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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0026462 (Gene tree)
Gene ID: 110292779
Gene Symbol: Zc3h12a
Alias: Mcpip1
Full Name: zinc finger CCCH-type containing 12A
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9631 bases
Position: chr4:114888938-114898568
Accession: 110292779
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0064351	RNase_Zc3h12a	PF11977.8	3.7e-64	1	1

Transcripts

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	56	57.692	MGP_CAROLIEiJ_G0015104	Zc3h12d	62	57.692
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	51	66.993	MGP_CAROLIEiJ_G0033247	-	64	79.412

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	100	81.970	ENSG00000163874	ZC3H12A	96	86.447	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	70	50.481	ENSAPOG00000005848	-	64	50.481	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	64	67.097	ENSAPOG00000001632	-	71	67.097	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	95	30.492	ENSAPOG00000018821	-	99	31.158	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	92	45.280	ENSAPOG00000024328	zc3h12a	97	45.120	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	99	81.145	ENSAMEG00000000991	ZC3H12A	99	81.145	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	61	64.890	ENSACIG00000001362	-	60	53.704	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	92	44.462	ENSACIG00000017750	zc3h12a	98	44.551	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	92	40.198	ENSACIG00000006790	-	94	50.641	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	91	48.854	ENSACIG00000004135	si:dkey-206d17.12	79	66.379	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	92	45.600	ENSAOCG00000014937	zc3h12a	97	45.600	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	70	50.831	ENSAOCG00000009106	-	64	50.831	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	67	62.112	ENSAOCG00000003866	-	92	58.268	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	92	45.920	ENSAPEG00000006072	zc3h12a	97	45.920	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	65	63.844	ENSAPEG00000005727	-	97	48.148	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	95	48.547	ENSATEG00000002260	-	88	59.459	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	91	43.958	ENSATEG00000013053	-	79	62.780	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	93	46.458	ENSATEG00000006140	si:dkey-206d17.12	88	55.280	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	94	45.283	ENSATEG00000009946	zc3h12a	68	55.457	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	91	56.814	ENSACAG00000017285	ZC3H12A	99	54.777	Anolis_carolinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	99	81.711	ENSANAG00000009908	ZC3H12A	96	86.081	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	95	42.270	ENSACLG00000018534	-	98	41.872	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	91	46.610	ENSACLG00000004488	si:dkey-206d17.12	90	46.520	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	92	44.586	ENSACLG00000027801	zc3h12a	97	44.127	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	92	47.650	ENSAMXG00000001736	zc3h12a	99	47.650	Astyanax_mexicanus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	92	41.397	ENSAMXG00000030754	-	54	60.197	Astyanax_mexicanus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	97	81.647	ENSBTAG00000011316	ZC3H12A	100	82.161	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	100	81.636	ENSCJAG00000041792	ZC3H12A	100	81.970	Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	97	79.417	ENSCAFG00000003304	ZC3H12A	100	79.417	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	97	79.417	ENSCAFG00020008620	ZC3H12A	100	79.417	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	99	81.544	ENSCHIG00000021957	ZC3H12A	100	82.333	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	100	83.472	ENSTSYG00000035959	ZC3H12A	100	83.806	Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	92	84.420	ENSCAPG00000015365	ZC3H12A	100	84.420	Cavia_aperea
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	92	84.239	ENSCPOG00000011081	ZC3H12A	100	84.239	Cavia_porcellus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	100	81.970	ENSCCAG00000023848	ZC3H12A	100	82.304	Cebus_capucinus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	100	82.696	ENSCATG00000037700	ZC3H12A	100	83.028	Cercocebus_atys
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	100	81.667	ENSCLAG00000008722	ZC3H12A	100	81.833	Chinchilla_lanigera
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	100	82.529	ENSCSAG00000001106	ZC3H12A	100	82.862	Chlorocebus_sabaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	92	58.360	ENSCPBG00000018492	ZC3H12A	91	58.080	Chrysemys_picta_bellii
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	100	82.363	ENSCANG00000042287	ZC3H12A	100	82.696	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	100	89.262	ENSCGRG00001015497	Zc3h12a	100	89.262	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	100	89.262	ENSCGRG00000013149	Zc3h12a	100	89.262	Cricetulus_griseus_crigri
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MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	97	45.746	ENSCSEG00000019043	zc3h12a	99	46.067	Cynoglossus_semilaevis
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MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	92	49.486	ENSCVAG00000001516	si:dkey-206d17.12	92	48.893	Cyprinodon_variegatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	91	48.739	ENSDARG00000101034	si:dkey-206d17.12	89	48.644	Danio_rerio
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	50	68.404	ENSDARG00000005271	zc3h12a	80	69.132	Danio_rerio
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MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	66	65.347	ENSHCOG00000008878	-	60	51.923	Hippocampus_comes
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	92	43.400	ENSHCOG00000004255	si:dkey-206d17.12	92	57.940	Hippocampus_comes
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MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	93	46.566	ENSIPUG00000005852	si:dkey-206d17.12	90	46.833	Ictalurus_punctatus
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MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	93	41.838	ENSKMAG00000013650	zc3h12a	98	41.838	Kryptolebias_marmoratus
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MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	92	58.864	ENSLACG00000017365	ZC3H12A	94	58.692	Latimeria_chalumnae
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	94	54.591	ENSLOCG00000003232	si:dkey-206d17.12	94	54.424	Lepisosteus_oculatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026462	Zc3h12a	99	81.271	ENSLAFG00000018720	ZC3H12A	99	81.438	Loxodonta_africana
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