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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0017392 (Gene tree)
Gene ID: 110332389
Gene Symbol: Irgm1
Alias: Ifi1|Iigp3|Irgm|LRG-47
Full Name: immunity-related GTPase family M protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6282 bases
Position: chr14:17152309-17158590
Accession: 110332389
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0033109	MMR_HSR1	PF01926.23	6.7e-05	1	1
MGP_PahariEiJ_P0033108	MMR_HSR1	PF01926.23	0.00012	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0033108	-	2277	-	MGP_PahariEiJ_P0033108	409 (aa)	XP_021069255	UPI000A3089EB
MGP_PahariEiJ_T0033109	-	1201	-	MGP_PahariEiJ_P0033109	288 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	83	38.525	MGP_PahariEiJ_G0017404	-	76	48.485
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	83	38.525	MGP_PahariEiJ_G0017405	-	72	36.667
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	91	61.450	MGP_PahariEiJ_G0017523	-	93	51.444
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	95	31.175	MGP_PahariEiJ_G0017394	Ifi47	97	31.175
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	91	33.457	MGP_PahariEiJ_G0021185	Irgc1	71	31.307

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	34.568	ENSG00000124449	IRGC	76	36.842	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	72	39.720	ENSAPOG00000008330	irgf3	84	33.131	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	34.979	ENSAMEG00000004232	IRGC	80	33.197	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	83	37.805	ENSAMEG00000018904	-	89	31.948	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	94	37.050	ENSAMEG00000018886	-	93	33.000	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	85	39.286	ENSAMEG00000018526	-	90	34.383	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	41.564	ENSAMEG00000004488	-	88	36.559	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	85	38.889	ENSAMEG00000019320	-	90	34.456	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	98	58.803	ENSAMEG00000001281	-	95	52.985	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	84	35.366	ENSACIG00000023724	-	74	41.304	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	84	37.097	ENSACIG00000011491	-	76	36.156	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	85	35.200	ENSACIG00000008165	-	95	35.223	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	86	32.016	ENSACIG00000017561	-	76	30.233	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	87	35.039	ENSACIG00000014652	-	91	35.622	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	73	40.654	ENSACIG00000000621	-	81	40.654	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	71	41.379	ENSACIG00000010992	-	87	37.198	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	84	34.677	ENSAOCG00000016549	-	83	32.121	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	74	36.530	ENSAOCG00000012267	-	80	36.530	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	86	33.840	ENSAPEG00000002637	-	82	31.635	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	72	35.981	ENSATEG00000011621	-	53	35.981	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	72	36.449	ENSATEG00000011733	-	77	39.344	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	33.058	ENSATEG00000011805	-	83	34.956	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	80	32.900	ENSATEG00000011665	-	74	30.882	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	92	34.182	ENSACAG00000027084	-	79	32.113	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	31.818	ENSACAG00000027740	-	54	31.818	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	81	39.496	ENSACAG00000004461	-	75	37.171	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	93	32.029	ENSACAG00000005249	-	100	32.518	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	78	37.917	ENSACLG00000026694	-	95	37.917	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	78	39.076	ENSACLG00000026716	-	77	39.076	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	72	37.915	ENSACLG00000017700	-	75	34.657	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	76	34.545	ENSACLG00000017734	-	75	32.222	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	65	36.979	ENSACLG00000017575	-	72	35.610	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	80	33.906	ENSACLG00000008069	-	85	36.765	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	71	34.928	ENSACLG00000017785	-	80	30.769	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	57	33.333	ENSAMXG00000033649	-	62	30.542	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	80	31.476	ENSAMXG00000041738	-	90	31.476	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	76	34.783	ENSAMXG00000003353	-	66	34.082	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	65	38.220	ENSAMXG00000041276	-	57	34.052	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	91	32.035	ENSAMXG00000001283	-	89	32.035	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	81	33.195	ENSAMXG00000031909	-	87	30.154	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	65	35.450	ENSAMXG00000025169	-	50	36.126	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	76	34.375	ENSAMXG00000018938	-	72	32.342	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	76	33.937	ENSAMXG00000037767	-	76	32.584	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	67	36.946	ENSAMXG00000043797	-	84	