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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0013649 (Gene tree)
Gene ID: 110326801
Gene Symbol: Xpo6
Alias: 2610005L19Rik|C230091E20Rik|Ranbp20
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 97010 bases
Position: chr1:95564060-95661069
Accession: 110326801
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0018857	Xpo1	PF08389.12	8.7e-25	1	1
MGP_PahariEiJ_P0018858	Xpo1	PF08389.12	1.2e-24	1	1
MGP_PahariEiJ_P0018871	Xpo1	PF08389.12	3e-10	1	1
MGP_PahariEiJ_P0018857	IBN_N	PF03810.19	1.1e-08	1	1
MGP_PahariEiJ_P0018858	IBN_N	PF03810.19	1.1e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0018868	-	686	-	MGP_PahariEiJ_P0018868	65 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0018869	-	4274	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0018862	-	983	-	MGP_PahariEiJ_P0018862	38 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0018863	-	942	-	MGP_PahariEiJ_P0018863	71 (aa)	-	UPI0001F78FF5
MGP_PahariEiJ_T0018860	-	4998	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0018861	-	2784	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0018866	-	984	-	MGP_PahariEiJ_P0018866	87 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0018867	-	403	-	MGP_PahariEiJ_P0018867	134 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0018864	-	640	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0018865	-	546	-	MGP_PahariEiJ_P0018865	131 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0018871	-	765	-	MGP_PahariEiJ_P0018871	254 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0018872	-	791	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0018857	-	4553	XM_021205397	MGP_PahariEiJ_P0018857	1125 (aa)	XP_021061056	UPI000A30DB4B
MGP_PahariEiJ_T0018876	-	687	-	MGP_PahariEiJ_P0018876	28 (aa)	-	UPI0001F78FFD
MGP_PahariEiJ_T0018870	-	609	-	MGP_PahariEiJ_P0018870	141 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0018875	-	377	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0018874	-	332	-	MGP_PahariEiJ_P0018874	35 (aa)	-	UPI0001F78FFC
MGP_PahariEiJ_T0018859	-	2877	-	MGP_PahariEiJ_P0018859	767 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0018858	-	4459	-	MGP_PahariEiJ_P0018858	1124 (aa)	-	UPI000A30E9D5
MGP_PahariEiJ_T0018873	-	2060	-	-	- (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	98.425	ENSG00000169180	XPO6	100	100.000	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	76.017	ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.389	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	97.509	ENSAMEG00000011014	XPO6	100	97.509	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	76.330	ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.418	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	77.511	ENSAOCG00000001326	xpo6	100	76.562	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	77.422	ENSAPEG00000016304	xpo6	100	76.476	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	77.216	ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.168	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	94.306	ENSAPLG00000007480	XPO6	99	94.306	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	82.500	ENSACAG00000016883	XPO6	100	80.052	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	97.778	ENSANAG00000031761	XPO6	100	97.778	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	77.094	ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.094	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	72.324	ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.324	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	97.156	ENSBTAG00000010309	XPO6	100	97.156	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	97.956	ENSCJAG00000006014	XPO6	100	97.956	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	97.776	ENSCAFG00000017356	XPO6	100	97.776	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	97.867	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	98.002	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	97.333	ENSCHIG00000022341	XPO6	100	97.333	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	93.220	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	93.220	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	79	86.784	ENSCAPG00000015567	-	94	98.311	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	97.511	ENSCPOG00000012824	XPO6	100	97.511	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	98.031	ENSCCAG00000036360	XPO6	100	97.689	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	98.044	ENSCATG00000034030	XPO6	100	98.044	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	97.153	ENSCLAG00000012270	XPO6	100	97.153	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	88.214	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	96.510	Choloepus_hoffmanni
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	87.143	ENSCPBG00000024660	XPO6	99	97.059	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	47.378	ENSCING00000006884	-	100	47.378	Ciona_intestinalis
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	46.453	ENSCSAVG00000000850	-	99	46.453	Ciona_savignyi
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	97.867	ENSCANG00000041578	XPO6	100	97.867	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	98.844	ENSCGRG00001013173	Xpo6	100	98.844	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	79	87.665	ENSCGRG00000008729	-	98	99.176	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	76.288	ENSCSEG00000013622	xpo6	100	76.288	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	76.169	ENSCVAG00000017399	xpo6	100	76.169	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	97	71.364	ENSDARG00000041217	xpo6	99	71.364	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	97.600	ENSDNOG00000012449	XPO6	100	97.600	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	97.244	ENSDORG00000000919	Xpo6	100	97.244	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	84.286	ENSETEG00000018768	XPO6	85	95.367	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	61.770	ENSEBUG00000015560	xpo6	99	61.825	Eptatretus_burgeri
