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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0027469 (Gene tree)
Gene ID: 110294174
Gene Symbol: Aff1
Alias: 9630032B01Rik|Af4|Mllt2h|Rob
Full Name: AF4/FMR2 family member 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 162939 bases
Position: chr5:96523019-96685957
Accession: 110294174
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

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MGP_CAROLIEiJ_P0069398	AF-4	PF05110.13	5.4e-262	1	1

Transcripts

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Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_CAROLIEiJ_G0027469	Aff1	77	35.223	MGP_CAROLIEiJ_G0016331	Aff4	57	62.319

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
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MGP_CAROLIEiJ_G0027469	Aff1	78	37.436	ENSAPOG00000006096	aff4	99	34.204	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0027469	Aff1	99	66.454	ENSAMEG00000003337	AFF1	100	64.377	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0027469	Aff1	60	31.218	ENSACIG00000010525	aff4	91	30.315	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0027469	Aff1	78	36.751	ENSAOCG00000008476	aff4	79	34.256	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0027469	Aff1	78	36.751	ENSAPEG00000018275	aff4	79	34.154	Amphiprion_percula
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MGP_CAROLIEiJ_G0027469	Aff1	99	49.201	ENSAPLG00000004059	AFF1	99	48.601	Anas_platyrhynchos
MGP_CAROLIEiJ_G0027469	Aff1	52	49.265	ENSAPLG00000003660	-	72	43.015	Anas_platyrhynchos
MGP_CAROLIEiJ_G0027469	Aff1	62	38.899	ENSACAG00000022605	AFF4	79	35.504	Anolis_carolinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0027469	Aff1	99	46.779	ENSACAG00000012192	AFF1	99	46.363	Anolis_carolinensis
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MGP_CAROLIEiJ_G0027469	Aff1	78	36.438	ENSACLG00000011879	aff4	78	34.286	Astatotilapia_calliptera
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MGP_CAROLIEiJ_G0027469	Aff1	69	52.273	ENSCPOG00000006346	AFF3	84	51.163	Cavia_porcellus
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MGP_CAROLIEiJ_G0027469	Aff1	70	40.234	ENSCATG00000044510	AFF4	79	36.550	Cercocebus_atys
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MGP_CAROLIEiJ_G0027469	Aff1	100	68.077	ENSCANG00000037514	AFF1	100	67.703	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_CAROLIEiJ_G0027469	Aff1	100	78.370	ENSCGRG00001015769	Aff1	100	75.545	Cricetulus_griseus_chok1gshd
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