EuRBPDB

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0027674 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9314 bases
Position: chr5:113867125-113876438
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0070391	OAS1_C	PF10421.9	1.9e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_CAROLIEiJ_T0070391	-	1331	-	MGP_CAROLIEiJ_P0070391	321 (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0070393	-	748	-	MGP_CAROLIEiJ_P0070393	29 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	97	41.210	MGP_CAROLIEiJ_G0027670	Oas3	92	50.806
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	80	60.596	MGP_CAROLIEiJ_G0027671	-	100	60.596
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	77	61.644	MGP_CAROLIEiJ_G0027675	-	99	61.644
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	98	39.886	MGP_CAROLIEiJ_G0027669	Oas2	99	40.693
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	93	30.000	MGP_CAROLIEiJ_G0027609	Oasl1	66	30.000
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	95	34.758	MGP_CAROLIEiJ_G0027608	Oasl2	98	32.550

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	95	50.000	ENSG00000089127	OAS1	98	56.140	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	97	42.651	ENSG00000111331	OAS3	93	42.651	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	96	30.812	ENSG00000135114	OASL	71	30.366	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	98	40.000	ENSG00000111335	OAS2	98	40.678	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	98	40.782	ENSAMEG00000008674	OAS2	94	40.782	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	97	33.657	ENSAMEG00000008347	-	94	33.657	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	98	47.175	ENSAMEG00000008654	OAS1	88	47.175	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	99	35.734	ENSACAG00000009153	-	99	35.734	Anolis_carolinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	98	39.276	ENSANAG00000029234	OAS2	95	39.276	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	98	48.169	ENSANAG00000028558	OAS1	97	48.571	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	97	41.210	ENSANAG00000013699	OAS3	94	41.210	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	96	49.713	ENSBTAG00000053807	-	98	49.713	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	93	31.143	ENSBTAG00000003297	OASL	96	31.143	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	95	50.581	ENSBTAG00000039861	OAS1Y	88	50.581	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	96	45.690	ENSBTAG00000037527	OAS1Z	96	45.690	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	98	38.827	ENSBTAG00000014628	OAS2	94	38.827	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	96	40.510	ENSCJAG00000012666	OAS2	98	40.510	Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	97	50.000	ENSCJAG00000012624	OAS1	97	50.000	Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	97	41.210	ENSCJAG00000012642	OAS3	94	41.210	Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	95	49.419	ENSCAFG00000023556	OAS1	86	49.419	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	95	33.238	ENSCAFG00000010511	OASL	67	33.238	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	96	42.407	ENSCAFG00000008929	OAS3	89	42.407	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	98	41.854	ENSCAFG00000023107	OAS2	93	41.854	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	93	34.897	ENSCAFG00000024447	OASL	65	34.897	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	93	35.191	ENSCAFG00020020855	-	65	35.191	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	96	42.407	ENSCAFG00020017605	OAS3	94	42.407	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	95	49.419	ENSCAFG00020017601	OAS1	86	49.419	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	95	33.238	ENSCAFG00020020845	OASL	67	33.238	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	94	41.860	ENSCAFG00020017625	OAS2	95	42.215	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	96	58.182	ENSCHIG00000017038	-	86	58.182	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	95	51.014	ENSCHIG00000019892	OAS1	99	48.000	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	98	38.764	ENSCHIG00000023778	-	94	38.764	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	98	43.266	ENSTSYG00000009231	OAS3	94	43.266	Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	95	37.572	ENSTSYG00000009240	OAS2	94	37.572	Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	98	31.742	ENSTSYG00000009320	OASL	68	31.373	Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	95	48.547	ENSTSYG00000003983	OAS1	99	48.547	Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	94	48.555	ENSCAPG00000012425	OAS1	99	48.555	Cavia_aperea
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	97	41.547	ENSCAPG00000013382	OAS3	89	41.547	Cavia_aperea
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	74	33.455	ENSCAPG00000006829	-	62	33.455	Cavia_aperea
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	98	37.784	ENSCAPG00000008640	OAS2	92	37.784	Cavia_aperea
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	97	41.547	ENSCPOG00000004153	OAS3	91	41.547	Cavia_porcellus
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	98	38.068	ENSCPOG00000034890	OAS2	92	38.068	Cavia_porcellus
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	94	48.555	ENSCPOG00000037062	OAS1	86	48.555	Cavia_porcellus
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MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	96	40.227	ENSCSAG00000002459	OAS2	98	40.227	Chlorocebus_sabaeus
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MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	91	37.273	ENSCPBG00000007398	-	91	37.273	Chrysemys_picta_bellii
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MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	89	45.098	ENSCGRG00000007538	Oas2	80	45.098	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	96	31.653	ENSDNOG00000035785	OASL	67	31.653	Dasypus_novemcinctus
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MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	93	31.818	ENSDNOG00000048828	-	61	31.818	Dasypus_novemcinctus
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	96	31.034	ENSETEG00000015102	OASL	67	31.034	Echinops_telfairi
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	95	41.096	ENSETEG00000010911	OAS3	74	41.096	Echinops_telfairi
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	96	42.274	ENSEASG00005009518	OAS3	89	42.274	Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	96	39.143	ENSEASG00005009515	OAS2	98	39.143	Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	95	50.581	ENSEASG00005009520	OAS1	86	50.581	Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	83	31.190	ENSEASG00005004436	-	60	31.190	Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	92	31.778	ENSEASG00005004445	OASL	65	32.070	Equus_asinus_asinus
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MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	97	41.787	ENSECAG00000008809	OAS3	94	41.787	Equus_caballus
MGP_CAROLIEiJ_G0027674	-	98	37.921	ENSECAG00000014422	OAS2	97	39.143	Equus_caballus
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