EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0013708 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: zinc finger protein 764
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11891 bases
Position: chr1:96879110-96891000
Accession: 110327094
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0019212	zf-C2H2	PF00096.26	7.6e-49	1	8
MGP_PahariEiJ_P0019212	zf-C2H2	PF00096.26	7.6e-49	2	8
MGP_PahariEiJ_P0019212	zf-C2H2	PF00096.26	7.6e-49	3	8
MGP_PahariEiJ_P0019212	zf-C2H2	PF00096.26	7.6e-49	4	8
MGP_PahariEiJ_P0019212	zf-C2H2	PF00096.26	7.6e-49	5	8
MGP_PahariEiJ_P0019212	zf-C2H2	PF00096.26	7.6e-49	6	8
MGP_PahariEiJ_P0019212	zf-C2H2	PF00096.26	7.6e-49	7	8
MGP_PahariEiJ_P0019212	zf-C2H2	PF00096.26	7.6e-49	8	8
MGP_PahariEiJ_P0019212	zf-met	PF12874.7	3e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0019212	-	2787	-	MGP_PahariEiJ_P0019212	458 (aa)	XP_021061478	UPI000A312095

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	57	47.644	MGP_PahariEiJ_G0021003	Zfp628	51	46.409
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	69	43.979	MGP_PahariEiJ_G0022533	Zfp637	79	45.045
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	89	39.573	MGP_PahariEiJ_G0025706	Zfp661	96	39.952
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	92	41.762	MGP_PahariEiJ_G0023460	Zfp945	98	42.745
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	59	42.775	MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	99	44.275
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	91	41.150	MGP_PahariEiJ_G0017567	Zfp867	95	41.150
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	61	50.000	MGP_PahariEiJ_G0021011	-	72	50.000
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	87	49.618	MGP_PahariEiJ_G0019959	Zfp251	94	49.618
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	86	43.798	MGP_PahariEiJ_G0021668	Zfp882	99	43.798
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	59	40.541	MGP_PahariEiJ_G0023018	Zfp319	86	38.132
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	90	39.516	MGP_PahariEiJ_G0012663	-	98	39.516
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	70	35.238	MGP_PahariEiJ_G0026165	Zfp64	73	35.238
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	67	40.826	MGP_PahariEiJ_G0021209	Zfp574	75	39.827
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	90	47.967	MGP_PahariEiJ_G0017434	Zfp354b	98	47.967
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	88	35.957	MGP_PahariEiJ_G0021180	Zfp94	91	45.918
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	69	40.741	MGP_PahariEiJ_G0022097	Repin1	91	40.411
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	72	46.360	MGP_PahariEiJ_G0012724	Zfp420	97	46.360
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	81	36.585	MGP_PahariEiJ_G0022203	Prdm5	84	37.097
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	91	45.339	MGP_PahariEiJ_G0023447	Zfp51	95	45.339
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	86	42.797	MGP_PahariEiJ_G0023178	Zfp1	99	42.797
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	88	40.076	MGP_PahariEiJ_G0015741	Zfp759	99	40.076
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	57	47.148	MGP_PahariEiJ_G0021178	Zfp93	89	47.148
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	73	50.000	MGP_PahariEiJ_G0021172	Zfp112	64	50.000
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	87	47.534	MGP_PahariEiJ_G0021173	Zfp235	99	47.534
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	88	45.299	MGP_PahariEiJ_G0021177	Zfp108	99	45.299
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	92	48.374	MGP_PahariEiJ_G0017441	Zfp354a	100	48.374
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	69	45.333	MGP_PahariEiJ_G0019173	Zfp236	61	45.333
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	68	32.281	MGP_PahariEiJ_G0027903	Zbtb41	58	31.746
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	91	43.411	MGP_PahariEiJ_G0015756	Zfp748	99	43.411
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	75	47.710	MGP_PahariEiJ_G0012839	-	71	47.710
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	63	43.575	MGP_PahariEiJ_G0016960	Zbtb49	69	47.945
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	76	45.122	MGP_PahariEiJ_G0017548	Zfp39	73	45.122
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0013709	-	100	100.000
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	58	47.511	MGP_PahariEiJ_G0013707	Zfp768	50	47.321

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	93	79.907	MGP_CAROLIEiJ_G0030501	Zfp764	100	79.907	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	100	87.118	ENSMUSG00000078580	E430018J23Rik	99	87.118	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0013708	-	72	86.667	MGP_SPRETEiJ_G0031614	-	99	86.667	Mus_spretus