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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0029072 (Gene tree)
Gene ID: 110296190
Gene Symbol: Ipo8
Alias: 6230418K12Rik|C130009K11Rik|OM-1|Om1|Ranbp8
Full Name: importin 8
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 62130 bases
Position: chr6:146479716-146541845
Accession: 110296190
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0076943	IBN_N	PF03810.19	9.2e-21	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0076951	IBN_N	PF03810.19	7.9e-20	1	1

Transcripts

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MGP_CAROLIEiJ_T0076948	-	3874	-	-	- (aa)	-	-
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MGP_CAROLIEiJ_T0076945	-	2430	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0076942	-	6093	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0076943	-	5372	XM_021164775	MGP_CAROLIEiJ_P0076943	1010 (aa)	XP_021020434	UPI000A319D02
MGP_CAROLIEiJ_T0076950	-	1408	-	MGP_CAROLIEiJ_P0076950	35 (aa)	-	UPI0006A69FC7
MGP_CAROLIEiJ_T0076952	-	2978	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0076951	-	1262	-	MGP_CAROLIEiJ_P0076951	361 (aa)	-	UPI000024E6AF

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	92.292	ENSG00000133704	IPO8	100	96.970	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	91.724	ENSAMEG00000009154	IPO8	98	91.034	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	96	75.835	ENSACIG00000005543	ipo8	98	75.835	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	72.530	ENSAOCG00000018199	ipo8	99	71.937	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	96	75.835	ENSAPEG00000002396	ipo8	100	75.835	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	65.650	ENSATEG00000023469	ipo8	98	65.157	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	97	84.372	ENSAPLG00000009843	IPO8	100	84.270	Anas_platyrhynchos
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	82.609	ENSACAG00000012959	IPO8	97	82.196	Anolis_carolinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	91.601	ENSANAG00000032923	IPO8	97	90.810	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	71.654	ENSACLG00000015219	ipo8	96	75.835	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	71.471	ENSAMXG00000036026	ipo8	99	71.373	Astyanax_mexicanus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	92.688	ENSBTAG00000014106	IPO8	97	91.700	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	91.304	ENSCJAG00000001057	IPO8	97	90.514	Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	92.391	ENSCAFG00000010768	IPO8	97	91.502	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	92.505	ENSCAFG00020013795	IPO8	97	91.617	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	93.148	ENSCHIG00000022393	IPO8	99	92.155	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	92.787	ENSTSYG00000004436	IPO8	97	91.897	Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	97	83.299	ENSCAPG00000013099	IPO8	100	87.009	Cavia_aperea
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	96.399	ENSCPOG00000010365	IPO8	100	96.399	Cavia_porcellus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	91.798	ENSCCAG00000027484	IPO8	97	90.909	Cebus_capucinus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	92.589	ENSCATG00000038860	IPO8	97	91.700	Cercocebus_atys
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	96.676	ENSCLAG00000002557	IPO8	100	96.676	Chinchilla_lanigera
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	92.589	ENSCSAG00000007458	IPO8	97	91.700	Chlorocebus_sabaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	85.079	ENSCPBG00000027234	IPO8	97	84.585	Chrysemys_picta_bellii
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	90.119	ENSCANG00000022452	IPO8	97	89.229	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	95.347	ENSCGRG00001014551	Ipo8	100	95.347	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	97	94.908	ENSCGRG00000002481	Ipo8	100	97.898	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	70.629	ENSCSEG00000003320	ipo8	100	69.912	Cynoglossus_semilaevis
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	68.719	ENSCVAG00000013038	ipo8	96	73.525	Cyprinodon_variegatus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	70.257	ENSDARG00000058159	ipo8	99	69.832	Danio_rerio
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	97	90.918	ENSDORG00000005959	Ipo8	100	94.595	Dipodomys_ordii
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	95.231	ENSEASG00005006112	IPO8	97	95.231	Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	92.688	ENSECAG00000012848	IPO8	97	91.798	Equus_caballus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	76	98.305	ENSEEUG00000007618	-	87	89.007	Erinaceus_europaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	72.130	ENSELUG00000001212	ipo8	100	71.765	Esox_lucius
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	96.122	ENSFCAG00000007002	IPO8	97	91.403	Felis_catus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	92	96.096	ENSFDAG00000003130	IPO8	100	96.096	Fukomys_damarensis
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	70.286	ENSFHEG00000004531	ipo8	99	69.655	Fundulus_heteroclitus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	64.532	ENSGMOG00000008722	ipo8	79	70.798	Gadus_morhua
