EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Paralogs
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
MGP_CAROLIEiJ_G0032918 (Gene tree)
Gene ID
110286716
Gene Symbol
Ftsj1
Alias
Sfc12
Full Name
FtsJ RNA methyltransferase homolog 1
Gene Type
protein_coding
Species
Mus_caroli
Status
putative
Strand
Minus strand
Length
14382 bases
Position
chrX:2385272-2399653
Accession
110286716
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0090970FtsJPF01728.192.2e-6811
MGP_CAROLIEiJ_P0090971FtsJPF01728.192.5e-6811
MGP_CAROLIEiJ_P0090969FtsJPF01728.192.6e-6811
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
MGP_CAROLIEiJ_T0090969-3381-MGP_CAROLIEiJ_P0090969324 (aa)XP_021008943UPI000A3184BC
MGP_CAROLIEiJ_T0090975-1047--- (aa)--
MGP_CAROLIEiJ_T0090974-607--- (aa)--
MGP_CAROLIEiJ_T0090973-495-MGP_CAROLIEiJ_P0090973110 (aa)--
MGP_CAROLIEiJ_T0090972-1781--- (aa)--
MGP_CAROLIEiJ_T0090971-1643-MGP_CAROLIEiJ_P0090971322 (aa)XP_021008945UPI000A31813D
MGP_CAROLIEiJ_T0090970-1516-MGP_CAROLIEiJ_P0090970308 (aa)--
Gene Model
Click here to download MGP_CAROLIEiJ_G0032918's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_CAROLIEiJ_G0032918's network
Paralogs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy ParalogGene SymbolCoverageIdentiy
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj16532.850MGP_CAROLIEiJ_G0027946Mrm28432.850
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.692ENSG00000068438FTSJ19987.692Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19675.238ENSAPOG00000018541ftsj110075.238Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110086.626ENSAMEG00000012735FTSJ19986.626Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19675.241ENSACIG00000001541ftsj110075.241Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19674.766ENSAOCG00000009380ftsj110074.766Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19674.455ENSAPEG00000020434ftsj110074.455Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19374.277ENSATEG00000008408ftsj19774.277Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj18076.046ENSACAG00000016605FTSJ18876.046Anolis_carolinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19784.227ENSANAG00000035537-9486.667Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110086.850ENSANAG00000030571-9986.850Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19673.209ENSACLG00000014226ftsj110073.209Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj18979.110ENSAMXG00000037663ftsj19179.110Astyanax_mexicanus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19975.641ENSBTAG00000046593-9975.641Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110083.706ENSBTAG00000031829FTSJ19983.706Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj18954.698WBGene00011281R74.78854.698Caenorhabditis_elegans
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110086.850ENSCJAG00000002256FTSJ19986.850Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.462ENSCAFG00000015339FTSJ19987.462Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.462ENSCAFG00020021351FTSJ19987.462Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110086.239ENSCHIG00000000441-9986.239Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110077.097ENSCHIG00000021392-9977.097Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19973.926ENSCHIG00000017370-9973.926Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.462ENSTSYG00000029207FTSJ19987.462Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19373.667ENSCAPG00000011705FTSJ19773.667Cavia_aperea
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110086.503ENSCPOG00000030576FTSJ19986.503Cavia_porcellus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19987.077ENSCCAG00000027731FTSJ19987.077Cebus_capucinus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.462ENSCATG00000013045FTSJ19987.462Cercocebus_atys
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110085.933ENSCLAG00000011582FTSJ19985.933Chinchilla_lanigera
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.156ENSCSAG00000013278FTSJ19987.156Chlorocebus_sabaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19669.401ENSCING00000008473-9869.401Ciona_intestinalis
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj18970.530ENSCSAVG00000010259-9670.530Ciona_savignyi
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.692ENSCANG00000033841FTSJ19987.692Colobus_angolensis_palliatus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110092.049ENSCGRG00001023654Ftsj19992.049Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110092.025ENSCGRG00000007253Ftsj19992.025Cricetulus_griseus_crigri
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj18963.230ENSCSEG00000018843ftsj19063.230Cynoglossus_semilaevis
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj18974.916ENSCVAG00000009618ftsj19574.916Cyprinodon_variegatus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19077.288ENSDARG00000057089ftsj19888.889Danio_rerio
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110080.243ENSDNOG00000047923-9980.243Dasypus_novemcinctus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19558.306ENSDNOG00000044320-9758.306Dasypus_novemcinctus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19885.804ENSDORG00000000074Ftsj110085.804Dipodomys_ordii
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj18851.701FBgn0038861CG70098951.701Drosophila_melanogaster
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj17858.566FBgn0038471CG52208358.566Drosophila_melanogaster
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19461.967ENSETEG00000018343-9661.967Echinops_telfairi
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj17076.498ENSETEG00000014092-6576.498Echinops_telfairi
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj17073.009ENSEBUG00000005843ftsj17173.009Eptatretus_burgeri
