EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0016754 (Gene tree)
Gene ID: 110331012
Gene Symbol: Xpo1
Alias: Crm1
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 46317 bases
Position: chr13:7386000-7432316
Accession: 110331012
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0030076	CRM1_C	PF08767.11	3.2e-134	1	1
MGP_PahariEiJ_P0030077	CRM1_C	PF08767.11	3.2e-134	1	1
MGP_PahariEiJ_P0030078	CRM1_C	PF08767.11	3.2e-134	1	1
MGP_PahariEiJ_P0030079	CRM1_C	PF08767.11	3.2e-134	1	1
MGP_PahariEiJ_P0030080	CRM1_C	PF08767.11	3.2e-19	1	1
MGP_PahariEiJ_P0030076	Xpo1	PF08389.12	9.6e-41	1	1
MGP_PahariEiJ_P0030077	Xpo1	PF08389.12	9.6e-41	1	1
MGP_PahariEiJ_P0030078	Xpo1	PF08389.12	9.6e-41	1	1
MGP_PahariEiJ_P0030079	Xpo1	PF08389.12	9.6e-41	1	1
MGP_PahariEiJ_P0030076	IBN_N	PF03810.19	4.3e-12	1	1
MGP_PahariEiJ_P0030077	IBN_N	PF03810.19	4.3e-12	1	1
MGP_PahariEiJ_P0030078	IBN_N	PF03810.19	4.3e-12	1	1
MGP_PahariEiJ_P0030079	IBN_N	PF03810.19	4.3e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0030077	-	5431	-	MGP_PahariEiJ_P0030077	1071 (aa)	XP_021066985	UPI000A306993
MGP_PahariEiJ_T0030076	-	6001	-	MGP_PahariEiJ_P0030076	1071 (aa)	XP_021066985	UPI000A306993
MGP_PahariEiJ_T0030082	-	465	-	MGP_PahariEiJ_P0030082	59 (aa)	-	UPI000059DC2D
MGP_PahariEiJ_T0030080	-	698	-	MGP_PahariEiJ_P0030080	232 (aa)	-	UPI0000EE0628
MGP_PahariEiJ_T0030081	-	2907	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0030079	-	3471	-	MGP_PahariEiJ_P0030079	1071 (aa)	XP_021066985	UPI000A306993
MGP_PahariEiJ_T0030078	-	4863	-	MGP_PahariEiJ_P0030078	1071 (aa)	XP_021066985	UPI000A306993

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	97.946	ENSG00000082898	XPO1	100	100.000	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	88	89.468	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	89.468	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	95.425	ENSAPOG00000004984	-	100	95.425	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.974	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	98.974	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	81.227	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	91.809	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	88	95.638	ENSACIG00000010818	-	100	95.638	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	91.223	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	91.223	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	95.425	ENSAOCG00000010121	-	100	95.425	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	91	91.658	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	91.658	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	95.425	ENSAPEG00000007038	-	100	95.425	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	90.850	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	90.850	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	95.425	ENSATEG00000008816	-	100	95.425	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.786	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	98.786	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.599	ENSACAG00000002501	XPO1	100	98.599	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	97.946	ENSANAG00000020802	XPO1	100	97.946	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	95.238	ENSACLG00000015192	-	100	95.238	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	81.227	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	92.128	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	95.798	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	95.798	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	82.310	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.008	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	99.066	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	99.066	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	55.957	WBGene00002078	xpo-1	99	51.571	Caenorhabditis_elegans
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	97.946	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	97.946	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	99.066	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	99.066	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	93	98.896	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	98.896	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	99.066	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	99.066	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	99.066	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	99.066	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	94	78.824	ENSCAPG00000006454	-	100	95.035	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	97.759	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	97.759	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	79.221	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.406	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	96.007	ENSCATG00000032674	XPO1	100	97.660	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.973	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.973	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	97.946	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	97.946	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	83.755	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	98.962	Choloepus_hoffmanni
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.693	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.693	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	80.633	ENSCING00000024562	-	100	80.633	Ciona_intestinalis
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	99	79.739	ENSCSAVG00000005965	-	99	79.739	Ciona_savignyi
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	94.024	ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.227	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	99.253	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	99.253	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	99.253	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	99.253	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	83.032	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	94.468	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	90.663	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	90.663	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	95.331	ENSCVAG00000016788	-	100	95.331	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	92.624	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	94.272	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	96.172	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	96.172	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.973	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	98.973	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	92	95.521	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.521	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	99	71.134	FBgn0020497	emb	99	71.134	Drosophila_melanogaster
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	94	97.419	ENSETEG00000018045	XPO1	94	97.419	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	78.700	ENSEBUG00000012580	-	100	87.113	Eptatretus_burgeri
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	99.066	ENSEASG00005007223	XPO1	100	99.066	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	99.066	ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.219	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	92	100.000	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	85.171	ENSELUG00000014306	-	99	92.398	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	88	94.362	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	94.362	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	99.066	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	99.066	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.599	ENSFALG00000010989	XPO1	100	98.599	Ficedula_albicollis
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	97.386	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	97.386	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	90.850	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	90.850	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	94	82.197	ENSFHEG00000018974	-	98	97.165	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	89.449	ENSGMOG00000019063	-	100	89.449	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	92.157	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	92.157	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.786	ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.786	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	80.866	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	91.702	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	91	95.366	ENSGAFG00000003355	-	98	95.366	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	90.756	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.756	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	95.145	ENSGACG00000002743	-	100	95.145	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.599	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.599	Gopherus_agassizii
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	97.946	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	97.946	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	95.331	ENSHBUG00000020037	-	100	95.331	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	91.410	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	91.410	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.880	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	98.880	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.880	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	98.880	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	83.032	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	94.468	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	93.277	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.277	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	95.798	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	95.798	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.880	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	98.880	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.973	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	98.973	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	90.663	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	90.663	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	94.865	ENSKMAG00000016218	-	100	94.865	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	95.425	ENSLBEG00000005740	-	100	95.425	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	81.227	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	89.301	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	77.193	ENSLACG00000018213	XPO1	100	77.193	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	96.265	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	96.265	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.693	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	98.693	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	97.946	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	97.946	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	97.946	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	97.946	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	97.946	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	97.946	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	96.279	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	96.279	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	91.223	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	91.223	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	95.331	ENSMAMG00000010568	-	100	95.331	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	91.410	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	91.410	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	95.238	ENSMZEG00005018158	-	98	95.366	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	83.755	ENSMGAG00000001496	-	99	98.483	Meleagris_gallopavo
MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	99.253	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	99.253	Mesocricetus_auratus
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MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	99.533	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	99.533	Microtus_ochrogaster
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