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Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0015901 (Gene tree)
Gene ID: 110329036
Gene Symbol: Tnpo1
Alias: D13Ertd688e|Kpnb2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 83270 bases
Position: chr11:29946517-30029786
Accession: 110329036
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0026916	IBN_N	PF03810.19	7.8e-17	1	1
MGP_PahariEiJ_P0026915	IBN_N	PF03810.19	7.8e-16	1	1
MGP_PahariEiJ_P0026914	IBN_N	PF03810.19	1e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0026916	-	613	-	MGP_PahariEiJ_P0026916	178 (aa)	-	UPI000268B4EB
MGP_PahariEiJ_T0026915	-	2502	-	MGP_PahariEiJ_P0026915	807 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0026914	-	5175	-	MGP_PahariEiJ_P0026914	898 (aa)	XP_021064239	UPI000A308BBE

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	99	85.821	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	99	85.682

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSG00000083312	TNPO1	100	100.000	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	94.052	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.559	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.820	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.152	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	94.176	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	93.933	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	94.176	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.804	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	99	92.509	ENSAPLG00000009619	-	97	93.448	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	97.150	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	67.978	ENSANAG00000027118	-	99	63.978	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSANAG00000022453	-	100	99.109	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	88.196	ENSANAG00000025351	-	100	88.196	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.820	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.798	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.258	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	99.555	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.220	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	96	99.225	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.300	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.404	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.443	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	99	95.254	ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.513	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	63	93.750	ENSCCAG00000020805	-	76	91.597	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.109	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	99.555	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.109	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSCSAG00000015616	TNPO1	100	99.443	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	86.121	ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	86.659	Choloepus_hoffmanni
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	97.770	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.531	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	80	78.169	ENSCING00000021247	-	99	78.169	Ciona_intestinalis
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	99	75.990	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.533	Ciona_savignyi
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSCANG00000004353	TNPO1	100	99.555	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.889	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	96	99.870	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	99.883	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	92.689	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.360	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.432	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.034	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	92.698	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	99.438	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	93.304	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	93	99.197	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.276	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	99	58.032	FBgn0035693	CG8219	99	57.223	Drosophila_melanogaster
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	89	99.543	ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.251	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	94	85.469	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.119	Eptatretus_burgeri
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	99.555	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	99.438	ENSECAG00000024424	TNPO1	100	99.332	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	89.888	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.383	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	99.555	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	97.753	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.191	Ficedula_albicollis
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.220	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.820	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.378	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	92.135	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.855	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	97.753	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.517	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.258	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.152	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.820	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	97.522	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.303	Gopherus_agassizii
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	83.146	ENSGGOG00000022535	-	99	82.793	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	99.555	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.820	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.371	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	68	85.950	ENSHGLG00000001198	-	93	84.821	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSHGLG00000000970	-	100	99.109	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	96	98.836	ENSHGLG00100017090	-	99	98.949	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	75.167	ENSHGLG00100000963	-	100	74.610	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	98.876	ENSSTOG00000021784	-	100	98.876	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.441	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.680	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.371	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.258	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.012	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	96	91.120	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.302	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	95.415	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	95.078	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	97	98.723	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.730	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSMFAG00000003636	TNPO1	100	99.555	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	99.443	ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.443	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSMNEG00000044581	TNPO1	100	99.555	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSMLEG00000030740	TNPO1	100	99.555	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.804	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.820	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.146	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.409	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.776	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	92.697	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.655	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	99	97.674	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.660	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	92.565	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	100.000	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	100.000	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	100.000	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSMPUG00000014387	TNPO1	100	99.443	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	96	98.840	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.836	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	99.666	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.666	Nannospalax_galili
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.820	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	93.023	Neolamprologus_brichardi
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	99.555	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	97	99.419	ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	92.966	Ochotona_princeps
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	69	87.805	ENSODEG00000009802	-	96	86.614	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	99.438	ENSODEG00000001771	TNPO1	100	98.886	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.820	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.444	Oreochromis_niloticus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	96	97.927	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.683	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	96	92.109	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.874	Oryctolagus_cuniculus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	98	92.571	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.477	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	99	93.035	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.785	Oryzias_latipes_hni
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	99	93.159	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	92.897	Oryzias_latipes_hsok
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	99	93.159	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	92.785	Oryzias_melastigma
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSOGAG00000000808	TNPO1	100	99.443	Otolemur_garnettii
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.555	Ovis_aries
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSPPAG00000042518	TNPO1	100	99.555	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	99.555	Panthera_pardus
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	99.555	Panthera_tigris_altaica
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	99	90.395	ENSPTRG00000047731	-	100	86.464	Pan_troglodytes
MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	ENSPTRG00000016972	TNPO1	100	99.555	Pan_troglodytes
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