Protein ID | Domain | Pfam ID | E-value | Domain number | Total number |
---|---|---|---|---|---|
MGP_CASTEiJ_P0078246 | RNA_pol_Rpb1_5 | PF04998.17 | 6.6e-103 | 1 | 1 |
MGP_CASTEiJ_P0078246 | RNA_pol_Rpb1_4 | PF05000.17 | 1.5e-25 | 1 | 1 |
MGP_CASTEiJ_P0078246 | RNA_pol_Rpb1_2 | PF00623.20 | 3.5e-70 | 1 | 1 |
MGP_CASTEiJ_P0078246 | RNA_pol_Rpb1_3 | PF04983.18 | 9.1e-37 | 1 | 1 |
MGP_CASTEiJ_P0078246 | RNA_pol_Rpb1_1 | PF04997.12 | 2.7e-21 | 1 | 1 |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
MGP_CASTEiJ_T0078248 | - | 3302 | - | - | - (aa) | - | - |
MGP_CASTEiJ_T0078249 | - | 356 | - | - | - (aa) | - | - |
MGP_CASTEiJ_T0078253 | - | 554 | - | - | - (aa) | - | - |
MGP_CASTEiJ_T0078252 | - | 625 | - | MGP_CASTEiJ_P0078252 | 47 (aa) | - | - |
MGP_CASTEiJ_T0078251 | - | 584 | - | - | - (aa) | - | - |
MGP_CASTEiJ_T0078250 | - | 352 | - | - | - (aa) | - | - |
MGP_CASTEiJ_T0078245 | - | 3394 | - | MGP_CASTEiJ_P0078245 | 282 (aa) | - | O35134 |
MGP_CASTEiJ_T0078246 | - | 9227 | - | MGP_CASTEiJ_P0078246 | 1717 (aa) | - | - |
MGP_CASTEiJ_T0078247 | - | 1492 | - | - | - (aa) | - | - |
MGP_CASTEiJ_T0078254 | - | 4572 | - | MGP_CASTEiJ_P0078254 | 742 (aa) | - | - |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Paralog | Gene Symbol | Coverage | Identiy |
---|---|---|---|---|---|---|---|
MGP_CASTEiJ_G0029955 | Polr1a | 68 | 31.876 | MGP_CASTEiJ_G0020323 | Polr3a | 77 | 32.623 |
MGP_CASTEiJ_G0029955 | Polr1a | 69 | 33.333 | MGP_CASTEiJ_G0017859 | Polr2a | 51 | 37.143 |