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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: MGP_PahariEiJ_G0019905 (Gene tree)
Gene ID: 110334733
Gene Symbol: Zc3h3
Alias: Smicl
Full Name: zinc finger CCCH-type containing 3
Gene Type: protein_coding
Species: Mus_pahari
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 86977 bases
Position: chr17:40785388-40872364
Accession: 110334733
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
MGP_PahariEiJ_P0041896	zf-CCCH	PF00642.24	3.8e-18	1	2
MGP_PahariEiJ_P0041896	zf-CCCH	PF00642.24	3.8e-18	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
MGP_PahariEiJ_T0041896	-	3366	XM_021216602	MGP_PahariEiJ_P0041896	956 (aa)	XP_021072261	UPI000A30F261

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	70.417	ENSG00000014164	ZC3H3	100	69.688	Homo_sapiens
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	62	42.301	ENSAPOG00000011522	zc3h3	64	42.301	Acanthochromis_polyacanthus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	54	43.340	ENSACIG00000005563	zc3h3	95	35.342	Amphilophus_citrinellus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	65	42.105	ENSAOCG00000013763	zc3h3	71	42.207	Amphiprion_ocellaris
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	63	42.153	ENSAPEG00000020037	zc3h3	63	42.259	Amphiprion_percula
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	85	33.929	ENSATEG00000003718	zc3h3	71	42.509	Anabas_testudineus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	70.833	ENSANAG00000018742	ZC3H3	100	71.250	Aotus_nancymaae
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	90	67.577	ENSBTAG00000021472	ZC3H3	99	67.577	Bos_taurus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	70.104	ENSCJAG00000021439	ZC3H3	100	70.729	Callithrix_jacchus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	87	68.296	ENSCAFG00000001299	ZC3H3	100	67.491	Canis_familiaris
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	99	66.770	ENSCAFG00020018654	ZC3H3	100	67.883	Canis_lupus_dingo
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	65.904	ENSCHIG00000018027	ZC3H3	100	66.424	Capra_hircus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	71.875	ENSTSYG00000034906	ZC3H3	100	71.667	Carlito_syrichta
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	97	64.492	ENSCAPG00000013918	ZC3H3	100	66.094	Cavia_aperea
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	70.907	ENSCPOG00000006248	ZC3H3	99	70.803	Cavia_porcellus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	71.042	ENSCCAG00000035267	ZC3H3	100	71.042	Cebus_capucinus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	70.521	ENSCATG00000020900	ZC3H3	100	70.104	Cercocebus_atys
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	70.417	ENSCLAG00000009999	ZC3H3	99	70.104	Chinchilla_lanigera
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	69.792	ENSCSAG00000009074	ZC3H3	99	69.688	Chlorocebus_sabaeus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	44.250	ENSCPBG00000019050	ZC3H3	89	47.712	Chrysemys_picta_bellii
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	68.229	ENSCANG00000032420	ZC3H3	100	68.333	Colobus_angolensis_palliatus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	85.908	ENSCGRG00001016268	Zc3h3	100	85.386	Cricetulus_griseus_chok1gshd
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	85.908	ENSCGRG00000012889	Zc3h3	100	85.386	Cricetulus_griseus_crigri
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	64	38.154	ENSCSEG00000002583	zc3h3	77	38.473	Cynoglossus_semilaevis
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	57.895	ENSDNOG00000031054	ZC3H3	96	63.499	Dasypus_novemcinctus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	98	66.243	ENSDORG00000023832	Zc3h3	100	67.304	Dipodomys_ordii
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	71	53.524	ENSETEG00000014836	-	63	72.414	Echinops_telfairi
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	68.827	ENSEASG00005009621	ZC3H3	99	69.215	Equus_asinus_asinus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	80	71.281	ENSECAG00000012556	ZC3H3	86	71.281	Equus_caballus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	92	60.158	ENSEEUG00000007986	ZC3H3	82	60.158	Erinaceus_europaeus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	53	43.727	ENSELUG00000024269	zc3h3	58	43.273	Esox_lucius
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	69.502	ENSFCAG00000013238	ZC3H3	100	69.335	Felis_catus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	68	58.955	ENSFALG00000009538	ZC3H3	86	47.148	Ficedula_albicollis
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	69.854	ENSFDAG00000017737	ZC3H3	99	69.231	Fukomys_damarensis
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	70	41.736	ENSFHEG00000017714	zc3h3	63	44.129	Fundulus_heteroclitus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	92	34.829	ENSGAFG00000014360	zc3h3	91	35.871	Gambusia_affinis
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	99	69.497	ENSGGOG00000002833	ZC3H3	100	69.597	Gorilla_gorilla
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	62	43.678	ENSHBUG00000004627	zc3h3	65	43.678	Haplochromis_burtoni
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	70.803	ENSHGLG00000011234	ZC3H3	99	70.803	Heterocephalus_glaber_female
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	91	68.290	ENSHGLG00100006782	ZC3H3	97	68.290	Heterocephalus_glaber_male
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	83	33.409	ENSIPUG00000006438	zc3h3	91	33.409	Ictalurus_punctatus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	71.340	ENSSTOG00000004358	ZC3H3	99	71.132	Ictidomys_tridecemlineatus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	74.324	ENSJJAG00000023757	Zc3h3	100	73.701	Jaculus_jaculus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	70	44.444	ENSKMAG00000017876	zc3h3	91	45.420	Kryptolebias_marmoratus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	77	41.667	ENSLOCG00000008621	ZC3H3	60	43.321	Lepisosteus_oculatus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	70.208	ENSMFAG00000036060	ZC3H3	100	70.104	Macaca_fascicularis
