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Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0018393 (Gene tree)
Gene ID: 110331058
Gene Symbol: Eftud2
Alias: 116kDa|Snrp116|U5-116kD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 42864 bases
Position: chr14:70283916-70326779
Accession: 110331058
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0037032	GTP_EFTU	PF00009.27	5.7e-45	1	1
MGP_PahariEiJ_P0037033	GTP_EFTU	PF00009.27	5.7e-45	1	1
MGP_PahariEiJ_P0037035	GTP_EFTU	PF00009.27	2.1e-37	1	1
MGP_PahariEiJ_P0037035	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.6e-12	1	1
MGP_PahariEiJ_P0037032	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.6e-12	1	1
MGP_PahariEiJ_P0037033	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.6e-12	1	1
MGP_PahariEiJ_P0037035	EFG_IV	PF03764.18	4e-23	1	1
MGP_PahariEiJ_P0037032	EFG_IV	PF03764.18	4.1e-23	1	1
MGP_PahariEiJ_P0037033	EFG_IV	PF03764.18	4.1e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0037043	-	578	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0037042	-	3135	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0037041	-	1365	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0037040	-	679	-	MGP_PahariEiJ_P0037040	30 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0037044	-	790	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0037036	-	567	-	MGP_PahariEiJ_P0037036	84 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0037037	-	605	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0037034	-	394	-	MGP_PahariEiJ_P0037034	96 (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0037035	-	2889	-	MGP_PahariEiJ_P0037035	962 (aa)	XP_021067060	UPI00021CF4FE
MGP_PahariEiJ_T0037032	-	3323	-	MGP_PahariEiJ_P0037032	972 (aa)	-	UPI0000021A7B
MGP_PahariEiJ_T0037033	-	3341	XM_021211400	MGP_PahariEiJ_P0037033	972 (aa)	XP_021067059	UPI0000021A7B
MGP_PahariEiJ_T0037038	-	934	-	-	- (aa)	-	-
MGP_PahariEiJ_T0037039	-	603	-	-	- (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	90	48.052	MGP_PahariEiJ_G0031035	Eef2	99	39.175

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.383	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	92.078	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	91.975	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.280	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	88.580	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.477	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	87	88.235	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.235	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	92.181	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	92.078	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	92.490	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.387	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	99	93.821	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	93.821	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	97.119	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.119	Anolis_carolinensis
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.280	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	92.078	ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.975	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.607	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.505	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.383	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.383	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	99	70.248	WBGene00001166	eftu-2	99	69.835	Caenorhabditis_elegans
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.280	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.280	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.280	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.383	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.383	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.074	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.074	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	98.868	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	98.868	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	98.868	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.868	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	99.280	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.280	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	98.765	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.765	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.280	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	91	86.712	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.712	Choloepus_hoffmanni
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	97.942	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	97.942	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	77.812	ENSCING00000009372	-	100	77.744	Ciona_intestinalis
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	99	77.800	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	99.280	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.794	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.794	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.794	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.794	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.461	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.358	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	92.078	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.284	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.059	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.059	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	98.663	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	98.663	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.280	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	75.385	FBgn0039566	CG4849	100	74.769	Drosophila_melanogaster
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	92	79.487	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.280	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.177	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.177	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	90.741	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.177	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.177	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	97.531	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.531	Ficedula_albicollis
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.486	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.486	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	92.181	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.387	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	90.844	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.667	Gadus_morhua
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	97.428	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.276	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.975	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	92.181	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.358	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	99.280	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.975	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.872	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.074	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	99.074	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.074	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	99.074	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	90.535	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.535	Hippocampus_comes
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.667	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.872	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	93.519	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.416	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	96	99.573	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.573	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.564	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.667	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	95	91.154	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.588	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	93.724	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.245	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	92.181	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.181	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.177	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.177	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	99.280	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	99.280	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	99.280	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	92.490	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.387	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	92.078	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	91.975	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	97.433	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.433	Meleagris_gallopavo
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.588	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.588	Mesocricetus_auratus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	99.280	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.691	ENSMOCG00000009039	-	100	99.691	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	92	81.798	ENSMOCG00000017653	-	90	82.159	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	87	94.000	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	94.000	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	98.971	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	98.971	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	87	92.235	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.235	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	100.000	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	100.000	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	100.000	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	100.000	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	97	99.258	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.258	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.280	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.280	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.588	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.588	Nannospalax_galili
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.975	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.872	Neolamprologus_brichardi
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	97	97.450	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.450	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	95.267	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.267	Notamacropus_eugenii
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.049	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.049	Ochotona_princeps
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	98.765	ENSODEG00000018041	-	100	98.765	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	93	79.598	ENSODEG00000003385	-	100	79.598	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	92.078	ENSONIG00000000912	eftud2	100	91.975	Oreochromis_niloticus
MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.486	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.486	Oryctolagus_cuniculus
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