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	97.333	ENSEASG00005017296	XPO6	100	97.333	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	97.422	ENSECAG00000008601	XPO6	100	97.422	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	88.571	ENSEEUG00000014587	XPO6	100	90.192	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	78.409	ENSELUG00000009159	xpo6	100	78.409	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	97.689	ENSFCAG00000010309	XPO6	100	97.689	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	92.138	ENSFALG00000004441	XPO6	98	92.138	Ficedula_albicollis
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	97.242	ENSFDAG00000012689	XPO6	100	97.242	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	75.975	ENSFHEG00000021190	xpo6	99	75.975	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	93.956	ENSGALG00000035360	XPO6	100	93.956	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	74.652	ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.652	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	95	94.090	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	94.090	Gopherus_agassizii
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	97.778	ENSGGOG00000005609	XPO6	100	97.778	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	75.521	ENSHBUG00000019504	xpo6	100	75.868	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	82.642	ENSHGLG00000003865	-	99	79.653	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	97.422	ENSHGLG00000009679	-	100	97.422	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	82.642	ENSHGLG00100001081	-	99	82.650	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	97.333	ENSHGLG00100003673	-	99	97.333	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	74.913	ENSHCOG00000004987	xpo6	100	75.087	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	71.853	ENSIPUG00000006516	xpo6	100	71.878	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	97.778	ENSSTOG00000012161	XPO6	100	97.778	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	96.711	ENSJJAG00000019392	Xpo6	100	96.711	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	76.135	ENSKMAG00000010403	xpo6	99	76.135	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	76.909	ENSLBEG00000023039	xpo6	99	76.909	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	85.689	ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.689	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	94	81.232	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.232	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	96.975	ENSLAFG00000011960	XPO6	100	96.975	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	65	86.061	ENSMFAG00000034352	-	82	71.164	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	98.044	ENSMFAG00000045067	XPO6	100	98.044	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	62	85.987	ENSMMUG00000040922	-	98	71.351	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	98.044	ENSMMUG00000018623	XPO6	100	98.044	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	98.044	ENSMNEG00000028587	XPO6	100	98.044	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	62	85.350	ENSMNEG00000039227	-	97	70.541	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	62	84.076	ENSMLEG00000037515	-	97	68.919	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	98.044	ENSMLEG00000029685	XPO6	100	98.044	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	75.671	ENSMAMG00000001351	xpo6	100	76.288	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	77.184	ENSMZEG00005010620	xpo6	99	77.184	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	97	93.254	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	93.254	Meleagris_gallopavo
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	88.849	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	88.849	Mesocricetus_auratus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	98.133	ENSMICG00000001923	XPO6	100	98.133	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	98.844	ENSMOCG00000008015	Xpo6	100	98.844	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	76.732	ENSMMOG00000011992	xpo6	100	76.732	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	94.933	ENSMODG00000015516	XPO6	100	94.933	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	70.771	ENSMALG00000020612	xpo6	99	71.036	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	100	100.000	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	100.000	ENSMUSG00000000131	Xpo6	100	99.467	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	99.111	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	100	99.111	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	96.708	ENSMPUG00000012920	XPO6	98	96.708	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	96.619	ENSMLUG00000012970	XPO6	100	96.619	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	98.843	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	98.843	Nannospalax_galili
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	75.521	ENSNBRG00000007275	xpo6	100	75.868	Neolamprologus_brichardi
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	97.867	ENSNLEG00000011518	XPO6	100	97.867	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	87	96.899	ENSOPRG00000009278	XPO6	87	96.899	Ochotona_princeps
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	96.800	ENSODEG00000012917	XPO6	100	96.800	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	75.347	ENSONIG00000019366	xpo6	100	75.608	Oreochromis_niloticus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	79	84.581	ENSOANG00000004672	-	96	95.973	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	97.687	ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.687	Oryctolagus_cuniculus
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