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj16183.000ENSEASG00005008272FTSJ17083.000Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.156ENSECAG00000019260FTSJ19987.156Equus_caballus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19088.396ENSEEUG00000001469FTSJ110088.396Erinaceus_europaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19078.000ENSELUG00000011483ftsj19078.000Esox_lucius
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110086.850ENSFCAG00000026453FTSJ19986.850Felis_catus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110084.923ENSFDAG00000011250FTSJ19984.923Fukomys_damarensis
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19573.899ENSFHEG00000008464ftsj19973.899Fundulus_heteroclitus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj18977.027ENSGMOG00000004562ftsj19977.027Gadus_morhua
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj16676.636ENSGAFG00000002036ftsj19476.636Gambusia_affinis
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19375.325ENSGACG00000008843ftsj19575.325Gasterosteus_aculeatus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.156ENSGGOG00000028552FTSJ19987.156Gorilla_gorilla
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19473.734ENSHBUG00000015883ftsj19873.734Haplochromis_burtoni
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110086.420ENSHGLG00000003132FTSJ19986.420Heterocephalus_glaber_female
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110086.420ENSHGLG00100014682FTSJ19986.420Heterocephalus_glaber_male
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19077.258ENSHCOG00000010145ftsj19577.258Hippocampus_comes
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19078.305ENSIPUG00000005052FTSJ19278.305Ictalurus_punctatus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19987.730ENSSTOG00000027717FTSJ19987.730Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19584.091ENSJJAG00000011596-9784.091Jaculus_jaculus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.234ENSJJAG00000014517-10087.234Jaculus_jaculus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19375.817ENSKMAG00000000645ftsj19775.817Kryptolebias_marmoratus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19076.490ENSLBEG00000005293ftsj18675.570Labrus_bergylta
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj18183.333ENSLACG00000009913FTSJ18183.333Latimeria_chalumnae
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj18978.498ENSLOCG00000015688ftsj18778.498Lepisosteus_oculatus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110082.875ENSLAFG00000032618FTSJ110082.875Loxodonta_africana
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.462ENSMFAG00000003467FTSJ19987.462Macaca_fascicularis
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.462ENSMMUG00000018894FTSJ19987.462Macaca_mulatta
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.462ENSMNEG00000044348FTSJ19987.462Macaca_nemestrina
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.385ENSMLEG00000016789FTSJ19987.385Mandrillus_leucophaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19177.076ENSMAMG00000022841ftsj19177.076Mastacembelus_armatus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19673.209ENSMZEG00005022583ftsj110073.209Maylandia_zebra
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19993.189ENSMAUG00000015442Ftsj19893.189Mesocricetus_auratus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj18992.388ENSMICG00000036228-9892.388Microcebus_murinus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19391.089ENSMOCG00000020523-9691.089Microtus_ochrogaster
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19889.590ENSMOCG00000021218-9689.590Microtus_ochrogaster
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj17197.706ENSMOCG00000000507-10097.706Microtus_ochrogaster
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19073.244ENSMMOG00000018969ftsj19473.244Mola_mola
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19180.678ENSMODG00000011356FTSJ110080.678Monodelphis_domestica
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19176.412ENSMALG00000014209ftsj110073.817Monopterus_albus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110099.691ENSMUSG00000031171Ftsj110099.691Mus_musculus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110099.383MGP_PahariEiJ_G0031467Ftsj110099.383Mus_pahari
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110099.383MGP_SPRETEiJ_G0034067Ftsj110099.383Mus_spretus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110086.850ENSMPUG00000013493FTSJ19986.850Mustela_putorius_furo
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110085.152ENSMLUG00000003977FTSJ19985.152Myotis_lucifugus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110084.098ENSNGAG00000016847-9984.098Nannospalax_galili
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110088.685ENSNGAG00000018629-9988.685Nannospalax_galili
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19666.289ENSNBRG00000012481ftsj110066.289Neolamprologus_brichardi
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110082.263ENSNLEG00000007816FTSJ19982.263Nomascus_leucogenys
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110085.933ENSODEG00000009855FTSJ19985.933Octodon_degus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19373.885ENSONIG00000003966ftsj110073.885Oreochromis_niloticus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj18944.291ENSOANG00000013572-9944.291Ornithorhynchus_anatinus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19985.139ENSOCUG00000023277-9985.139Oryctolagus_cuniculus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19989.506ENSOCUG00000008009-9889.506Oryctolagus_cuniculus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19983.901ENSOCUG00000024620-9983.901Oryctolagus_cuniculus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj18977.055ENSORLG00000028355ftsj19477.055Oryzias_latipes
