EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0017280 (Gene tree)
Gene ID: 110330640
Gene Symbol: Gfi1
Alias: Gfi-1|Pal-1|Pal1
Full Name: growth factor independent 1 transcriptional repressor
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9256 bases
Position: chr13:95588906-95598161
Accession: 110330640
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0032691	zf-C2H2	PF00096.26	4.6e-28	1	6
MGP_PahariEiJ_P0032691	zf-C2H2	PF00096.26	4.6e-28	2	6
MGP_PahariEiJ_P0032691	zf-C2H2	PF00096.26	4.6e-28	3	6
MGP_PahariEiJ_P0032691	zf-C2H2	PF00096.26	4.6e-28	4	6
MGP_PahariEiJ_P0032691	zf-C2H2	PF00096.26	4.6e-28	5	6
MGP_PahariEiJ_P0032691	zf-C2H2	PF00096.26	4.6e-28	6	6
MGP_PahariEiJ_P0032692	zf-C2H2	PF00096.26	4.6e-28	1	6
MGP_PahariEiJ_P0032692	zf-C2H2	PF00096.26	4.6e-28	2	6
MGP_PahariEiJ_P0032692	zf-C2H2	PF00096.26	4.6e-28	3	6
MGP_PahariEiJ_P0032692	zf-C2H2	PF00096.26	4.6e-28	4	6
MGP_PahariEiJ_P0032692	zf-C2H2	PF00096.26	4.6e-28	5	6
MGP_PahariEiJ_P0032692	zf-C2H2	PF00096.26	4.6e-28	6	6
MGP_PahariEiJ_P0032693	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-27	1	6
MGP_PahariEiJ_P0032693	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-27	2	6
MGP_PahariEiJ_P0032693	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-27	3	6
MGP_PahariEiJ_P0032693	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-27	4	6
MGP_PahariEiJ_P0032693	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-27	5	6
MGP_PahariEiJ_P0032693	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-27	6	6
MGP_PahariEiJ_P0032694	zf-C2H2	PF00096.26	9e-25	1	4
MGP_PahariEiJ_P0032694	zf-C2H2	PF00096.26	9e-25	2	4
MGP_PahariEiJ_P0032694	zf-C2H2	PF00096.26	9e-25	3	4
MGP_PahariEiJ_P0032694	zf-C2H2	PF00096.26	9e-25	4	4
MGP_PahariEiJ_P0032694	zf-met	PF12874.7	2.1e-08	1	1
MGP_PahariEiJ_P0032691	zf-met	PF12874.7	2.5e-07	1	1
MGP_PahariEiJ_P0032692	zf-met	PF12874.7	2.5e-07	1	1
MGP_PahariEiJ_P0032693	zf-met	PF12874.7	4.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0032691	-	2622	XM_021210888	MGP_PahariEiJ_P0032691	423 (aa)	XP_021066547	UPI000A311009
MGP_PahariEiJ_T0032693	-	2613	-	MGP_PahariEiJ_P0032693	489 (aa)	-	UPI000A31142F
MGP_PahariEiJ_T0032692	-	2834	-	MGP_PahariEiJ_P0032692	423 (aa)	XP_021066548	UPI000A311009
MGP_PahariEiJ_T0032695	-	689	-	MGP_PahariEiJ_P0032695	186 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0032694	-	1463	-	MGP_PahariEiJ_P0032694	135 (aa)	-	UPI0000ECFA75

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	48.819	MGP_PahariEiJ_G0015756	Zfp748	92	49.068
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	99	45.133	MGP_PahariEiJ_G0022203	Prdm5	74	43.846
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	47.368	MGP_PahariEiJ_G0026165	Zfp64	70	38.298
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	45.185	MGP_PahariEiJ_G0015741	Zfp759	91	45.185
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	44.030	MGP_PahariEiJ_G0017548	Zfp39	58	44.030
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	45.238	MGP_PahariEiJ_G0017567	Zfp867	80	45.238
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	46.269	MGP_PahariEiJ_G0023447	Zfp51	82	43.605
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	47.015	MGP_PahariEiJ_G0012663	-	77	47.015
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	48.031	MGP_PahariEiJ_G0017434	Zfp354b	69	48.031
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	99	50.459	MGP_PahariEiJ_G0019324	Zkscan4	56	50.459
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	46.457	MGP_PahariEiJ_G0021180	Zfp94	74	46.457
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	49.254	MGP_PahariEiJ_G0019959	Zfp251	65	49.254
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	99	45.570	MGP_PahariEiJ_G0021209	Zfp574	61	43.925
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	48.031	MGP_PahariEiJ_G0021173	Zfp235	61	48.031
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	49.206	MGP_PahariEiJ_G0021177	Zfp108	60	49.206
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	47.761	MGP_PahariEiJ_G0021178	Zfp93	90	47.761
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	99	48.413	MGP_PahariEiJ_G0025706	Zfp661	69	43.030
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	99	47.368	MGP_PahariEiJ_G0021011	-	69	46.753
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	44.444	MGP_PahariEiJ_G0021013	Zfp784	65	44.444
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	39.535	MGP_PahariEiJ_G0023018	Zfp319	93	40.116
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	48.062	MGP_PahariEiJ_G0021003	Zfp628	54	48.062
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	46.094	MGP_PahariEiJ_G0021668	Zfp882	84	46.094
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	49.219	MGP_PahariEiJ_G0016960	Zbtb49	67	51.786
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	99	44.275	MGP_PahariEiJ_G0013709	-	59	42.775
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	99	44.275	MGP_PahariEiJ_G0013708	-	59	42.775
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	54.321	MGP_PahariEiJ_G0013707	Zfp768	50	53.488
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	48.819	MGP_PahariEiJ_G0017441	Zfp354a	69	48.819
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	46.739	MGP_PahariEiJ_G0019173	Zfp236	51	46.739
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	44.355	MGP_PahariEiJ_G0023460	Zfp945	76	44.355
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	48.507	MGP_PahariEiJ_G0012724	Zfp420	98	48.507
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	99	50.667	MGP_PahariEiJ_G0022533	Zfp637	71	43.590
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	46.457	MGP_PahariEiJ_G0023178	Zfp1	60	46.457
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	47.287	MGP_PahariEiJ_G0022097	Repin1	90	47.287
