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Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0026478 (Gene tree)
Gene ID: 110292125
Gene Symbol: Ago1
Alias: Eif2c1|argonaute 1
Full Name: protein argonaute-1
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 33296 bases
Position: chr4:116211575-116244870
Accession: 110292125
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0064419	PAZ	PF02170.22	1.7e-28	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0064421	PAZ	PF02170.22	6.5e-13	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0064421	Piwi	PF02171.17	8.2e-111	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0064419	Piwi	PF02171.17	2.1e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_CAROLIEiJ_T0064422	-	575	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0064423	-	665	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0064419	-	7213	XM_021159240	MGP_CAROLIEiJ_P0064419	857 (aa)	XP_021014899	UPI000012D07D
MGP_CAROLIEiJ_T0064421	-	1662	-	MGP_CAROLIEiJ_P0064421	553 (aa)	-	UPI0002467874
MGP_CAROLIEiJ_T0064420	-	3611	-	MGP_CAROLIEiJ_P0064420	132 (aa)	-	UPI000CBCCB3D

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	89.331	MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	99	85.159
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	84.602	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	82.904
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	86.257	MGP_CAROLIEiJ_G0019861	Ago2	97	83.790

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSG00000092847	AGO1	100	100.000	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	ENSAPOG00000024299	ago1	98	96.916	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	91.863	ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	ENSAOCG00000017727	ago1	98	96.916	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	ENSAPEG00000004458	ago1	99	96.576	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	ENSATEG00000008523	ago1	98	96.916	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.458	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	93.794	Anas_platyrhynchos
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.458	ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	Anolis_carolinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSANAG00000037711	AGO1	100	100.000	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	97.830	ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	97.830	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.542	Astyanax_mexicanus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.883	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	100.000	Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	100.000	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.458	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.458	ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	Capra_hircus
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MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	89	93.983	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	Cavia_aperea
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MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	100.000	Cebus_capucinus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.458	ENSCATG00000031521	AGO1	100	100.000	Cercocebus_atys
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	Chinchilla_lanigera
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
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MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.767	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	Chrysemys_picta_bellii
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSCANG00000039798	AGO1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.458	ENSCGRG00000010386	Ago1	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	95.246	ENSCSEG00000001051	ago1	99	94.780	Cynoglossus_semilaevis
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	ENSCVAG00000018173	ago1	98	96.916	Cyprinodon_variegatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	ENSDARG00000092644	ago1	98	96.923	Danio_rerio
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.458	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	93	98.820	ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	Dipodomys_ordii
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	84	93.204	ENSETEG00000007626	AGO1	100	93.204	Echinops_telfairi
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSEASG00005012086	AGO1	100	100.000	Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSECAG00000024353	AGO1	100	100.000	Equus_caballus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	92.224	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	Erinaceus_europaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	ENSELUG00000016803	ago1	100	97.059	Esox_lucius
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	100.000	Felis_catus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	96.396	ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	Ficedula_albicollis
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.883	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	Fukomys_damarensis
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	ENSFHEG00000017927	ago1	99	93.001	Fundulus_heteroclitus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	80.505	ENSGMOG00000019413	ago1	100	84.646	Gadus_morhua
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.883	ENSGALG00000002249	AGO1	100	99.883	Gallus_gallus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	ENSGAFG00000009775	ago1	98	96.916	Gambusia_affinis
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	97.482	ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	Gasterosteus_aculeatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.458	ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	Gopherus_agassizii
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	100.000	Gorilla_gorilla
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MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	100.000	Heterocephalus_glaber_male
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	ENSHCOG00000005708	ago1	99	96.576	Hippocampus_comes
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MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.883	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	99.883	Jaculus_jaculus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	ENSKMAG00000019464	ago1	98	96.916	Kryptolebias_marmoratus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	ENSLBEG00000007694	ago1	98	96.916	Labrus_bergylta
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	99	93.522	ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	Latimeria_chalumnae
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MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	94.394	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	95.255	Macaca_mulatta
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.458	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	100.000	Macaca_nemestrina
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MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	ENSMAMG00000008381	ago1	98	96.916	Mastacembelus_armatus
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MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	96	98.311	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.657	Mola_mola
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.650	ENSMODG00000023335	AGO1	100	99.650	Monodelphis_domestica
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	97.830	ENSMALG00000011057	ago1	99	96.797	Monopterus_albus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	100.000	Mus_musculus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	100.000	Mus_pahari
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	100.000	Mus_spretus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.458	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	61	99.617	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	99.617	Myotis_lucifugus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.767	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	99.767	Nannospalax_galili
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	97.830	ENSNBRG00000010867	ago1	100	97.059	Neolamprologus_brichardi
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.883	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	Nomascus_leucogenys
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	88	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	93	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	Ochotona_princeps
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSODEG00000005321	AGO1	100	100.000	Octodon_degus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	97.830	ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	Oreochromis_niloticus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.458	ENSOANG00000002080	AGO1	100	91.977	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.883	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	99.883	Oryctolagus_cuniculus
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	ENSORLG00000014965	ago1	98	96.916	Oryzias_latipes
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	ENSORLG00020018253	ago1	98	96.916	Oryzias_latipes_hni
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	ENSORLG00015003287	ago1	98	96.916	Oryzias_latipes_hsok
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	ENSOMEG00000020528	ago1	98	96.916	Oryzias_melastigma
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.458	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	100.000	Otolemur_garnettii
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.883	ENSOARG00000019591	AGO1	100	99.883	Ovis_aries
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	100.000	Pan_paniscus
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MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.767	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	99.767	Panthera_tigris_altaica
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	100.000	Pan_troglodytes
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	ENSPANG00000009060	AGO1	100	100.000	Papio_anubis
MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	50	73.285	ENSPKIG00000000164	-	82	73.285	Paramormyrops_kingsleyae
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