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Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0014397 (Gene tree)
Gene ID: 110329209
Gene Symbol: Rpp30
Alias: Rnasep2|TSG15
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p30
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 20750 bases
Position: chr1:147463590-147484339
Accession: 110329209
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0021594	RNase_P_p30	PF01876.16	4.4e-62	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0021594	-	1155	XM_021208807	MGP_PahariEiJ_P0021594	268 (aa)	XP_021064466	UPI000A30C3CF

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	90.299	ENSG00000148688	RPP30	100	90.299	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	96	49.805	ENSAPOG00000023156	rpp30	97	49.805	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	91.045	ENSAMEG00000016776	RPP30	100	91.045	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	87	56.223	ENSACIG00000022810	rpp30	89	51.073	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	55.056	ENSAOCG00000016438	rpp30	89	55.056	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	55.056	ENSAPEG00000008697	rpp30	89	55.056	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	96	57.588	ENSATEG00000015263	rpp30	93	57.588	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	90	73.444	ENSAPLG00000009959	RPP30	100	73.444	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	69.811	ENSACAG00000007996	RPP30	99	69.811	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	78.113	ENSANAG00000009439	RPP30	83	78.113	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	52.239	ENSACLG00000015389	-	99	52.239	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	57.463	ENSAMXG00000040653	rpp30	98	57.463	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	90.299	ENSBTAG00000002973	RPP30	100	90.299	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	88.060	ENSCJAG00000011045	RPP30	100	88.060	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	89.179	ENSCAFG00000031801	RPP30	100	89.179	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	89.179	ENSCAFG00020000258	RPP30	100	89.179	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	87.313	ENSCHIG00000012901	RPP30	100	87.313	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	89.925	ENSTSYG00000013903	RPP30	100	89.925	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	90	70.000	ENSCAPG00000001326	RPP30	100	70.000	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	89.925	ENSCPOG00000033174	RPP30	100	89.925	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	88.806	ENSCCAG00000029514	RPP30	100	88.806	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	89.434	ENSCATG00000042072	RPP30	99	89.434	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	91.045	ENSCLAG00000008595	RPP30	100	91.045	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	89.552	ENSCSAG00000006694	RPP30	100	89.552	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	87	50.781	ENSCHOG00000007023	-	100	50.781	Choloepus_hoffmanni
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	74.436	ENSCPBG00000026518	RPP30	99	74.436	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	87	42.562	ENSCING00000019714	-	89	41.736	Ciona_intestinalis
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	94	38.951	ENSCSAVG00000011282	-	86	38.951	Ciona_savignyi
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	89.552	ENSCANG00000041084	RPP30	100	89.552	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	87	96.983	ENSCGRG00001017068	-	97	96.983	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	79.851	ENSCGRG00001000834	-	100	79.851	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	95.896	ENSCGRG00000002508	-	100	95.896	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	80.224	ENSCGRG00000006196	-	100	80.224	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	51.648	ENSCSEG00000001779	rpp30	93	51.648	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	92	60.081	ENSCVAG00000003139	rpp30	99	57.037	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	59.176	ENSDARG00000027428	rpp30	99	59.176	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	90.299	ENSDNOG00000010186	RPP30	92	90.299	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	90.672	ENSDORG00000015333	Rpp30	100	90.672	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	87	35.685	FBgn0283652	Rpp30	78	35.685	Drosophila_melanogaster
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	87.313	ENSETEG00000018823	RPP30	100	87.313	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	59	37.736	ENSEBUG00000003989	-	87	37.736	Eptatretus_burgeri
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	89.888	ENSEASG00005011050	RPP30	99	89.888	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	89.888	ENSECAG00000021917	RPP30	99	89.888	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	97	64.368	ENSEEUG00000009986	-	99	64.368	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	66.176	ENSELUG00000003731	rpp30	95	66.176	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	90.299	ENSFCAG00000029073	RPP30	93	90.299	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	73.034	ENSFALG00000007711	RPP30	99	73.034	Ficedula_albicollis
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	90.299	ENSFDAG00000019241	RPP30	100	90.299	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	93	55.020	ENSFHEG00000014739	rpp30	97	53.909	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	91	55.159	ENSGMOG00000005379	rpp30	100	55.159	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	72.388	ENSGALG00000006486	RPP30	99	72.581	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	95	54.902	ENSGAFG00000001445	rpp30	94	54.902	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	53.957	ENSGACG00000010285	rpp30	99	53.957	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	72.180	ENSGAGG00000000980	RPP30	69	72.180	Gopherus_agassizii
