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Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0018079 (Gene tree)
Gene ID: 110331369
Gene Symbol: Msi2
Alias: Musashi2|msi2h
Full Name: musashi RNA binding protein 2
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 408377 bases
Position: chr14:55990276-56398652
Accession: 110331369
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0035845	RRM_1	PF00076.22	6e-34	1	2
MGP_PahariEiJ_P0035845	RRM_1	PF00076.22	6e-34	2	2
MGP_PahariEiJ_P0035846	RRM_1	PF00076.22	6.3e-34	1	2
MGP_PahariEiJ_P0035846	RRM_1	PF00076.22	6.3e-34	2	2
MGP_PahariEiJ_P0035849	RRM_1	PF00076.22	3.7e-22	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0035849	-	411	-	MGP_PahariEiJ_P0035849	113 (aa)	-	UPI00004C9D67
MGP_PahariEiJ_T0035848	-	2482	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0035845	-	6424	-	MGP_PahariEiJ_P0035845	328 (aa)	XP_021067534	UPI00000E8884
MGP_PahariEiJ_T0035847	-	1786	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0035846	-	1857	-	MGP_PahariEiJ_P0035846	346 (aa)	XP_021067533	UPI00000285CD

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	44.348	MGP_PahariEiJ_G0022127	Hnrnpa2b1	56	44.348
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	35.398	MGP_PahariEiJ_G0029153	Tardbp	76	34.351
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	36.522	MGP_PahariEiJ_G0020372	-	65	35.714
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	70	31.250	MGP_PahariEiJ_G0028496	Elavl2	72	32.632
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	52.212	MGP_PahariEiJ_G0017446	Hnrnpab	70	48.039
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	66	41.333	MGP_PahariEiJ_G0026186	Rbm38	79	40.323
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	90.323	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	99	75.191
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	61	42.857	MGP_PahariEiJ_G0031641	Rbmx	88	45.205
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	64	31.944	MGP_PahariEiJ_G0029754	-	77	31.944
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	53.097	MGP_PahariEiJ_G0017224	Hnrnpd	100	72.000
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	50	33.333	MGP_PahariEiJ_G0027387	Boll	65	32.857
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	53.982	MGP_PahariEiJ_G0017226	Hnrnpdl	78	41.634
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	84	30.208	MGP_PahariEiJ_G0028622	Elavl4	78	30.088
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	61	41.429	MGP_PahariEiJ_G0030981	Cirbp	88	43.243
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	99	41.228	MGP_PahariEiJ_G0019657	Hnrnpa0	59	41.989
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	61	42.857	MGP_PahariEiJ_G0031463	Rbm3	82	43.243
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	99	42.400	MGP_PahariEiJ_G0030987	Dazap1	98	42.857

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSG00000153944	MSI2	100	100.000	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	96.460	ENSAPOG00000001658	msi2a	100	87.805	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSAMEG00000002697	MSI2	99	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	88.182	ENSACIG00000009475	msi2a	100	74.490	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	97	88.182	ENSAOCG00000014822	msi2a	69	76.000	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	96.460	ENSAPEG00000007706	msi2a	100	87.805	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	96.460	ENSATEG00000010498	msi2a	100	87.805	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	94.118	ENSATEG00000003301	-	100	93.165	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	98.667	ENSACAG00000005452	MSI2	74	95.455	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSANAG00000037827	MSI2	100	99.695	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	96.460	ENSACLG00000007752	msi2a	100	87.500	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	98.230	ENSAMXG00000032796	msi2a	100	91.489	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	99.115	ENSAMXG00000010474	msi2b	95	96.091	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSBTAG00000004406	MSI2	97	99.674	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	70.796	WBGene00003423	msi-1	76	60.643	Caenorhabditis_elegans
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSCJAG00000013998	MSI2	100	99.695	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSCAFG00020025620	MSI2	81	98.746	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSCHIG00000016580	MSI2	100	98.780	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	94	95.390	ENSCPOG00000034042	MSI2	99	95.390	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSCCAG00000033927	MSI2	100	99.695	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSCATG00000040879	MSI2	100	98.476	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSCLAG00000014325	MSI2	100	99.711	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSCSAG00000005633	MSI2	100	99.695	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	80.000	ENSCHOG00000008660	MSI2	83	100.000	Choloepus_hoffmanni
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	98.649	ENSCPBG00000009942	MSI2	96	93.688	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	80.645	ENSCING00000018579	-	97	53.125	Ciona_intestinalis
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	65.574	ENSCSAVG00000010397	-	72	65.517	Ciona_savignyi
