EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0033094 (Gene tree)
Gene ID: 110286707
Gene Symbol: Htatsf1
Alias: 1600023H17Rik|2600017A12Rik|2700077B20Rik|TAT-SF1
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13712 bases
Position: chrX:51975457-51989168
Accession: 110286707
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0091504	RRM_1	PF00076.22	4.1e-16	1	2
MGP_CAROLIEiJ_P0091504	RRM_1	PF00076.22	4.1e-16	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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MGP_CAROLIEiJ_T0091505	-	2608	-	-	- (aa)	-	-
MGP_CAROLIEiJ_T0091504	-	2777	XM_021153270	MGP_CAROLIEiJ_P0091504	746 (aa)	XP_021008929	UPI000A319E4D

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	73.193	ENSG00000102241	HTATSF1	100	86.122	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	64.781	ENSAPOG00000009823	htatsf1	81	64.324	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	70.588	ENSAMEG00000002921	HTATSF1	99	69.670	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	64.213	ENSACIG00000020459	htatsf1	82	63.564	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	64.122	ENSAOCG00000020994	htatsf1	80	63.636	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	64.122	ENSAPEG00000016432	htatsf1	80	63.636	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	93	70.605	ENSANAG00000025458	-	99	70.183	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	95	64.099	ENSANAG00000027986	-	97	63.411	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	63.636	ENSACLG00000008096	htatsf1	82	62.698	Astatotilapia_calliptera
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	64.721	ENSAMXG00000008387	htatsf1	79	63.926	Astyanax_mexicanus
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MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	72.186	ENSBTAG00000054942	HTATSF1	100	72.051	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	100	66.535	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	99	68.997	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	73.026	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	99	72.368	Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	73.629	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	100	72.093	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	71.995	ENSCAFG00020024635	HTATSF1	100	69.620	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	73.026	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	99	72.751	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	73.913	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	100	74.707	Carlito_syrichta
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MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	73.913	ENSCCAG00000022701	-	99	73.386	Cebus_capucinus
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	72.991	ENSCATG00000029963	HTATSF1	99	73.664	Cercocebus_atys
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	69.221	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	69.792	Chinchilla_lanigera
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	73.123	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	99	73.794	Chlorocebus_sabaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	51	69.948	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	91	66.268	Chrysemys_picta_bellii
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	72.859	ENSCANG00000028495	HTATSF1	99	73.533	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	79.770	ENSCGRG00001021602	Htatsf1	99	79.923	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	91	73.955	ENSCGRG00000002085	Htatsf1	99	73.883	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	64.541	ENSCVAG00000014070	htatsf1	81	64.171	Cyprinodon_variegatus
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	61.399	ENSDARG00000056649	htatsf1	80	60.326	Danio_rerio
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	69.430	ENSDNOG00000002254	HTATSF1	99	69.987	Dasypus_novemcinctus
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	92	44.589	ENSETEG00000006377	-	69	49.031	Echinops_telfairi
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	51.741	ENSEBUG00000001534	htatsf1	75	51.688	Eptatretus_burgeri
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	82	75.117	ENSEASG00005003440	HTATSF1	99	71.520	Equus_asinus_asinus
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	82	75.583	ENSECAG00000009156	HTATSF1	99	71.903	Equus_caballus
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MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	51	67.519	ENSFALG00000003728	HTATSF1	87	66.750	Ficedula_albicollis
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	71.995	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	100	72.099	Fukomys_damarensis
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	64.377	ENSFHEG00000020286	htatsf1	83	63.467	Fundulus_heteroclitus
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	51	67.183	ENSGALG00000006410	HTATSF1	84	67.183	Gallus_gallus
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	63.889	ENSGAFG00000003041	htatsf1	82	62.963	Gambusia_affinis
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MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	63.889	ENSONIG00000008638	htatsf1	82	63.228	Oreochromis_niloticus
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MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	52	62.044	ENSORLG00015002268	htatsf1	90	62.019	Oryzias_latipes_hsok
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	98	71.995	ENSOGAG00000005565	HTATSF1	99	72.633	Otolemur_garnettii
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MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	66.793	ENSOARG00000000481	-	99	65.866	Ovis_aries
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MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	92	70.572	ENSPTIG00000016887	HTATSF1	96	70.874	Panthera_tigris_altaica
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	73.193	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	99	73.958	Pan_troglodytes
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	63.241	ENSPANG00000010946	HTATSF1	83	70.924	Papio_anubis
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	67.374	ENSPKIG00000024852	htatsf1	79	66.852	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	51	62.438	ENSPMGG00000006172	htatsf1	82	62.334	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	98	82.907	ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	82.166	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	69.271	ENSPCIG00000030173	-	83	68.306	Phascolarctos_cinereus
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	51	66.412	ENSPCIG00000018896	-	95	61.358	Phascolarctos_cinereus
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MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	72.991	ENSRROG00000021939	HTATSF1	99	73.012	Rhinopithecus_roxellana
MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	72.281	ENSSBOG00000027186	-	99	72.930	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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