EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_CAROLIEiJ_G0033484 (Gene tree)
Gene ID: 110286626
Gene Symbol: Apex2
Alias: Ape2|C430040P13Rik
Full Name: apurinic/apyrimidinic endodeoxyribonuclease 2
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_caroli
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 66410 bases
Position: chrX:139302166-139368575
Accession: 110286626
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CAROLIEiJ_P0092982	Exo_endo_phos	PF03372.23	1.6e-17	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0092986	Exo_endo_phos	PF03372.23	1.6e-17	1	1
MGP_CAROLIEiJ_P0092985	Exo_endo_phos	PF03372.23	5.2e-16	1	1
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MGP_CAROLIEiJ_P0092988	Exo_endo_phos	PF03372.23	7.1e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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MGP_CAROLIEiJ_T0092986	-	1885	-	MGP_CAROLIEiJ_P0092986	516 (aa)	XP_021008779	UPI000A31A6F4
MGP_CAROLIEiJ_T0092987	-	784	-	-	- (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	81.132	ENSG00000169188	APEX2	100	79.344	Homo_sapiens
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	52.817	ENSAPOG00000005805	apex2	99	46.397	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	80.377	ENSAMEG00000003608	APEX2	100	78.613	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	98	53.650	ENSACIG00000010000	apex2	99	46.235	Amphilophus_citrinellus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	52.817	ENSAOCG00000021774	apex2	99	46.924	Amphiprion_ocellaris
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	52.817	ENSAPEG00000020890	apex2	93	46.749	Amphiprion_percula
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	52.669	ENSATEG00000023600	apex2	99	45.862	Anabas_testudineus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	58.712	ENSACAG00000011201	APEX2	99	52.124	Anolis_carolinensis
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	73.585	ENSANAG00000020845	-	100	69.522	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	80.000	ENSANAG00000021907	-	100	78.571	Aotus_nancymaae
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	98	51.625	ENSAMXG00000007422	apex2	99	45.018	Astyanax_mexicanus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	81.132	ENSBTAG00000013177	APEX2	100	79.497	Bos_taurus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	80.755	ENSCJAG00000016584	APEX2	100	79.151	Callithrix_jacchus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	78.113	ENSCAFG00000014310	APEX2	100	77.413	Canis_familiaris
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	80.377	ENSCAFG00020013818	APEX2	100	78.764	Canis_lupus_dingo
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	80.377	ENSCHIG00000019916	APEX2	100	79.110	Capra_hircus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	81.887	ENSTSYG00000005612	APEX2	100	79.151	Carlito_syrichta
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	75.094	ENSCPOG00000007265	APEX2	100	73.308	Cavia_porcellus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	94	73.092	ENSCCAG00000025405	-	99	67.000	Cebus_capucinus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	79.245	ENSCATG00000044854	APEX2	100	79.151	Cercocebus_atys
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	78.113	ENSCLAG00000017315	APEX2	100	76.062	Chinchilla_lanigera
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	79.344	ENSCSAG00000012124	APEX2	100	79.344	Chlorocebus_sabaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	54.135	ENSCPBG00000016631	APEX2	99	48.084	Chrysemys_picta_bellii
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	99	45.552	ENSCSAVG00000006052	-	99	39.962	Ciona_savignyi
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	79.151	ENSCANG00000003053	APEX2	100	79.151	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	89.168	ENSCGRG00001008132	Apex2	100	89.168	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	89.168	ENSCGRG00000009667	Apex2	100	89.168	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	53.986	ENSCSEG00000019900	apex2	98	46.690	Cynoglossus_semilaevis
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	51.971	ENSCVAG00000021583	apex2	99	44.483	Cyprinodon_variegatus
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MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	78.113	ENSDNOG00000038901	APEX2	100	75.869	Dasypus_novemcinctus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	93	83.983	ENSDORG00000024412	-	99	83.983	Dipodomys_ordii
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	99	49.064	ENSEBUG00000015654	apex2	99	44.788	Eptatretus_burgeri
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MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	81.509	ENSECAG00000026921	APEX2	91	79.537	Equus_caballus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	76.604	ENSEEUG00000013172	APEX2	100	72.394	Erinaceus_europaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	53.004	ENSELUG00000021417	apex2	99	42.954	Esox_lucius
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	78.491	ENSFCAG00000021990	APEX2	100	75.676	Felis_catus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	78.868	ENSFDAG00000008076	APEX2	94	84.234	Fukomys_damarensis
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	41.637	ENSFHEG00000021411	apex2	99	42.424	Fundulus_heteroclitus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	81	55.500	ENSGMOG00000019681	apex2	89	55.500	Gadus_morhua
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	50.903	ENSGAFG00000005829	apex2	99	44.561	Gambusia_affinis
