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PPI

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Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0019193 (Gene tree)
Gene ID: 110334060
Gene Symbol: Rpp38
Alias: C330006A15Rik
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p38
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3695 bases
Position: chr16:365620-369314
Accession: 110334060
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0039887	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	1.2e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0039887	-	1041	XM_021215904	MGP_PahariEiJ_P0039887	280 (aa)	XP_021071563	UPI000A31144F

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	76.842	ENSG00000152464	RPP38	100	76.842	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	44.649	ENSAPOG00000001240	rpp38	96	45.091	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	72.887	ENSAMEG00000018832	RPP38	100	73.333	Ailuropoda_melanoleuca
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	88	45.211	ENSACIG00000011592	rpp38	92	44.906	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	44.876	ENSAOCG00000017293	rpp38	99	45.238	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	46.667	ENSAPEG00000002315	rpp38	99	46.975	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	96	45.230	ENSATEG00000000731	rpp38	98	46.182	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	91	47.674	ENSAPLG00000002054	RPP38	96	48.519	Anas_platyrhynchos
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	43.015	ENSACLG00000016958	rpp38	97	43.321	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	43.015	ENSACLG00000016962	rpp38	97	43.321	Astatotilapia_calliptera
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	89	41.732	ENSAMXG00000025023	rpp38	94	43.657	Astyanax_mexicanus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	69.825	ENSBTAG00000007702	RPP38	100	69.825	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	72.887	ENSCAFG00000024373	RPP38	100	73.333	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	72.887	ENSCAFG00020008008	RPP38	100	73.333	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	69.123	ENSCHIG00000012484	RPP38	100	69.123	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	73.333	ENSCPOG00000003981	RPP38	100	73.333	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	77.193	ENSCLAG00000010194	RPP38	100	77.193	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	77.444	ENSCSAG00000019055	RPP38	100	77.113	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	78.246	ENSCHOG00000004335	RPP38	100	78.246	Choloepus_hoffmanni
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	83.986	ENSCGRG00001001395	Rpp38	100	85.053	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	83.986	ENSCGRG00000017441	Rpp38	100	85.053	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	43.165	ENSCSEG00000001721	rpp38	99	42.199	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	95	44.765	ENSCVAG00000001676	rpp38	97	44.128	Cyprinodon_variegatus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	90	44.906	ENSDARG00000040350	rpp38	95	44.118	Danio_rerio
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	75.000	ENSDNOG00000040314	RPP38	100	75.000	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	67.972	ENSDORG00000009783	Rpp38	100	67.972	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	71.731	ENSETEG00000002839	RPP38	100	71.731	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	99	73.050	ENSEASG00005019783	RPP38	98	73.050	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	99	69.611	ENSEEUG00000014677	RPP38	99	69.611	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	88	43.015	ENSELUG00000010160	rpp38	94	43.617	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	70.423	ENSFCAG00000022449	RPP38	100	70.423	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	91	51.362	ENSFALG00000014804	RPP38	93	52.045	Ficedula_albicollis
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	75.789	ENSFDAG00000018669	RPP38	100	75.789	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	95	42.908	ENSFHEG00000013741	rpp38	97	43.007	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	91	48.263	ENSGALG00000008794	RPP38	91	48.889	Gallus_gallus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	57	48.428	ENSGACG00000009258	rpp38	97	47.059	Gasterosteus_aculeatus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	43.382	ENSHBUG00000010937	rpp38	97	44.043	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	74.386	ENSHGLG00000012144	RPP38	100	74.386	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	88	43.089	ENSIPUG00000022879	rpp38	95	42.642	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	73.684	ENSSTOG00000025699	RPP38	98	73.684	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	81.053	ENSJJAG00000007523	Rpp38	100	80.351	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	88	43.939	ENSKMAG00000003986	rpp38	89	44.151	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	96	45.936	ENSLBEG00000006853	rpp38	98	45.230	Labrus_bergylta
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	95	52.143	ENSLACG00000006502	RPP38	100	52.203	Latimeria_chalumnae
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	93	46.992	ENSLOCG00000018347	rpp38	93	47.368	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	75.352	ENSLAFG00000000509	RPP38	100	75.352	Loxodonta_africana
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	78.571	ENSMMUG00000007679	RPP38	100	78.169	Macaca_mulatta
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	96	44.643	ENSMAMG00000012774	rpp38	96	44.526	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	43.382	ENSMZEG00005003189	rpp38	97	44.043	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	43.015	ENSMZEG00005003200	rpp38	97	43.321	Maylandia_zebra
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	91	47.308	ENSMGAG00000008217	RPP38	91	48.148	Meleagris_gallopavo