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	49.206	MGP_PahariEiJ_G0012839	-	54	49.206

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	100.000	ENSG00000162676	GFI1	100	86.998	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	97.778	ENSAPOG00000015189	gfi1ab	100	61.916	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	100.000	ENSAMEG00000013858	-	99	98.953	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	97.778	ENSACIG00000016354	gfi1ab	100	61.772	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	99	72.388	ENSACIG00000002180	-	99	72.388	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	95	89.844	ENSAOCG00000008339	gfi1ab	100	52.927	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	97.778	ENSAPEG00000023870	gfi1ab	100	62.850	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	97.037	ENSATEG00000009167	gfi1ab	90	57.783	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	100.000	ENSAPLG00000015700	GFI1	100	71.850	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	100.000	ENSACAG00000004498	GFI1	100	69.284	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	100.000	ENSANAG00000019656	GFI1	100	85.106	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	97.778	ENSACLG00000026458	gfi1ab	93	61.916	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	84	82.143	ENSACLG00000001258	-	91	82.143	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	96.296	ENSAMXG00000039600	gfi1ab	100	57.666	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	99	93.284	ENSAMXG00000006669	GFI1	54	93.284	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	82	82.883	ENSAMXG00000015228	-	51	82.883	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	99.259	ENSBTAG00000016723	GFI1	100	86.761	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	100.000	ENSCJAG00000017609	GFI1	100	84.161	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	100.000	ENSCAFG00000020155	GFI1	100	86.761	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	100.000	ENSCAFG00020013371	GFI1	99	79.466	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	99.259	ENSCHIG00000016135	GFI1	100	86.288	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	84	100.000	ENSCAPG00000016268	-	100	100.000	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	99.259	ENSCPOG00000011727	GFI1	100	87.470	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	100.000	ENSCCAG00000036072	GFI1	100	85.106	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	100.000	ENSCATG00000037873	GFI1	100	86.525	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	100.000	ENSCLAG00000005915	GFI1	100	82.299	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	95	100.000	ENSCSAG00000001469	GFI1	100	84.658	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	99.259	ENSCPBG00000015742	-	100	99.259	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	99	78.358	ENSCING00000011342	-	88	74.251	Ciona_intestinalis
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	79.259	ENSCSAVG00000005904	-	100	77.160	Ciona_savignyi
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	100.000	ENSCANG00000034077	GFI1	100	86.525	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	100.000	ENSCGRG00001015432	Gfi1	100	91.962	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	100.000	ENSCGRG00000013485	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	96.296	ENSCSEG00000017729	GFI1	100	57.175	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	97.778	ENSCVAG00000011828	gfi1ab	100	59.112	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	96.296	ENSCVAG00000004930	GFI1	100	59.815	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	97.778	ENSDARG00000044457	gfi1ab	100	62.150	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	100.000	ENSDNOG00000000782	GFI1	97	85.176	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	100.000	ENSDORG00000023443	-	100	100.000	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	86.667	ENSEBUG00000008075	gfi1ab	57	83.529	Eptatretus_burgeri
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	99.259	ENSEASG00005015509	GFI1	100	79.472	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	94	78.431	ENSECAG00000006647	GFI1	92	78.974	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	100.000	ENSEEUG00000000198	GFI1	100	79.433	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	99.259	ENSELUG00000003015	gfi1ab	99	62.877	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	94.815	ENSELUG00000019033	GFI1	100	57.611	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	100.000	ENSFCAG00000005914	GFI1	100	87.234	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	100.000	ENSFDAG00000019296	-	100	100.000	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	97.778	ENSFHEG00000010997	gfi1ab	100	59.441	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	96.296	ENSFHEG00000000341	GFI1	100	59.259	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	99	98.507	ENSGMOG00000007737	gfi1ab	100	61.124	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	100.000	ENSGALG00000043650	GFI1	100	71.694	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	97.778	ENSGAFG00000016637	gfi1ab	100	59.954	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	96.296	ENSGAFG00000018063	GFI1	100	60.325	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	96.296	ENSGACG00000004257	gfi1ab	97	61.882	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	99.259	ENSGAGG00000015899	GFI1	100	99.259	Gopherus_agassizii
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MGP_PahariEiJ_G0017280	Gfi1	100	97.778	ENSHBUG00000011969	gfi1ab	100	61.593	Haplochromis_burtoni
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