EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0016746 (Gene tree)
Gene ID: 110330194
Gene Symbol: Papolg
Alias: 9630006B20Rik
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 36456 bases
Position: chr13:6782863-6819318
Accession: 110330194
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0030034	PAP_RNA-bind	PF04926.15	2.5e-27	1	2
MGP_PahariEiJ_P0030034	PAP_RNA-bind	PF04926.15	2.5e-27	2	2
MGP_PahariEiJ_P0030035	PAP_RNA-bind	PF04926.15	2.6e-27	1	2
MGP_PahariEiJ_P0030035	PAP_RNA-bind	PF04926.15	2.6e-27	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0030036	-	1882	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0030035	-	3729	-	MGP_PahariEiJ_P0030035	739 (aa)	XP_021065816	UPI000A310083
MGP_PahariEiJ_T0030034	-	6260	-	MGP_PahariEiJ_P0030034	731 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download MGP_PahariEiJ_G0016746's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download MGP_PahariEiJ_G0016746's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	77	66.607	MGP_PahariEiJ_G0024534	Papolb	86	66.607
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	99	60.680	MGP_PahariEiJ_G0029850	Papola	98	60.680

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	93.522	ENSG00000115421	PAPOLG	100	99.573	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	72.437	ENSAPOG00000004798	papolg	99	70.081	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.407	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	94.173	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	70.350	ENSACIG00000010546	papolg	99	70.699	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	72.170	ENSAOCG00000010254	papolg	89	72.304	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	72.304	ENSAPEG00000006944	papolg	89	72.437	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	72.400	ENSATEG00000009007	papolg	79	86.373	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	73.727	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.727	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	81	63.339	ENSACAG00000015048	-	100	63.339	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	93.792	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	93.792	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	69.390	ENSACLG00000015592	papolg	89	70.703	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	73.557	ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.377	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.197	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	94.197	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.062	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.062	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	93.657	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	85.330	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	92.236	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	93.173	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.062	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	94.062	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.332	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	94.332	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	52	91.316	ENSCAPG00000014901	-	99	91.316	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.730	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	94.730	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.197	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.197	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	91	98.268	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	98.268	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.737	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	94.737	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.197	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	94.197	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	90	91.806	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	91.806	Choloepus_hoffmanni
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	68	64.072	ENSCING00000024664	-	93	64.072	Ciona_intestinalis
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	66	65.083	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.083	Ciona_savignyi
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.062	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	94.062	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	96.306	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	96.306	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	96.306	ENSCGRG00000005552	-	100	96.306	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	70.175	ENSCSEG00000000771	papolg	99	70.445	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	68.407	ENSCVAG00000016602	papolg	95	79.783	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	72.980	ENSDARG00000012141	papolg	100	72.980	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	92.973	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	92.973	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	58	99.065	ENSDORG00000016228	Papolg	99	99.065	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	99	73.433	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	73.370	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	65	57.294	ENSEBUG00000005042	-	81	57.294	Eptatretus_burgeri
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	60	71.279	ENSEBUG00000004020	papolg	90	71.279	Eptatretus_burgeri
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.332	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	94.467	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.332	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	94.407	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	83.108	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	83.108	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	72.832	ENSELUG00000014497	papolg	99	64.833	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.332	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	94.332	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	99	66.486	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	65.559	Ficedula_albicollis
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.332	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	94.332	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	67	61.464	ENSFHEG00000019080	papolg	90	62.722	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	83	82.936	ENSGMOG00000018772	papolg	92	82.491	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	71.024	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	70.533	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	68.734	ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.709	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	71.353	ENSGACG00000002718	papolg	100	71.523	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.062	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	94.062	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	69.390	ENSHBUG00000004882	papolg	89	70.169	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.952	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	94.580	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	95.007	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	95.007	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	70.173	ENSHCOG00000006782	papolg	89	70.573	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	71.658	ENSIPUG00000021642	papolg	100	72.326	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	95.277	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.277	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	58	98.832	ENSJJAG00000015601	Papolg	99	98.832	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	70.390	ENSKMAG00000016439	papolg	97	68.993	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	67.944	ENSLBEG00000023218	papolg	89	68.286	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	70.296	ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.267	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	73.001	ENSLOCG00000016130	papolg	100	73.001	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	93.315	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	98.131	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.062	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	94.197	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.062	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	94.197	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	85.121	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	85.255	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	93.657	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	93.792	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	72.112	ENSMAMG00000010667	papolg	99	69.865	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	69.986	ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.845	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	71.255	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	70.628	Meleagris_gallopavo
