENSBTAG00000015559	ERI3	100	99.375	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	80	50.000	WBGene00019825	R02D3.8	73	46.701	Caenorhabditis_elegans
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	54	32.812	WBGene00000797	crn-4	63	32.812	Caenorhabditis_elegans
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	74	49.412	WBGene00019724	M02B7.2	92	44.000	Caenorhabditis_elegans
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	74	34.118	WBGene00001332	eri-1	50	32.787	Caenorhabditis_elegans
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	72	36.145	ENSCJAG00000012129	ERI1	51	40.556	Callithrix_jacchus
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MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	82	31.481	ENSCJAG00000009400	ERI2	67	37.915	Callithrix_jacchus
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MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	72	39.759	ENSCAFG00000006678	ERI1	51	42.778	Canis_familiaris
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MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	72	39.759	ENSCAFG00020000937	ERI1	51	42.778	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	100	91.691	ENSCHIG00000024241	ERI3	100	91.691	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	72	39.759	ENSCHIG00000011907	ERI1	51	42.778	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	72	39.759	ENSTSYG00000027472	ERI1	51	42.778	Carlito_syrichta
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MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	98	96.855	ENSCAPG00000008894	ERI3	100	95.238	Cavia_aperea
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MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	74	38.824	ENSCPOG00000030481	ERI1	52	42.778	Cavia_porcellus
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MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	72	38.554	ENSCANG00000039595	ERI1	51	41.667	Colobus_angolensis_palliatus
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MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	100	98.516	ENSEASG00005002077	ERI3	100	98.516	Equus_asinus_asinus
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MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	83	36.842	ENSECAG00000011091	ERI1	57	43.333	Equus_caballus
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MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	72	39.759	ENSFCAG00000029808	ERI1	51	42.778	Felis_catus
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	100	98.220	ENSFCAG00000005285	ERI3	99	97.945	Felis_catus
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	75	95.349	ENSFALG00000005283	ERI3	99	86.397	Ficedula_albicollis
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	83	33.684	ENSFALG00000006747	ERI1	57	42.222	Ficedula_albicollis
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	83	35.789	ENSFDAG00000015042	ERI1	53	42.778	Fukomys_damarensis
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	100	96.736	ENSFDAG00000015896	ERI3	100	96.736	Fukomys_damarensis
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	79	33.645	ENSFHEG00000013370	ERI2	79	38.462	Fundulus_heteroclitus
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	74	38.824	ENSFHEG00000003119	eri1	60	34.597	Fundulus_heteroclitus
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MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	74	35.294	ENSGALG00000011448	ERI1	55	41.667	Gallus_gallus
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	75	95.349	ENSGALG00000010106	ERI3	81	91.878	Gallus_gallus
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	74	40.000	ENSGAFG00000014207	eri1	53	42.222	Gambusia_affinis
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	74	38.372	ENSGACG00000020068	eri1	55	42.541	Gasterosteus_aculeatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026358	Eri3	75	35.294	ENSGACG00000019510	ERI2	82	36.287	Gasterosteus_aculeatus
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