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Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0026477 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: Ago3
Alias: C130014L07Rik|argonaute 3|eIF2C3
Full Name: argonaute RISC catalytic subunit 3
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 90527 bases
Position: chr4:116115615-116206141
Accession: 2446634
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0064414	PAZ	PF02170.22	8.7e-28	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0064414	Piwi	PF02171.17	2.8e-113	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0064413	Piwi	PF02171.17	4.9e-57	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0064415	Piwi	PF02171.17	6.9e-37	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_CAROLIEiJ_T0064413	-	685	-	MGP_CAROLIEiJ_P0064413	161 (aa)	-	UPI000059E0F0
MGP_CAROLIEiJ_T0064417	-	646	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0064416	-	627	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0064415	-	433	-	MGP_CAROLIEiJ_P0064415	144 (aa)	-	UPI000059E0F1
MGP_CAROLIEiJ_T0064414	-	15384	-	MGP_CAROLIEiJ_P0064414	860 (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0064418	-	613	-	-	- (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	91	90.476	MGP_CAROLIEiJ_G0019861	Ago2	99	79.538
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	99	85.159	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	89.331
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	80.734	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	80.734
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	83	37.778	MGP_CAROLIEiJ_G0031784	Piwil4	80	38.462

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSG00000126070	AGO3	100	99.681	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	96.744	ENSAPOG00000024260	ago3a	100	96.744	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	94.233	ENSAPOG00000014494	-	100	94.233	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSAMEG00000000497	AGO3	100	99.186	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	92	97.345	ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.345	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	91	96.599	ENSACIG00000019272	AGO3	100	95.322	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	54	88.727	ENSAOCG00000022538	-	91	88.727	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	91	97.279	ENSAOCG00000017051	-	100	87.578	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	96.744	ENSAOCG00000017642	ago3a	100	96.744	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	95.963	ENSAPEG00000004375	ago3a	100	95.963	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	93.887	ENSAPEG00000020249	-	100	93.887	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	93.887	ENSATEG00000005160	-	100	93.887	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	95.963	ENSATEG00000008458	ago3a	100	95.963	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	99	98.715	ENSAPLG00000009642	AGO3	99	98.715	Anas_platyrhynchos
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	98.488	ENSACAG00000003385	AGO3	100	98.488	Anolis_carolinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSANAG00000037735	AGO3	100	99.186	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	96.744	ENSACLG00000000963	ago3a	100	96.744	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	93.656	ENSACLG00000001965	-	100	93.656	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	91	96.599	ENSAMXG00000009571	ago3b	100	94.058	Astyanax_mexicanus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	92	95.196	ENSAMXG00000002198	ago3a	100	95.196	Astyanax_mexicanus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSBTAG00000018324	AGO3	100	99.186	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSCJAG00000031580	AGO3	100	99.186	Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.070	ENSCAFG00000024682	AGO3	100	99.070	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	99	99.067	ENSCAFG00020009051	AGO3	99	99.682	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSCHIG00000011536	AGO3	100	99.186	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	84	99.171	ENSTSYG00000011897	AGO3	100	99.171	Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	93	80.726	ENSCAPG00000011589	AGO3	100	80.601	Cavia_aperea
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	99	95.556	ENSCPOG00000030524	AGO3	100	95.556	Cavia_porcellus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSCCAG00000034189	AGO3	100	99.681	Cebus_capucinus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSCATG00000029748	AGO3	100	99.681	Cercocebus_atys
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSCLAG00000013184	AGO3	100	99.186	Chinchilla_lanigera
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSCSAG00000001092	AGO3	100	99.186	Chlorocebus_sabaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	92	100.000	ENSCHOG00000011621	AGO3	92	100.000	Choloepus_hoffmanni
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	98.837	ENSCPBG00000018583	AGO3	100	98.837	Chrysemys_picta_bellii
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSCANG00000033258	AGO3	100	99.681	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.419	ENSCGRG00001024614	Ago3	100	99.419	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.419	ENSCGRG00000010670	Ago3	100	99.419	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	92	96.839	ENSCSEG00000001040	ago3a	100	96.839	Cynoglossus_semilaevis
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	91	92.157	ENSCSEG00000009788	-	100	89.888	Cynoglossus_semilaevis
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	52	86.623	ENSCVAG00000011229	-	98	86.623	Cyprinodon_variegatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	96.395	ENSCVAG00000018224	ago3a	100	96.395	Cyprinodon_variegatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	99	85.625	ENSCVAG00000017268	-	70	91.080	Cyprinodon_variegatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	95.848	ENSDARG00000059888	ago3a	100	95.848	Danio_rerio
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	94.767	ENSDARG00000063079	ago3b	100	94.767	Danio_rerio
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	88	99.208	ENSDNOG00000008106	AGO3	100	99.208	Dasypus_novemcinctus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	98.837	ENSDORG00000009414	Ago3	100	98.837	Dipodomys_ordii
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	90	95.862	ENSETEG00000007639	AGO3	89	98.310	Echinops_telfairi