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	90.299	ENSGGOG00000026917	RPP30	100	90.299	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	52.612	ENSHBUG00000019332	rpp30	99	52.612	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	91.045	ENSHGLG00000013072	RPP30	100	91.045	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	91.045	ENSHGLG00100017798	RPP30	100	91.045	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	94	52.326	ENSHCOG00000004763	-	90	52.326	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	58.672	ENSIPUG00000003863	rpp30	99	58.672	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	89.179	ENSSTOG00000027002	RPP30	100	89.179	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	91.045	ENSJJAG00000020041	Rpp30	100	91.045	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	54.478	ENSKMAG00000015355	rpp30	99	54.478	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	54.982	ENSLBEG00000019989	rpp30	99	54.982	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	72	60.274	ENSLACG00000002534	RPP30	96	60.274	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	63.806	ENSLOCG00000000031	rpp30	99	63.806	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	90.299	ENSLAFG00000015931	RPP30	100	90.299	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	89.552	ENSMFAG00000031109	RPP30	100	89.552	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	89.552	ENSMMUG00000006628	RPP30	100	89.552	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	89.179	ENSMNEG00000033838	RPP30	100	89.179	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	89.552	ENSMLEG00000037578	RPP30	100	89.552	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	55.720	ENSMAMG00000010934	rpp30	99	55.720	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	53.333	ENSMZEG00005018508	-	99	53.333	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	68.284	ENSMGAG00000008452	RPP30	100	68.657	Meleagris_gallopavo
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	94.776	ENSMAUG00000008797	Rpp30	100	94.776	Mesocricetus_auratus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	90.672	ENSMICG00000012019	RPP30	100	90.672	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	92.910	ENSMOCG00000016872	Rpp30	100	92.910	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	97	51.724	ENSMMOG00000009266	rpp30	96	51.724	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	81.273	ENSMODG00000006863	-	99	81.273	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	68.914	ENSMODG00000009342	-	99	68.914	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	98	55.133	ENSMALG00000011718	rpp30	96	55.133	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	97.753	MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	99	97.753	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	97.761	ENSMUSG00000024800	Rpp30	100	97.761	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	97.388	MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	100	97.388	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	90.943	ENSMPUG00000017258	RPP30	93	90.943	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	89.888	ENSMLUG00000017169	RPP30	99	89.888	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	91.045	ENSNGAG00000012018	-	100	91.045	Nannospalax_galili
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	73.881	ENSNGAG00000014392	-	100	73.881	Nannospalax_galili
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	94	46.875	ENSNBRG00000024170	-	95	46.875	Neolamprologus_brichardi
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	90.672	ENSNLEG00000012383	RPP30	100	90.672	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	71.587	ENSMEUG00000015587	-	100	71.587	Notamacropus_eugenii
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	53	92.254	ENSOPRG00000007367	-	100	92.254	Ochotona_princeps
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	67.164	ENSODEG00000004560	-	100	67.164	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	98	91.255	ENSODEG00000004530	-	100	91.255	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	77	54.589	ENSONIG00000019140	rpp30	100	54.589	Oreochromis_niloticus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	79.401	ENSOANG00000003415	RPP30	99	79.401	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	87.687	ENSOCUG00000006896	RPP30	92	87.687	Oryctolagus_cuniculus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	95	55.118	ENSORLG00000020420	rpp30	87	55.118	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	54.104	ENSORLG00020009037	-	99	54.104	Oryzias_latipes_hni
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	54.104	ENSORLG00015008300	rpp30	93	54.104	Oryzias_latipes_hsok
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	68	52.717	ENSOMEG00000012640	-	98	52.717	Oryzias_melastigma
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	89.552	ENSOGAG00000013963	RPP30	100	89.552	Otolemur_garnettii
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	98	83.206	ENSOARG00000015789	RPP30	98	83.206	Ovis_aries
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	90.299	ENSPPAG00000043779	RPP30	100	90.299	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	90.672	ENSPPRG00000000115	RPP30	100	90.672	Panthera_pardus
MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	100	90.672	ENSPTIG00000014949	RPP30	100	90.672	Panthera_tigris_altaica
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