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Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0026479 (Gene tree)
Gene ID: 110292285
Gene Symbol: Ago4
Alias: 5730550L01Rik|Eif2c4|argonaute 4
Full Name: protein argonaute-4
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 46885 bases
Position: chr4:116259522-116306406
Accession: 110292285
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0064424	PAZ	PF02170.22	2.6e-28	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0064424	Piwi	PF02171.17	8.6e-104	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_CAROLIEiJ_T0064424	-	6610	-	MGP_CAROLIEiJ_P0064424	861 (aa)	XP_021015184	UPI000A31AA1A

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	80.734	MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	100	80.734
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	82.904	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	84.602
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	78.312	MGP_CAROLIEiJ_G0019861	Ago2	98	78.312

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	99.071	ENSG00000134698	AGO4	100	99.071	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	96	95.465	ENSAPOG00000023867	ago4	99	95.465	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	98.603	ENSAMEG00000000573	AGO4	100	98.603	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	92	96.851	ENSACIG00000014548	ago4	100	96.851	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	92	92.191	ENSAPEG00000022426	ago4	100	92.191	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.538	ENSATEG00000006717	ago4	100	95.528	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	98	98.583	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	98.583	Anas_platyrhynchos
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	97.661	ENSACAG00000017275	AGO4	99	97.661	Anolis_carolinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	98.955	ENSANAG00000031428	AGO4	100	98.955	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.423	ENSACLG00000005181	ago4	100	95.423	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.652	ENSAMXG00000010318	ago4	100	95.652	Astyanax_mexicanus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	97.902	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	97.902	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	99.071	ENSCJAG00000001610	AGO4	100	99.071	Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	92	98.992	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	98.992	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	98.955	ENSCHIG00000026564	AGO4	100	98.955	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	98.947	ENSTSYG00000014007	AGO4	100	98.947	Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	94	95.526	ENSCAPG00000009369	AGO4	100	95.526	Cavia_aperea
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	96.632	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	96.632	Cavia_porcellus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	99.071	ENSCCAG00000001397	AGO4	100	99.071	Cebus_capucinus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	99.071	ENSCATG00000043421	AGO4	100	99.071	Cercocebus_atys
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	98.712	ENSCLAG00000012097	AGO4	100	98.712	Chinchilla_lanigera
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	99.071	ENSCSAG00000001090	AGO4	100	99.071	Chlorocebus_sabaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	80	99.174	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	99.174	Choloepus_hoffmanni
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	98.596	ENSCPBG00000018602	AGO4	98	98.596	Chrysemys_picta_bellii
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	99.064	ENSCANG00000016914	AGO4	100	99.064	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	99.419	ENSCGRG00001002701	Ago4	100	99.419	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	99.415	ENSCGRG00000013335	Ago4	100	99.415	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	92	90.829	ENSCSEG00000010696	ago4	100	90.829	Cynoglossus_semilaevis
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	96.871	ENSDARG00000100854	ago4	100	96.871	Danio_rerio
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	98.839	ENSDNOG00000015674	AGO4	100	98.839	Dasypus_novemcinctus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	98.955	ENSDORG00000008933	Ago4	100	98.955	Dipodomys_ordii
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	60	98.083	ENSETEG00000018390	AGO4	83	98.083	Echinops_telfairi
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	99.071	ENSEASG00005012079	AGO4	100	99.071	Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	99.071	ENSECAG00000024686	AGO4	100	99.071	Equus_caballus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	79	96.820	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	96.820	Erinaceus_europaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	94.989	ENSELUG00000023873	ago4	100	94.989	Esox_lucius
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	98.955	ENSFCAG00000006218	AGO4	100	98.955	Felis_catus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	98.946	ENSFDAG00000021483	AGO4	100	98.946	Fukomys_damarensis
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	97	88.038	ENSFHEG00000019658	ago4	100	88.038	Fundulus_heteroclitus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	96.391	ENSGMOG00000009544	ago4	99	96.391	Gadus_morhua
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	98.606	ENSGALG00000039713	AGO4	100	98.606	Gallus_gallus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.423	ENSGAFG00000017239	ago4	100	95.423	Gambusia_affinis
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	96.744	ENSGACG00000002683	ago4	99	96.744	Gasterosteus_aculeatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	92	98.489	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	98.489	Gopherus_agassizii
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	95.652	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	95.652	Gorilla_gorilla
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.423	ENSHBUG00000001525	ago4	100	95.423	Haplochromis_burtoni
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	98.955	ENSHGLG00000010241	AGO4	100	98.955	Heterocephalus_glaber_female
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	99.059	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.059	Heterocephalus_glaber_male
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.309	ENSHCOG00000003725	ago4	100	95.309	Hippocampus_comes