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	84.798	ENSGALG00000012953	IPO8	97	84.403	Gallus_gallus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	69.882	ENSGAFG00000005851	ipo8	99	69.617	Gambusia_affinis
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	69.458	ENSGACG00000019236	IPO8	100	63.287	Gasterosteus_aculeatus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	84.813	ENSGAGG00000015070	IPO8	97	84.221	Gopherus_agassizii
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MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	71.541	ENSHBUG00000012196	ipo8	100	71.541	Haplochromis_burtoni
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MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	96.953	ENSHGLG00100010369	IPO8	100	96.953	Heterocephalus_glaber_male
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	67.910	ENSHCOG00000013067	ipo8	100	68.504	Hippocampus_comes
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MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	96.953	ENSSTOG00000015509	-	100	96.953	Ictidomys_tridecemlineatus
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MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	96	75.040	ENSLBEG00000028213	ipo8	100	75.040	Labrus_bergylta
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	76.130	ENSLACG00000004177	IPO8	99	75.442	Latimeria_chalumnae
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	70.936	ENSLOCG00000015102	ipo8	100	69.246	Lepisosteus_oculatus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	89.286	ENSLAFG00000012885	IPO8	100	88.393	Loxodonta_africana
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	92.589	ENSMFAG00000012472	IPO8	97	91.700	Macaca_fascicularis
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	92.589	ENSMMUG00000001361	IPO8	98	90.793	Macaca_mulatta
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	92.589	ENSMNEG00000039910	IPO8	97	91.700	Macaca_nemestrina
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	92.490	ENSMLEG00000031593	IPO8	97	91.601	Mandrillus_leucophaeus
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MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	71.654	ENSMZEG00005008224	ipo8	96	75.835	Maylandia_zebra
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MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	93.906	ENSNGAG00000001055	Ipo8	100	93.906	Nannospalax_galili
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	87	81.690	ENSNBRG00000006642	-	95	81.690	Neolamprologus_brichardi
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	92.391	ENSNLEG00000005683	IPO8	97	91.502	Nomascus_leucogenys
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	96.399	ENSODEG00000004763	-	100	96.399	Octodon_degus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	71.654	ENSONIG00000012030	ipo8	100	71.654	Oreochromis_niloticus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	55	87.879	ENSOANG00000003774	-	76	87.879	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	82.512	ENSOCUG00000029016	IPO8	97	92.675	Oryctolagus_cuniculus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	68.478	ENSORLG00000012548	ipo8	97	71.224	Oryzias_latipes
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	57.389	ENSORLG00020020896	ipo8	93	67.866	Oryzias_latipes_hni
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	68.281	ENSORLG00015019508	ipo8	96	71.065	Oryzias_latipes_hsok
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	96	71.224	ENSOMEG00000021459	ipo8	97	71.224	Oryzias_melastigma
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	91.510	ENSOGAG00000010059	IPO8	99	90.721	Otolemur_garnettii
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	92.604	ENSOARG00000019534	IPO8	97	91.617	Ovis_aries
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	92.391	ENSPPAG00000042123	IPO8	97	91.502	Pan_paniscus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	92.391	ENSPPRG00000015678	IPO8	97	91.502	Panthera_pardus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	91.107	ENSPTIG00000014323	IPO8	97	90.217	Panthera_tigris_altaica
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	92.490	ENSPTRG00000004801	IPO8	97	91.601	Pan_troglodytes
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	92.589	ENSPANG00000013653	IPO8	97	91.700	Papio_anubis
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	71.853	ENSPKIG00000011380	ipo8	99	71.853	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	81.773	ENSPSIG00000017127	IPO8	99	89.676	Pelodiscus_sinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	98.615	ENSPEMG00000011306	-	100	98.615	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	86.481	ENSPCIG00000015209	IPO8	96	88.591	Phascolarctos_cinereus
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	70.276	ENSPFOG00000000833	IPO8	99	70.010	Poecilia_formosa
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MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	92.194	ENSPCOG00000018051	IPO8	97	91.304	Propithecus_coquereli
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MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	71.654	ENSPNYG00000020683	ipo8	96	75.835	Pundamilia_nyererei
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	99	72.217	ENSPNAG00000001408	ipo8	99	75.199	Pygocentrus_nattereri
MGP_CAROLIEiJ_G0029072	Ipo8	100	81.618	ENSRNOG00000056041	AABR07062570.1	100	81.405	Rattus_norvegicus
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