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSCANG00000036414	MSI2	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSCGRG00001013330	Msi2	100	99.696	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSCGRG00000003141	Msi2	100	99.693	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	92.920	ENSCSEG00000013549	msi2a	100	73.370	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	78	75.258	ENSCSEG00000013557	msi2a	83	73.711	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	92.920	ENSCSEG00000003266	-	100	79.573	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	96.460	ENSCVAG00000017075	msi2a	100	87.179	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	94.690	ENSDARG00000033901	msi2a	100	79.381	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	98.230	ENSDARG00000032614	msi2b	100	98.020	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSDNOG00000014501	MSI2	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	78	88.832	ENSDORG00000005394	Msi2	84	87.817	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSDORG00000028440	-	100	100.000	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	99	86.667	FBgn0260943	Rbp6	88	68.750	Drosophila_melanogaster
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSETEG00000012450	-	64	76.316	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	89	90.099	ENSEBUG00000006732	msi2a	87	68.489	Eptatretus_burgeri
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSEASG00005002965	MSI2	97	89.143	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSECAG00000011435	MSI2	100	97.175	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	82	85.375	ENSEEUG00000007810	MSI2	100	85.375	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	98.230	ENSELUG00000011747	msi2a	100	89.024	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	97.345	ENSELUG00000001361	msi2b	100	87.143	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSFCAG00000041686	MSI2	100	99.695	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	96	87.156	ENSFCAG00000033787	-	82	79.487	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSFDAG00000016118	MSI2	100	100.000	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	96.460	ENSFHEG00000000084	msi2a	96	92.763	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	73	96.341	ENSGMOG00000007596	-	100	92.308	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	98.230	ENSGALG00000005567	MSI2	100	96.243	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	96.460	ENSGAFG00000006974	msi2a	90	93.377	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	98.947	ENSGAGG00000016542	MSI2	100	96.053	Gopherus_agassizii
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSGGOG00000013182	MSI2	100	100.000	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	96.460	ENSHBUG00000020800	msi2a	100	87.500	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	90.751	ENSHGLG00000012444	MSI2	100	90.751	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSHGLG00100004028	-	87	100.000	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	76	100.000	ENSHGLG00100003744	MSI2	100	100.000	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	95.575	ENSHCOG00000000266	msi2a	97	84.795	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	86.275	ENSHCOG00000017241	-	77	81.557	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	99.115	ENSIPUG00000003732	msi2b	92	94.286	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	96.460	ENSIPUG00000021097	msi2a	100	86.890	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	94	95.390	ENSSTOG00000007884	MSI2	99	95.390	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSJJAG00000009467	-	100	100.000	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	76	88.889	ENSJJAG00000006292	-	100	88.406	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	95.575	ENSKMAG00000009494	msi2a	96	91.401	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	83.529	ENSLBEG00000026223	-	100	68.915	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	96.460	ENSLBEG00000007061	msi2a	100	87.805	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	73	96.386	ENSLACG00000016798	MSI2	98	92.308	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	98.230	ENSLOCG00000004675	msi2b	100	83.740	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSMFAG00000003775	MSI2	100	100.000	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSMMUG00000002069	MSI2	100	100.000	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSMNEG00000045275	MSI2	100	99.695	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSMLEG00000033888	MSI2	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	96.460	ENSMAMG00000010503	msi2a	100	86.280	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	95.575	ENSMAMG00000002488	-	99	92.053	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	96.460	ENSMZEG00005007676	msi2a	100	92.073	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSMAUG00000003862	Msi2	100	99.712	Mesocricetus_auratus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSMICG00000013598	-	100	99.695	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	86.726	ENSMICG00000032913	-	100	79.279	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	ENSMOCG00000005820	Msi2	100	100.000	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	94.690	ENSMMOG00000008348	msi2a	91	84.858	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	76	98.551	ENSMODG00000014790	MSI2	100	98.551	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	96.460	ENSMALG00000000071	msi2a	100	92.810	Monopterus_albus
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