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj18977.055ENSORLG00020007897ftsj19477.055Oryzias_latipes_hni
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj18976.370ENSOMEG00000018497ftsj18676.370Oryzias_melastigma
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110076.364ENSOGAG00000016174-9976.364Otolemur_garnettii
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19986.728ENSOGAG00000032641-10086.728Otolemur_garnettii
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110086.239ENSOARG00000012432-9986.239Ovis_aries
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110073.718ENSOARG00000012099-9973.718Ovis_aries
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.692ENSPPAG00000028540FTSJ19987.692Pan_paniscus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110086.850ENSPPRG00000000249FTSJ19986.850Panthera_pardus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110086.544ENSPTIG00000017680FTSJ19986.544Panthera_tigris_altaica
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.692ENSPTRG00000049433FTSJ19987.692Pan_troglodytes
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.462ENSPANG00000010102FTSJ19987.462Papio_anubis
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19076.316ENSPKIG00000019318ftsj18976.316Paramormyrops_kingsleyae
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj18556.738ENSPSIG00000007020FTSJ19357.955Pelodiscus_sinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110090.462ENSPEMG00000015698-9990.462Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110084.566ENSPEMG00000013262-9784.566Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19073.986ENSPMAG00000006943FTSJ19973.986Petromyzon_marinus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19576.699ENSPCIG00000007236FTSJ19876.699Phascolarctos_cinereus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19373.443ENSPFOG00000017003ftsj19873.443Poecilia_formosa
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj18178.656ENSPLAG00000016190ftsj19675.185Poecilia_latipinna
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj18975.172ENSPMEG00000021719ftsj19275.172Poecilia_mexicana
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19075.427ENSPREG00000016616ftsj19575.427Poecilia_reticulata
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj16993.388ENSPPYG00000020309-9993.388Pongo_abelii
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj15789.873ENSPCAG00000009437-6489.873Procavia_capensis
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110086.154ENSPCOG00000018822-9986.154Propithecus_coquereli
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19092.414ENSPCOG00000022716-9392.414Propithecus_coquereli
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj17076.667ENSPVAG00000015621FTSJ16976.667Pteropus_vampyrus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19673.209ENSPNYG00000011144ftsj110073.209Pundamilia_nyererei
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19078.305ENSPNAG00000016330ftsj19278.305Pygocentrus_nattereri
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110095.963ENSRNOG00000004776Ftsj19995.963Rattus_norvegicus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.462ENSRBIG00000027511FTSJ19987.462Rhinopithecus_bieti
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.462ENSRROG00000029757FTSJ19987.462Rhinopithecus_roxellana
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19048.562YBR061CTRM710048.562Saccharomyces_cerevisiae
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.077ENSSBOG00000028146FTSJ19987.077Saimiri_boliviensis_boliviensis
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj18979.931ENSSHAG00000012607FTSJ19479.931Sarcophilus_harrisii
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19076.412ENSSFOG00015006275ftsj18876.412Scleropages_formosus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19575.321ENSSMAG00000001754ftsj19975.321Scophthalmus_maximus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19674.277ENSSDUG00000015226ftsj110074.277Seriola_dumerili
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19675.000ENSSLDG00000019859ftsj110075.000Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj17977.366ENSSARG00000007246-9777.366Sorex_araneus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19984.424ENSSARG00000007091-9884.424Sorex_araneus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19674.143ENSSPAG00000022047ftsj110074.143Stegastes_partitus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110086.850ENSSSCG00000025599FTSJ19986.850Sus_scrofa
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19076.949ENSTRUG00000016142ftsj19376.949Takifugu_rubripes
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19075.254ENSTNIG00000010402ftsj19575.254Tetraodon_nigroviridis
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110085.321ENSTTRG00000009027FTSJ19985.321Tursiops_truncatus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19887.500ENSUAMG00000013296FTSJ19587.500Ursus_americanus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110080.793ENSUMAG00000007966FTSJ19980.793Ursus_maritimus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj15380.000ENSVPAG00000008296-9980.000Vicugna_pacos
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj110087.462ENSVVUG00000017640FTSJ19987.462Vulpes_vulpes
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19072.109ENSXCOG00000003344ftsj19072.109Xiphophorus_couchianus
MGP_CAROLIEiJ_G0032918Ftsj19373.927ENSXMAG00000009372ftsj19973.927Xiphophorus_maculatus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us