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	70.000	ENSMNEG00000029433	ZC3H3	99	69.896	Macaca_nemestrina
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	70.000	ENSMLEG00000038139	ZC3H3	100	69.896	Mandrillus_leucophaeus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	53	43.100	ENSMAMG00000014787	zc3h3	53	43.856	Mastacembelus_armatus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	85.789	ENSMAUG00000011009	Zc3h3	100	85.266	Mesocricetus_auratus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	71.710	ENSMICG00000001100	ZC3H3	100	70.312	Microcebus_murinus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	84.744	ENSMOCG00000000733	Zc3h3	100	84.222	Microtus_ochrogaster
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	69	39.024	ENSMMOG00000016823	zc3h3	65	40.520	Mola_mola
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	85	59.518	ENSMODG00000011385	ZC3H3	94	58.235	Monodelphis_domestica
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	53	44.944	ENSMALG00000014610	zc3h3	52	44.944	Monopterus_albus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	93.828	MGP_CAROLIEiJ_G0019897	Zc3h3	100	93.724	Mus_caroli
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	94.990	ENSMUSG00000075600	Zc3h3	100	94.676	Mus_musculus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	95.720	MGP_SPRETEiJ_G0020797	Zc3h3	100	95.720	Mus_spretus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	90	68.397	ENSMPUG00000008357	ZC3H3	97	68.182	Mustela_putorius_furo
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	80.083	ENSNGAG00000008574	Zc3h3	100	79.458	Nannospalax_galili
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	53	42.086	ENSNBRG00000005454	zc3h3	87	35.689	Neolamprologus_brichardi
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	67.290	ENSNLEG00000001681	ZC3H3	100	67.186	Nomascus_leucogenys
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	83	58.200	ENSMEUG00000008554	ZC3H3	86	57.901	Notamacropus_eugenii
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	68.769	ENSODEG00000014239	ZC3H3	100	68.383	Octodon_degus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	94	47.334	ENSOANG00000003534	-	91	50.726	Ornithorhynchus_anatinus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	53	43.667	ENSORLG00000026930	zc3h3	92	36.279	Oryzias_latipes
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	53	43.810	ENSORLG00020002734	zc3h3	92	36.713	Oryzias_latipes_hni
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	55	42.182	ENSORLG00015001257	zc3h3	94	36.244	Oryzias_latipes_hsok
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	69.159	ENSOGAG00000014907	ZC3H3	100	68.983	Otolemur_garnettii
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	64.706	ENSOARG00000000808	ZC3H3	100	65.468	Ovis_aries
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	70.417	ENSPPAG00000035455	ZC3H3	87	70.417	Pan_paniscus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	69.335	ENSPPRG00000011707	ZC3H3	100	69.335	Panthera_pardus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	70.417	ENSPTRG00000020655	ZC3H3	100	70.417	Pan_troglodytes
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	70.000	ENSPANG00000016578	ZC3H3	100	69.688	Papio_anubis
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	85.580	ENSPEMG00000013893	Zc3h3	100	85.057	Peromyscus_maniculatus_bairdii
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	72	40.500	ENSPFOG00000023405	zc3h3	66	43.315	Poecilia_formosa
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	72	40.333	ENSPLAG00000001686	zc3h3	66	43.126	Poecilia_latipinna
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	72	40.833	ENSPMEG00000002341	zc3h3	66	43.019	Poecilia_mexicana
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	72	41.459	ENSPREG00000008923	zc3h3	66	43.421	Poecilia_reticulata
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	70.000	ENSPPYG00000018935	ZC3H3	99	69.792	Pongo_abelii
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	71.979	ENSPCOG00000028174	ZC3H3	100	72.292	Propithecus_coquereli
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	88	69.018	ENSPVAG00000005979	ZC3H3	88	70.859	Pteropus_vampyrus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	62	43.678	ENSPNYG00000023105	zc3h3	65	43.678	Pundamilia_nyererei
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	56	40.690	ENSPNAG00000009850	zc3h3	95	32.008	Pygocentrus_nattereri
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	69.375	ENSRBIG00000039855	ZC3H3	100	69.479	Rhinopithecus_bieti
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	69.271	ENSRROG00000040493	ZC3H3	100	69.375	Rhinopithecus_roxellana
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	69.688	ENSSBOG00000021819	ZC3H3	100	70.417	Saimiri_boliviensis_boliviensis
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	54	45.167	ENSSDUG00000021871	zc3h3	53	44.981	Seriola_dumerili
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	62	44.796	ENSSLDG00000016166	zc3h3	62	44.610	Seriola_lalandi_dorsalis
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	61	43.396	ENSSPAG00000008518	zc3h3	62	43.371	Stegastes_partitus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	100	64.663	ENSSSCG00000006956	ZC3H3	99	64.576	Sus_scrofa
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	65	58.560	ENSTBEG00000009096	-	74	58.560	Tupaia_belangeri
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	90	70.081	ENSUAMG00000012919	ZC3H3	98	70.690	Ursus_americanus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	99	66.843	ENSVVUG00000022609	ZC3H3	98	68.004	Vulpes_vulpes
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	63	49.809	ENSXETG00000004937	zc3h3	72	49.809	Xenopus_tropicalis
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	54	41.101	ENSXCOG00000005025	zc3h3	66	41.575	Xiphophorus_couchianus
MGP_PahariEiJ_G0019905	Zc3h3	64	43.667	ENSXMAG00000006422	zc3h3	66	43.667	Xiphophorus_maculatus