EuRBPDB

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0018296 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2331 bases
Position: chr14:67785707-67788037
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0036560	SUI1	PF01253.22	6.3e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0036560	-	1248	-	MGP_PahariEiJ_P0036560	74 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSG00000173812	EIF1	58	100.000	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSAMEG00000005620	EIF1	58	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSACAG00000004404	EIF1	58	100.000	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSANAG00000030349	-	58	100.000	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	96.923	ENSANAG00000009519	-	58	96.923	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSBTAG00000002282	EIF1	58	100.000	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSCJAG00000045145	EIF1	54	100.000	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSCJAG00000048324	-	58	100.000	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	96.923	ENSCJAG00000043915	-	58	96.923	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSCAFG00000029584	EIF1	58	100.000	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	96.923	ENSCAFG00020010057	-	58	96.923	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSCHIG00000019997	EIF1	58	100.000	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	100	49.524	ENSCHIG00000016461	-	92	50.000	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	96.923	ENSCHIG00000002412	-	69	96.923	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSTSYG00000031918	EIF1	58	100.000	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	74	100.000	ENSCAPG00000016457	-	52	100.000	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSCPOG00000030441	EIF1	58	100.000	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSCCAG00000031875	-	58	100.000	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	98.462	ENSCCAG00000036527	-	56	98.462	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	98.462	ENSCCAG00000033872	-	60	98.462	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSCATG00000040397	EIF1	58	100.000	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	73	100.000	ENSCLAG00000015732	-	53	100.000	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSCSAG00000003007	EIF1	84	100.000	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	96.923	ENSCHOG00000008378	EIF1	58	96.923	Choloepus_hoffmanni
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	73	98.148	ENSCPBG00000000955	-	50	98.148	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSCANG00000029454	EIF1	58	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	100	55.340	ENSCANG00000038094	-	53	74.545	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	92.308	ENSCGRG00001015256	-	56	92.308	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	96.923	ENSCGRG00001013652	-	58	96.923	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSCGRG00001015513	-	58	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSCGRG00000011772	Eif1	58	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	92.308	ENSCGRG00000014683	-	56	92.308	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	78	89.655	ENSCGRG00000017258	-	50	89.091	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	74	87.273	ENSDNOG00000039878	-	52	87.273	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	98.462	ENSDORG00000026546	-	57	98.462	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	96.923	ENSDORG00000024507	-	58	96.923	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	100	81.081	ENSDORG00000013853	-	100	81.081	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSETEG00000001139	-	58	100.000	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	98.462	ENSETEG00000020190	-	58	98.462	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	90.769	ENSETEG00000015794	-	51	90.909	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	74	78.182	ENSETEG00000013846	-	51	78.182	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	96.923	ENSETEG00000011843	-	66	96.923	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSEASG00005006665	EIF1	55	100.000	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSECAG00000012516	EIF1	55	100.000	Equus_caballus
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MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	98.462	ENSEEUG00000013544	-	58	98.462	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	74	89.091	ENSELUG00000015327	eif1b	50	89.091	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSFCAG00000038592	EIF1	58	100.000	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	98.462	ENSFCAG00000024474	-	58	98.462	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	74	100.000	ENSFALG00000000314	EIF1	50	100.000	Ficedula_albicollis
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	99	52.885	ENSFDAG00000020716	-	51	83.636	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSFDAG00000019401	EIF1	58	100.000	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	68	90.000	ENSFDAG00000021273	-	52	90.000	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	96.923	ENSGALG00000028517	EIF1	58	96.923	Gallus_gallus
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MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSGGOG00000027201	EIF1	58	100.000	Gorilla_gorilla
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MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSHGLG00000014274	EIF1	58	100.000	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	89	95.455	ENSHGLG00000008530	-	61	95.455	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSHGLG00100007143	EIF1	58	100.000	Heterocephalus_glaber_male
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MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	84.615	ENSSTOG00000033225	-	50	94.000	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSSTOG00000002719	EIF1	58	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
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MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSMFAG00000046072	-	55	100.000	Macaca_fascicularis
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MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSMMUG00000049151	-	62	100.000	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSMNEG00000003695	EIF1	58	100.000	Macaca_nemestrina
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MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSMLEG00000033362	EIF1	58	100.000	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	89	96.970	ENSMAUG00000003832	-	55	96.970	Mesocricetus_auratus
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MGP_PahariEiJ_G0018296	-	100	70.707	ENSMOCG00000018385	-	100	70.707	Microtus_ochrogaster
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MGP_PahariEiJ_G0018296	-	72	75.472	ENSMODG00000007258	-	55	75.472	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	100	81.013	ENSMALG00000014918	eif1b	100	81.013	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSMUSG00000035530	Eif1	58	100.000	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSMPUG00000010883	EIF1	58	100.000	Mustela_putorius_furo
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MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSMLUG00000006765	-	58	100.000	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSMLUG00000012308	-	58	100.000	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSMLUG00000005077	-	58	100.000	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSNGAG00000018937	Eif1	58	100.000	Nannospalax_galili
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	100	52.427	ENSNLEG00000035467	-	52	74.545	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSNLEG00000011013	EIF1	58	100.000	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSMEUG00000015360	EIF1	58	100.000	Notamacropus_eugenii
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSOPRG00000012200	EIF1	66	100.000	Ochotona_princeps
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSODEG00000018101	EIF1	58	100.000	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	100	82.278	ENSORLG00000022530	eif1b	100	82.278	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSOGAG00000031577	EIF1	58	100.000	Otolemur_garnettii
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSOARG00000017410	EIF1	58	100.000	Ovis_aries
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	100	58.000	ENSPPAG00000043888	-	93	64.000	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSPPAG00000035240	EIF1	58	100.000	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	98.462	ENSPPAG00000028300	-	55	98.462	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSPPRG00000006944	EIF1	58	100.000	Panthera_pardus
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	100	57.000	ENSPTRG00000043418	-	54	88.889	Pan_troglodytes
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	98.462	ENSPTRG00000040263	-	55	98.462	Pan_troglodytes
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSPTRG00000009175	EIF1	58	100.000	Pan_troglodytes
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSPANG00000021513	EIF1	58	100.000	Papio_anubis
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	74	78.182	ENSPANG00000031322	-	53	78.182	Papio_anubis
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	80	89.831	ENSPKIG00000023074	eif1b	53	89.831	Paramormyrops_kingsleyae
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MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	98.462	ENSPCAG00000016637	-	58	98.462	Procavia_capensis
MGP_PahariEiJ_G0018296	-	88	100.000	ENSPCAG00000014171	-	59	100.000	Procavia_capensis
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