36.585	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	87	30.469	ENSAMXG00000003370	-	96	30.469	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	61	36.667	ENSAMXG00000026039	irge4	69	31.884	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	88	37.121	ENSBTAG00000015727	IFI47	94	33.753	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	34.568	ENSBTAG00000013766	IRGC	65	32.013	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	35.391	ENSCJAG00000013464	IRGC	68	32.372	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	98	57.394	ENSCAFG00000028829	-	95	53.886	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	34.156	ENSCAFG00000004727	IRGC	76	31.683	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	91	36.194	ENSCAFG00000000498	-	88	34.946	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	84	42.742	ENSCAFG00000012657	-	87	36.745	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	86	34.771	ENSCAFG00000000502	IFGGC1	88	34.771	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	37.037	ENSCAFG00020002399	-	84	32.527	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	86	34.771	ENSCAFG00020002398	-	88	34.771	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	84	42.742	ENSCAFG00020002248	-	87	36.745	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	71	36.967	ENSCAFG00020013248	IRGC	75	31.683	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	90	59.846	ENSCAFG00020002229	-	97	55.833	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	34.568	ENSCHIG00000007797	IRGC	65	32.013	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	73	38.073	ENSCHIG00000013605	-	61	38.073	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	95	32.530	ENSCHIG00000006767	-	97	32.530	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	99	53.333	ENSCAPG00000016904	-	99	52.078	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	87	35.884	ENSCAPG00000016931	-	89	35.884	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	34.156	ENSCAPG00000012775	IRGC	66	31.683	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	34.156	ENSCPOG00000000918	IRGC	66	31.683	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	89	35.844	ENSCPOG00000034918	-	90	35.844	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	86	37.549	ENSCPOG00000023450	-	90	33.508	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	85	32.425	ENSCPOG00000037314	-	87	32.425	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	89	35.065	ENSCPOG00000037647	-	90	35.065	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	95	33.578	ENSCPOG00000034856	-	94	33.578	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	35.391	ENSCPOG00000036108	-	85	31.507	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	95	34.375	ENSCPOG00000038985	-	93	32.405	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	89	35.584	ENSCPOG00000037129	-	90	35.584	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	35.802	ENSCPOG00000039847	-	70	34.219	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	35.391	ENSCATG00000016103	IRGC	65	33.115	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	37.449	ENSCLAG00000017811	-	72	36.093	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	88	34.465	ENSCLAG00000017791	-	87	34.465	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	93	33.333	ENSCLAG00000017958	-	93	33.333	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	86	36.078	ENSCLAG00000010051	-	85	32.800	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	34.568	ENSCLAG00000017638	IRGC	65	32.013	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	39.506	ENSCLAG00000011265	-	76	37.748	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	35.391	ENSCSAG00000019621	IRGC	65	33.115	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	75	39.640	ENSCHOG00000005921	-	96	37.891	Choloepus_hoffmanni
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	83	33.333	ENSCPBG00000006148	-	65	31.613	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	34.025	ENSCPBG00000013089	-	71	32.198	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	90	32.463	ENSCPBG00000010054	-	65	32.463	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	86	33.071	ENSCPBG00000021942	-	68	30.976	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	76	38.393	ENSCPBG00000021943	-	82	33.528	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	77	37.991	ENSCPBG00000000576	-	70	35.395	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	81	37.395	ENSCPBG00000006686	-	85	31.842	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	63	41.711	ENSCPBG00000006680	-	97	41.711	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	81	37.815	ENSCPBG00000009182	-	69	36.184	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	92	32.342	ENSCPBG00000002577	-	66	32.342	Chrysemys_picta_bellii
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MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	84	59.091	MGP_SPRETEiJ_G0017229	Igtp	90	49.608	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	94	52.206	ENSMPUG00000000575	-	81	47.861	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	82	34.979	ENSMPUG00000006607	IRGC	83	34.909	Mustela_putorius_furo
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MGP_PahariEiJ_G0017392	Irgm1	86	37.915	ENSMLUG00000009743	-	86	32.013	Myotis_lucifugus
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