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	84.698	ENSMAUG00000003644	Rpp38	100	84.698	Mesocricetus_auratus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	86.525	ENSMOCG00000007020	Rpp38	100	85.816	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	42.182	ENSMMOG00000003446	rpp38	96	42.545	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	95	63.333	ENSMODG00000024091	RPP38	100	63.028	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	91	41.758	ENSMALG00000002356	rpp38	93	41.758	Monopterus_albus
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MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	95.357	ENSMUSG00000049950	Rpp38	100	95.357	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	95.357	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	95.357	Mus_spretus
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MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	76.404	ENSMLUG00000002153	RPP38	100	76.056	Myotis_lucifugus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	79.298	ENSNGAG00000011066	Rpp38	100	79.298	Nannospalax_galili
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	42.857	ENSNBRG00000006994	rpp38	98	43.066	Neolamprologus_brichardi
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	43.956	ENSONIG00000020467	rpp38	96	44.161	Oreochromis_niloticus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	71.429	ENSOCUG00000024367	-	100	71.831	Oryctolagus_cuniculus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	71.429	ENSOCUG00000022768	-	100	71.831	Oryctolagus_cuniculus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	90	42.912	ENSORLG00000009219	rpp38	96	43.590	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	88	42.636	ENSORLG00020011503	rpp38	90	43.446	Oryzias_latipes_hni
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	93	42.007	ENSORLG00015017702	rpp38	94	43.772	Oryzias_latipes_hsok
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	88	47.266	ENSOMEG00000005414	rpp38	99	46.341	Oryzias_melastigma
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	76.408	ENSOGAG00000008059	RPP38	100	76.408	Otolemur_garnettii
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	69.825	ENSOARG00000004534	RPP38	100	69.825	Ovis_aries
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	76.842	ENSPPAG00000041577	RPP38	91	76.842	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	70.775	ENSPPRG00000015329	RPP38	100	70.775	Panthera_pardus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	70.775	ENSPTIG00000007188	RPP38	100	70.775	Panthera_tigris_altaica
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	76.842	ENSPTRG00000002318	RPP38	91	76.842	Pan_troglodytes
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	43.728	ENSPKIG00000025652	rpp38	95	43.369	Paramormyrops_kingsleyae
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	96	53.650	ENSPSIG00000001527	RPP38	97	53.650	Pelodiscus_sinensis
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	87.189	ENSPEMG00000008375	Rpp38	100	87.900	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	66.078	ENSPCIG00000009096	RPP38	94	66.078	Phascolarctos_cinereus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	62	47.802	ENSPFOG00000016823	rpp38	82	47.802	Poecilia_formosa
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	89	42.146	ENSPLAG00000007626	rpp38	91	42.586	Poecilia_latipinna
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	88	38.735	ENSPMEG00000020392	rpp38	93	39.245	Poecilia_mexicana
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	89	41.762	ENSPREG00000017744	rpp38	93	41.825	Poecilia_reticulata
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	77.544	ENSPPYG00000002113	RPP38	100	77.544	Pongo_abelii
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	74.906	ENSPVAG00000007155	RPP38	100	75.088	Pteropus_vampyrus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	43.382	ENSPNYG00000004293	rpp38	97	44.043	Pundamilia_nyererei
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	88	43.600	ENSPNAG00000010633	rpp38	100	43.310	Pygocentrus_nattereri
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	98	86.182	ENSRNOG00000038025	Rpp38	99	86.182	Rattus_norvegicus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	65.724	ENSSHAG00000015529	RPP38	100	66.316	Sarcophilus_harrisii
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	44.245	ENSSMAG00000018276	rpp38	95	43.796	Scophthalmus_maximus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	45.055	ENSSDUG00000001651	rpp38	98	45.683	Seriola_dumerili
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	46.886	ENSSLDG00000014355	rpp38	98	46.763	Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	53.929	ENSSARG00000012099	RPP38	100	53.929	Sorex_araneus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	99	54.255	ENSSPUG00000018363	-	99	54.255	Sphenodon_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	97	50.725	ENSSPUG00000008560	-	99	50.725	Sphenodon_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	54.930	ENSSPUG00000005237	-	100	54.930	Sphenodon_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	94	43.223	ENSSPAG00000020387	rpp38	99	42.199	Stegastes_partitus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	68.403	ENSSSCG00000027110	RPP38	100	68.403	Sus_scrofa
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	91	49.027	ENSTGUG00000001366	RPP38	96	49.814	Taeniopygia_guttata
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	95	43.262	ENSTNIG00000001334	rpp38	97	42.908	Tetraodon_nigroviridis
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	69.825	ENSTTRG00000004420	RPP38	100	69.825	Tursiops_truncatus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	73.592	ENSUAMG00000002618	RPP38	100	74.035	Ursus_americanus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	72.727	ENSUMAG00000012382	RPP38	100	73.776	Ursus_maritimus
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	71.831	ENSVVUG00000005272	RPP38	100	72.281	Vulpes_vulpes
MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	92	45.324	ENSXETG00000003419	rpp38	97	45.296	Xenopus_tropicalis