EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: MGP_CASTEiJ_G0016265 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: D1Pas1
Alias: Pl10
Full Name: DNA segment%2C Chr 1%2C Pasteur Institute 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_musculus_casteij
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3212 bases
Position: chr1:191670932-191674143
Accession: 91842
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_CASTEiJ_P0023406	DEAD	PF00270.29	8.5e-51	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_CASTEiJ_T0023406	-	3212	-	MGP_CASTEiJ_P0023406	660 (aa)	-	P16381

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	57	31.565	MGP_CASTEiJ_G0032855	Ddx39	90	30.392
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	59	32.487	MGP_CASTEiJ_G0021938	Eif4a2	91	32.234
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	54	32.402	MGP_CASTEiJ_G0033719	Ddx6	69	32.402
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	65	39.269	MGP_CASTEiJ_G0019865	Ddx41	67	39.269
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	73	39.535	MGP_CASTEiJ_G0021336	Ddx17	62	43.765
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	63	38.063	MGP_CASTEiJ_G0021561	Ddx23	53	38.063
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	57	30.105	MGP_CASTEiJ_G0022856	Ddx39b	99	31.792
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	56	32.181	MGP_CASTEiJ_G0016635	Ddx50	54	31.383
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	71	49.578	MGP_CASTEiJ_G0020197	Ddx4	62	52.596
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	100	92.911	MGP_CASTEiJ_G0034550	Ddx3x	100	94.118
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	55	31.510	MGP_CASTEiJ_G0033540	Ddx25	72	30.628
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	52	30.159	MGP_CASTEiJ_G0017334	Ddx56	66	30.789
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	54	35.733	MGP_CASTEiJ_G0029202	Ddx55	59	35.733
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	61	34.080	MGP_CASTEiJ_G0018781	Eif4a3	89	34.080
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	63	34.053	MGP_CASTEiJ_G0015890	Ddx59	64	34.053
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	51	42.229	MGP_CASTEiJ_G0018617	-	80	42.522
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	56	33.155	MGP_CASTEiJ_G0015762	Ddx18	53	33.155
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	61	39.012	MGP_CASTEiJ_G0034068	Ddx43	60	39.012
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	57	34.759	MGP_CASTEiJ_G0030485	Ddx47	86	33.690
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	61	32.530	MGP_CASTEiJ_G0018172	Ddx52	66	32.530
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	55	36.316	MGP_CASTEiJ_G0032713	Ddx49	90	37.500
MGP_CASTEiJ_G0016265	D1Pas1	57	30.025	MGP_CASTEiJ_G0033143	Ddx19a	76	30.025