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Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0016104 (Gene tree)
Gene ID: 110329523
Gene Symbol: Dnase1
Alias: DNaseI|Dnl1
Full Name: deoxyribonuclease 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3065 bases
Position: chr12:323500-326564
Accession: 110329523
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0027551	Exo_endo_phos	PF03372.23	9.7e-08	1	1
MGP_PahariEiJ_P0027553	Exo_endo_phos	PF03372.23	9.7e-08	1	1
MGP_PahariEiJ_P0027550	Exo_endo_phos	PF03372.23	3.1e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0027550	-	992	-	MGP_PahariEiJ_P0027550	225 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0027551	-	1483	XM_021209174	MGP_PahariEiJ_P0027551	284 (aa)	XP_021064833	UPI000A30E626
MGP_PahariEiJ_T0027552	-	602	-	MGP_PahariEiJ_P0027552	71 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0027553	-	1289	XM_021209176	MGP_PahariEiJ_P0027553	284 (aa)	XP_021064834	UPI000A30E626
MGP_PahariEiJ_T0027554	-	2764	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0027555	-	1315	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0027556	-	921	-	MGP_PahariEiJ_P0027556	203 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0027557	-	711	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0027558	-	835	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0027559	-	405	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0027560	-	368	-	MGP_PahariEiJ_P0027560	63 (aa)	-	UPI000246763B

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	93	54.753	MGP_PahariEiJ_G0023500	Dnase1l2	100	55.676
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	98	48.043	MGP_PahariEiJ_G0029953	Dnase1l3	85	49.434
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	99	40.845	MGP_PahariEiJ_G0031720	Dnase1l1	88	40.845

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	94	47.970	ENSG00000163687	DNASE1L3	85	55.556	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	96	41.455	ENSG00000013563	DNASE1L1	91	40.206	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	81.609	ENSG00000213918	DNASE1	100	80.556	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	55.725	ENSG00000167968	DNASE1L2	92	55.725	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	45.714	ENSAPOG00000008146	-	90	47.347	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	100	53.333	ENSAPOG00000021606	dnase1	93	55.385	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	100	46.053	ENSAPOG00000003018	dnase1l1l	90	47.925	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	45.594	ENSAPOG00000020468	dnase1l4.1	93	45.594	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	47.727	ENSAMEG00000011952	DNASE1L3	85	47.925	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	80.916	ENSAMEG00000010715	DNASE1	99	79.152	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	99	34.498	ENSAMEG00000000229	DNASE1L1	82	38.951	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	91	51.773	ENSAMEG00000017843	DNASE1L2	93	51.761	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	41.288	ENSACIG00000022468	dnase1l4.2	90	41.288	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	89	54.500	ENSACIG00000008699	dnase1	91	52.692	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	100	46.491	ENSACIG00000005668	dnase1l1l	90	47.547	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	43.346	ENSACIG00000017288	dnase1l4.1	98	43.346	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	94	45.756	ENSACIG00000005566	-	82	46.415	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	47.529	ENSAOCG00000019015	-	82	47.529	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	44.275	ENSAOCG00000003580	dnase1l4.1	80	44.275	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	100	46.491	ENSAOCG00000012703	dnase1l1l	90	48.689	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	99	52.669	ENSAOCG00000001456	dnase1	93	54.615	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	100	46.930	ENSAPEG00000021069	dnase1l1l	90	49.057	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	43.939	ENSAPEG00000022607	dnase1l4.1	88	43.939	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	98	51.339	ENSAPEG00000018601	dnase1	93	53.030	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	47.529	ENSAPEG00000017962	-	82	47.529	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	94	49.446	ENSATEG00000018710	dnase1l1l	90	50.189	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	90	51.562	ENSATEG00000015946	dnase1	93	50.958	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	94	46.468	ENSATEG00000022981	-	80	46.768	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	91	46.512	ENSATEG00000015888	dnase1	93	46.538	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	49.811	ENSAPLG00000009829	DNASE1L3	85	49.811	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	97	59.174	ENSAPLG00000008612	DNASE1L2	92	58.015	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	93	46.840	ENSACAG00000026130	-	91	46.816	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	96	60.185	ENSACAG00000004892	-	89	59.696	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	83	52.941	ENSACAG00000001921	DNASE1L3	89	52.941	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	46.067	ENSACAG00000008098	-	83	46.241	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	96	60.185	ENSACAG00000015589	-	87	61.321	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	98	52.727	ENSACAG00000000546	DNASE1L2	75	55.328	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	94	42.066	ENSANAG00000037772	DNASE1L3	85	42.642	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	91	52.158	ENSANAG00000024478	DNASE1L2	93	52.837	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	96	41.455	ENSANAG00000019417	DNASE1L1	84	41.762	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	99	81.206	ENSANAG00000026935	DNASE1	100	81.206	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	89	56.000	ENSACLG00000011593	dnase1	93	52.874	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	93	47.940	ENSACLG00000000516	-	73	49.153	