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	96.170	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	96.170	Mesocricetus_auratus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.737	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	94.737	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	96.346	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	96.346	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	71.580	ENSMMOG00000008020	papolg	99	71.580	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	86.910	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	86.910	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	71.315	ENSMALG00000007012	papolg	89	71.580	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	98.917	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	100	99.534	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	98.647	ENSMUSG00000020273	Papolg	100	99.534	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	98.512	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	100	99.534	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.197	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	94.332	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	92.623	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	92.266	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	95.670	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	95.670	Nannospalax_galili
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	99	63.539	ENSNBRG00000011943	papolg	99	64.477	Neolamprologus_brichardi
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	58	98.598	ENSNLEG00000009507	-	99	98.598	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	81	78.261	ENSMEUG00000013605	-	88	78.082	Notamacropus_eugenii
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.062	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	94.062	Ochotona_princeps
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	58	94.588	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	95.238	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	64.793	ENSONIG00000002985	papolg	100	65.328	Oreochromis_niloticus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	85.638	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	85.638	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	95.277	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	95.277	Oryctolagus_cuniculus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	70.147	ENSORLG00000001577	papolg	89	70.277	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	70.336	ENSORLG00020002482	papolg	89	70.464	Oryzias_latipes_hni
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	70.147	ENSORLG00015008836	papolg	89	70.277	Oryzias_latipes_hsok
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	69.519	ENSOMEG00000001406	papolg	89	69.525	Oryzias_melastigma
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	59	87.674	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	87.674	Otolemur_garnettii
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.062	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	94.062	Ovis_aries
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	93.522	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	93.522	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.332	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	94.332	Panthera_pardus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.197	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	94.197	Panthera_tigris_altaica
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	93.522	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	93.522	Pan_troglodytes
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	89.637	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	89.771	Papio_anubis
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	90	73.273	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	73.077	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	72.703	ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.667	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	78.437	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.437	Pelodiscus_sinensis
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	95.896	ENSPEMG00000008960	-	100	95.896	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	52.941	ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.941	Petromyzon_marinus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	67	63.395	ENSPMAG00000004864	-	96	63.395	Petromyzon_marinus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	87.045	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	86.916	Phascolarctos_cinereus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	69.867	ENSPFOG00000012909	papolg	99	70.040	Poecilia_formosa
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	69.960	ENSPLAG00000018445	papolg	89	70.013	Poecilia_latipinna
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	68.833	ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.673	Poecilia_mexicana
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	76	83.183	ENSPREG00000010358	papolg	89	69.645	Poecilia_reticulata
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	93.657	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	93.657	Pongo_abelii
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	81.173	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.224	Procavia_capensis
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	83.941	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	83.941	Propithecus_coquereli
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	89	92.793	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	92.718	Pteropus_vampyrus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	70.811	ENSPNYG00000006729	papolg	99	70.811	Pundamilia_nyererei
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	72.788	ENSPNAG00000015521	papolg	100	72.557	Pygocentrus_nattereri
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	97.158	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	97.158	Rattus_norvegicus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	88.124	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	88.124	Rhinopithecus_bieti
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.062	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	94.062	Rhinopithecus_roxellana
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	93.657	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	93.792	Saimiri_boliviensis_boliviensis
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	95	86.950	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	86.950	Sarcophilus_harrisii
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	64.690	ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.690	Scleropages_formosus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	69.947	ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.947	Scleropages_formosus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	71.946	ENSSDUG00000000912	papolg	99	70.541	Seriola_dumerili
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	72.304	ENSSLDG00000001217	papolg	99	68.011	Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	99	78.912	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	77.867	Sphenodon_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	69.865	ENSSPAG00000009004	papolg	99	69.865	Stegastes_partitus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.332	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	94.332	Sus_scrofa
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	74	76.155	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	99	76.155	Taeniopygia_guttata
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	70.216	ENSTRUG00000006410	papolg	99	70.216	Takifugu_rubripes
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	65.744	ENSTNIG00000017106	papolg	100	65.744	Tetraodon_nigroviridis
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	86.357	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	86.395	Tupaia_belangeri
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	89.069	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	89.204	Tursiops_truncatus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.270	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	94.407	Ursus_americanus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.270	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	94.407	Ursus_maritimus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	90.177	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	90.340	Vicugna_pacos
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	93.792	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	93.927	Vulpes_vulpes
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	99	75.203	ENSXETG00000002208	papolg	100	74.138	Xenopus_tropicalis
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	68	85.170	ENSXCOG00000006611	papolg	73	85.170	Xiphophorus_couchianus
MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	75	82.600	ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.600	Xiphophorus_maculatus