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.538	ENSIPUG00000015600	ago4	100	95.538	Ictalurus_punctatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	98.953	ENSSTOG00000004725	AGO4	100	98.953	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.538	ENSKMAG00000018602	ago4	100	95.538	Kryptolebias_marmoratus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	94.886	ENSLBEG00000010670	ago4	100	94.886	Labrus_bergylta
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	97.677	ENSLACG00000016888	AGO4	100	97.677	Latimeria_chalumnae
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.762	ENSLOCG00000000584	ago4	100	95.762	Lepisosteus_oculatus
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MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	99.071	ENSMFAG00000035543	AGO4	100	99.071	Macaca_fascicularis
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	98.834	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	98.016	Macaca_mulatta
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	99.071	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	99.071	Macaca_nemestrina
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	99.063	ENSMLEG00000039490	AGO4	100	99.063	Mandrillus_leucophaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.423	ENSMAMG00000003874	ago4	100	95.423	Mastacembelus_armatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.423	ENSMZEG00005026346	ago4	100	95.423	Maylandia_zebra
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	98.246	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	98.246	Meleagris_gallopavo
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	89	100.000	ENSMAUG00000021743	Ago4	96	100.000	Mesocricetus_auratus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	98.830	ENSMICG00000033507	AGO4	100	98.830	Microcebus_murinus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	99.535	ENSMOCG00000005772	Ago4	100	99.535	Microtus_ochrogaster
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	92	95.970	ENSMMOG00000013473	ago4	100	95.970	Mola_mola
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MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	94.872	ENSMALG00000011797	ago4	100	94.872	Monopterus_albus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	99.652	ENSMUSG00000042500	Ago4	100	99.652	Mus_musculus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	98.722	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.722	Mus_pahari
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	99.535	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	100	99.535	Mus_spretus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	92	98.992	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	98.992	Mustela_putorius_furo
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	97.897	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	97.897	Myotis_lucifugus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	98.946	ENSNGAG00000020544	Ago4	100	98.946	Nannospalax_galili
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.423	ENSNBRG00000013492	ago4	100	95.423	Neolamprologus_brichardi
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	99.063	ENSNLEG00000011125	AGO4	100	99.063	Nomascus_leucogenys
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	90	97.846	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	97.846	Notamacropus_eugenii
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	91.803	ENSOPRG00000012309	AGO4	100	91.803	Ochotona_princeps
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	93	98.872	ENSODEG00000006355	AGO4	97	98.872	Octodon_degus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.423	ENSONIG00000013603	ago4	100	95.423	Oreochromis_niloticus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	92	98.615	ENSOANG00000002082	AGO4	100	98.615	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	98.839	ENSOCUG00000004076	AGO4	100	98.839	Oryctolagus_cuniculus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.538	ENSORLG00000009865	ago4	92	95.538	Oryzias_latipes
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.538	ENSORLG00020016978	ago4	92	95.538	Oryzias_latipes_hni
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.538	ENSORLG00015008800	ago4	92	95.538	Oryzias_latipes_hsok
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.538	ENSOMEG00000006399	ago4	100	95.538	Oryzias_melastigma
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	90.012	ENSOGAG00000027107	-	100	90.012	Otolemur_garnettii
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	93	97.622	ENSOGAG00000004233	-	100	97.622	Otolemur_garnettii
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	98.137	ENSOARG00000019568	AGO4	98	98.137	Ovis_aries
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	99.063	ENSPPAG00000031752	AGO4	100	99.063	Pan_paniscus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	98.955	ENSPPRG00000006520	AGO4	100	98.955	Panthera_pardus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	98.946	ENSPTIG00000020262	AGO4	100	98.946	Panthera_tigris_altaica
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	99.071	ENSPTRG00000000527	AGO4	100	99.071	Pan_troglodytes
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	92	98.992	ENSPANG00000007232	AGO4	100	98.992	Papio_anubis
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.309	ENSPKIG00000022598	ago4	100	95.309	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	98.596	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	98.596	Pelodiscus_sinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	92	96.725	ENSPMGG00000023325	ago4	100	96.725	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	88.644	ENSPEMG00000022651	-	97	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	98.722	ENSPCIG00000000092	AGO4	100	98.722	Phascolarctos_cinereus
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.538	ENSPFOG00000001935	ago4	100	95.538	Poecilia_formosa
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	96.756	ENSPLAG00000011534	ago4	100	96.756	Poecilia_latipinna
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.538	ENSPMEG00000005049	ago4	100	95.538	Poecilia_mexicana
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.538	ENSPREG00000010315	ago4	100	95.538	Poecilia_reticulata
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	99.063	ENSPPYG00000001552	AGO4	100	99.063	Pongo_abelii
MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	98.713	ENSPCOG00000015935	AGO4	100	98.713	Propithecus_coquereli
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