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	76	61.702	ENSGACG00000012307	apex2	97	51.154	Gasterosteus_aculeatus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	86	47.323	ENSGAGG00000011520	APEX2	85	47.712	Gopherus_agassizii
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	80.755	ENSGGOG00000002056	APEX2	100	79.151	Gorilla_gorilla
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MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	83	63.285	ENSHCOG00000018521	-	100	63.285	Hippocampus_comes
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	52.878	ENSIPUG00000000352	APEX2	99	43.729	Ictalurus_punctatus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	83.396	ENSSTOG00000025121	APEX2	99	83.673	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	82.197	ENSJJAG00000019611	Apex2	100	81.431	Jaculus_jaculus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	56.364	ENSKMAG00000006985	apex2	99	49.198	Kryptolebias_marmoratus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	52.669	ENSLBEG00000012139	apex2	99	46.620	Labrus_bergylta
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MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	53.521	ENSLOCG00000014467	apex2	99	46.644	Lepisosteus_oculatus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	80.377	ENSLAFG00000018312	APEX2	100	77.369	Loxodonta_africana
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	79.623	ENSMFAG00000002486	APEX2	100	79.344	Macaca_fascicularis
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	79.623	ENSMMUG00000008428	APEX2	100	78.958	Macaca_mulatta
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	79.623	ENSMNEG00000036783	APEX2	100	79.344	Macaca_nemestrina
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	79.245	ENSMLEG00000028208	APEX2	100	79.151	Mandrillus_leucophaeus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	51.429	ENSMAMG00000024220	apex2	99	44.143	Mastacembelus_armatus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	53.405	ENSMZEG00005026322	apex2	99	46.972	Maylandia_zebra
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	76	94.681	ENSMAUG00000016924	-	100	94.681	Mesocricetus_auratus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	75.290	ENSMICG00000043181	APEX2	100	75.290	Microcebus_murinus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	87.879	ENSMOCG00000004339	Apex2	100	88.395	Microtus_ochrogaster
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MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	50.178	ENSMALG00000014179	apex2	99	44.332	Monopterus_albus
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MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	98.485	MGP_PahariEiJ_G0032023	Apex2	100	98.485	Mus_pahari
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0034654	Apex2	100	100.000	Mus_spretus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	79.245	ENSMPUG00000003293	APEX2	100	77.842	Mustela_putorius_furo
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	77.736	ENSMLUG00000016298	-	100	74.662	Myotis_lucifugus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	76.226	ENSMLUG00000004562	-	100	72.727	Myotis_lucifugus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	83.712	ENSNGAG00000013576	Apex2	100	82.398	Nannospalax_galili
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	53.405	ENSNBRG00000010099	apex2	99	45.709	Neolamprologus_brichardi
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	98	80.843	ENSNLEG00000032067	-	100	81.955	Nomascus_leucogenys
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	85	83.568	ENSODEG00000003095	-	100	83.568	Octodon_degus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	55.849	ENSONIG00000016881	apex2	99	49.248	Oreochromis_niloticus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	78	66.977	ENSOANG00000000689	-	95	53.734	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	85	85.446	ENSOCUG00000000570	APEX2	100	65.649	Oryctolagus_cuniculus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	53.285	ENSORLG00000014053	apex2	99	47.321	Oryzias_latipes
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	52.190	ENSORLG00020013253	apex2	99	46.607	Oryzias_latipes_hni
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	98	53.903	ENSORLG00015007515	apex2	99	47.321	Oryzias_latipes_hsok
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	52.158	ENSOMEG00000003655	apex2	99	45.714	Oryzias_melastigma
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	78.491	ENSOGAG00000007797	APEX2	99	78.016	Otolemur_garnettii
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	80.755	ENSOARG00000005742	APEX2	100	79.304	Ovis_aries
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	80.000	ENSPPAG00000035747	APEX2	100	78.958	Pan_paniscus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	78.868	ENSPPRG00000002440	APEX2	100	75.676	Panthera_pardus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	78.113	ENSPTIG00000021651	APEX2	100	75.290	Panthera_tigris_altaica
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	80.377	ENSPTRG00000021946	APEX2	100	79.151	Pan_troglodytes
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	79.623	ENSPANG00000003595	APEX2	100	79.344	Papio_anubis
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	51.418	ENSPKIG00000007752	apex2	99	46.127	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	50.357	ENSPMGG00000009151	apex2	99	44.365	Periophthalmus_magnuspinnatus
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	100	89.015	ENSPEMG00000016475	Apex2	100	88.975	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_CAROLIEiJ_G0033484	Apex2	99	61.303	ENSPCIG00000007633	APEX2	98	55.664	Phascolarctos_cinereus
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