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSEASG00005012089	AGO3	100	99.186	Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSECAG00000023972	AGO3	100	99.186	Equus_caballus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	82.209	ENSEEUG00000007058	AGO3	100	82.209	Erinaceus_europaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	91	97.279	ENSELUG00000016755	ago3a	100	94.311	Esox_lucius
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	93.508	ENSELUG00000001774	-	100	93.508	Esox_lucius
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	91	99.320	ENSFCAG00000000747	-	100	99.681	Felis_catus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	99	98.598	ENSFALG00000000802	AGO3	99	98.598	Ficedula_albicollis
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	99	99.179	ENSFDAG00000012874	AGO3	100	99.179	Fukomys_damarensis
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	78	90.076	ENSFHEG00000021009	-	75	91.515	Fundulus_heteroclitus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	92.734	ENSFHEG00000016205	-	100	92.734	Fundulus_heteroclitus
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MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	83	78.049	ENSGMOG00000019418	-	89	78.049	Gadus_morhua
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	98.721	ENSGALG00000043711	AGO3	100	99.053	Gallus_gallus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	96.628	ENSGAFG00000009808	ago3a	100	96.628	Gambusia_affinis
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	92.849	ENSGAFG00000015911	-	100	92.849	Gambusia_affinis
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	92	96.738	ENSGACG00000012453	ago3a	100	96.738	Gasterosteus_aculeatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	97	95.090	ENSGACG00000002455	AGO3	100	95.090	Gasterosteus_aculeatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	98.953	ENSGAGG00000012887	AGO3	100	98.953	Gopherus_agassizii
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSGGOG00000036711	AGO3	100	99.186	Gorilla_gorilla
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MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	89	95.220	ENSHBUG00000010542	ago3a	97	95.220	Haplochromis_burtoni
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSHGLG00000012538	AGO3	100	99.186	Heterocephalus_glaber_female
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MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	91	97.279	ENSHCOG00000005654	ago3a	100	97.613	Hippocampus_comes
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	92.964	ENSHCOG00000011851	AGO3	100	92.964	Hippocampus_comes
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	99	91.036	ENSIPUG00000023241	ago3a	99	91.289	Ictalurus_punctatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	94.464	ENSIPUG00000008548	ago3b	100	94.464	Ictalurus_punctatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	94.419	ENSSTOG00000025904	AGO3	100	94.419	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.070	ENSJJAG00000017436	Ago3	100	99.070	Jaculus_jaculus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	87	83.571	ENSKMAG00000004179	-	92	76.429	Kryptolebias_marmoratus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	95.963	ENSKMAG00000019534	ago3a	100	95.963	Kryptolebias_marmoratus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	93.394	ENSLBEG00000016073	-	100	93.394	Labrus_bergylta
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	92	97.345	ENSLBEG00000007592	ago3a	100	97.345	Labrus_bergylta
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSLAFG00000002744	AGO3	100	99.186	Loxodonta_africana
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSMFAG00000035610	AGO3	100	99.681	Macaca_fascicularis
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSMMUG00000006252	AGO3	100	99.186	Macaca_mulatta
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSMNEG00000039518	AGO3	100	99.681	Macaca_nemestrina
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSMLEG00000027912	AGO3	100	99.681	Mandrillus_leucophaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	93.772	ENSMAMG00000005697	-	100	93.772	Mastacembelus_armatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	91.228	ENSMAMG00000008440	ago3a	100	96.587	Mastacembelus_armatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	93.772	ENSMZEG00005026243	-	100	93.772	Maylandia_zebra
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	96.744	ENSMZEG00005007949	ago3a	100	96.744	Maylandia_zebra
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	99	98.713	ENSMGAG00000003773	AGO3	99	98.713	Meleagris_gallopavo
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	93	86.683	ENSMAUG00000010128	Ago3	96	86.809	Mesocricetus_auratus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.186	ENSMICG00000016158	AGO3	100	99.186	Microcebus_murinus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	99	96.387	ENSMOCG00000020568	Ago3	99	96.387	Microtus_ochrogaster
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	92	93.047	ENSMMOG00000014065	-	100	93.047	Mola_mola
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	92	92.184	ENSMMOG00000018446	ago3a	100	92.184	Mola_mola
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	98.488	ENSMODG00000017869	AGO3	100	98.488	Monodelphis_domestica
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	98	92.798	ENSMALG00000014658	-	99	92.798	Monopterus_albus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	98	94.215	ENSMALG00000010895	ago3a	99	94.215	Monopterus_albus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	100.000	ENSMUSG00000028842	Ago3	100	100.000	Mus_musculus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	99.535	MGP_PahariEiJ_G0028808	Ago3	100	99.535	Mus_pahari
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MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	91	99.320	ENSMLUG00000009668	AGO3	100	99.521	Myotis_lucifugus
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MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	91	97.279	ENSNBRG00000015687	AGO3	100	95.196	Neolamprologus_brichardi
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MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	91	97.279	ENSXCOG00000007676	ago3a	100	98.108	Xiphophorus_couchianus
MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	91	95.238	ENSXCOG00000000902	-	99	93.447	Xiphophorus_couchianus
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