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	89	56.000	ENSACLG00000009493	-	93	52.874	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	89	56.000	ENSACLG00000009226	-	96	52.536	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	89	56.000	ENSACLG00000011618	-	93	52.874	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	89	56.000	ENSACLG00000011605	-	93	52.874	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	36.398	ENSACLG00000009063	dnase1l4.1	86	36.015	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	89	56.000	ENSACLG00000009537	dnase1	93	52.874	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	89	56.000	ENSACLG00000009478	-	93	52.874	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	89	56.000	ENSACLG00000011569	dnase1	93	52.874	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	89	46.304	ENSACLG00000026440	dnase1l1l	91	46.304	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	89	56.000	ENSACLG00000009526	dnase1	93	52.874	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	89	54.589	ENSACLG00000025989	dnase1	99	51.590	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	90	55.172	ENSACLG00000009515	dnase1	99	52.896	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	98	47.500	ENSAMXG00000043674	dnase1l1	84	48.289	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	96	45.455	ENSAMXG00000034033	DNASE1L3	92	45.076	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	99	45.296	ENSAMXG00000041037	dnase1l1l	90	46.241	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	93	50.952	ENSAMXG00000002465	dnase1	94	50.382	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	91	77.907	ENSBTAG00000020107	DNASE1	99	76.868	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	97	53.381	ENSBTAG00000009964	DNASE1L2	92	54.789	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	93	50.373	ENSBTAG00000018294	DNASE1L3	87	50.566	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	43.561	ENSBTAG00000007455	DNASE1L1	81	43.511	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	91	83.824	ENSCJAG00000019687	DNASE1	100	80.851	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	94	47.970	ENSCJAG00000019760	DNASE1L3	87	48.679	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	91	54.444	ENSCJAG00000014997	DNASE1L2	92	54.212	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	96	41.455	ENSCJAG00000011800	DNASE1L1	84	41.762	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	49.242	ENSCAFG00000007419	DNASE1L3	87	49.434	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	93	42.857	ENSCAFG00000019555	DNASE1L1	87	42.966	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	80.460	ENSCAFG00000019267	DNASE1	99	79.152	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	80.460	ENSCAFG00020025699	DNASE1	99	79.152	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	93	42.857	ENSCAFG00020009104	DNASE1L1	87	42.966	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	91	56.757	ENSCAFG00020026165	DNASE1L2	92	56.489	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	90	49.510	ENSCAFG00020010119	DNASE1L3	89	49.600	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	43.182	ENSCHIG00000021139	DNASE1L1	81	43.130	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	55.385	ENSCHIG00000008968	DNASE1L2	92	55.172	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	93	50.373	ENSCHIG00000022130	DNASE1L3	87	50.566	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	91	79.457	ENSCHIG00000018726	DNASE1	99	77.936	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	99	42.403	ENSTSYG00000004076	DNASE1L1	83	42.692	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	83.588	ENSTSYG00000032286	DNASE1	99	81.625	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	91	54.135	ENSTSYG00000030671	DNASE1L2	92	53.903	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	50.382	ENSTSYG00000013494	DNASE1L3	86	50.382	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	98	51.121	ENSCAPG00000015672	DNASE1L2	92	52.290	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	90	48.529	ENSCAPG00000005812	DNASE1L3	84	49.767	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	97	39.928	ENSCAPG00000010488	DNASE1L1	81	40.304	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	91	49.237	ENSCPOG00000038516	DNASE1L3	86	49.430	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	98	51.121	ENSCPOG00000040802	DNASE1L2	92	52.290	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	97	39.928	ENSCPOG00000005648	DNASE1L1	83	40.304	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	94	48.699	ENSCCAG00000024544	DNASE1L3	86	49.430	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	96	41.241	ENSCCAG00000038109	DNASE1L1	84	41.538	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	82.375	ENSCCAG00000027001	DNASE1	93	82.375	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	93	51.943	ENSCCAG00000035605	DNASE1L2	93	52.482	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	94	47.970	ENSCATG00000033881	DNASE1L3	87	48.679	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	82.375	ENSCATG00000038521	DNASE1	100	80.142	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	55.939	ENSCATG00000039235	DNASE1L2	92	55.939	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	94	42.379	ENSCATG00000014042	DNASE1L1	84	42.912	Cercocebus_atys
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MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	92	47.148	ENSXMAG00000004811	-	83	47.148	Xiphophorus_maculatus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	91	44.615	ENSXMAG00000007820	-	96	42.857	Xiphophorus_maculatus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	100	42.982	ENSXMAG00000009859	dnase1l1l	92	44.980	Xiphophorus_maculatus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	90	52.734	ENSXMAG00000008652	dnase1	91	52.308	Xiphophorus_maculatus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	91	43.893	ENSXMAG00000019357	dnase1l4.2	80	43.893	Xiphophorus_maculatus
MGP_PahariEiJ_G0016104	Dnase1	90	41.634	ENSXMAG00000006848	-	99	41.634	Xiphophorus_maculatus